177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0327 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0327  hypothetical protein  100 
 
 
190 aa  368  1e-101  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1157  hypothetical protein  39.78 
 
 
192 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000108127  hitchhiker  0.0070658 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0857  hypothetical protein  42.54 
 
 
192 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000443477  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1386  hypothetical protein  36 
 
 
185 aa  97.1  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4337  hypothetical protein  33.92 
 
 
188 aa  96.7  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1610  hypothetical protein  35.43 
 
 
185 aa  94.7  7e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4890  hypothetical protein  34.29 
 
 
196 aa  94.7  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.716617  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0148  hypothetical protein  32.04 
 
 
188 aa  91.7  7e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0488  hypothetical protein  35.43 
 
 
205 aa  90.5  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3484  protein of unknown function UPF0016  31.21 
 
 
192 aa  90.1  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0516  protein of unknown function UPF0016  36 
 
 
187 aa  89.7  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.113311  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1174  hypothetical protein  36.42 
 
 
196 aa  89.7  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0854638  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6045  hypothetical protein  33.52 
 
 
204 aa  89.4  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.696957  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0577  hypothetical protein  34.86 
 
 
193 aa  89.4  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.188553  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4126  hypothetical protein  31.21 
 
 
192 aa  89.4  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0520  hypothetical protein  33.53 
 
 
187 aa  89  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4779  hypothetical protein  33.14 
 
 
192 aa  88.6  6e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4103  hypothetical protein  31.84 
 
 
188 aa  87.8  8e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.217068 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2378  hypothetical protein  32 
 
 
234 aa  87.4  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.674197 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2409  hypothetical protein  31.46 
 
 
183 aa  87  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.936736  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3536  protein of unknown function UPF0016  33.14 
 
 
191 aa  86.3  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57198  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1609  hypothetical protein  32.16 
 
 
190 aa  87  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2248  hypothetical protein  32.37 
 
 
203 aa  86.3  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.35774  normal  0.686727 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0892  hypothetical protein  32 
 
 
218 aa  85.9  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209746  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0575  hypothetical protein  32.97 
 
 
184 aa  85.9  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0880  hypothetical protein  32 
 
 
218 aa  85.9  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1017  hypothetical protein  32.57 
 
 
218 aa  85.9  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0533  hypothetical protein  33.33 
 
 
187 aa  86.3  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.559116  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0464  hypothetical protein  31.82 
 
 
190 aa  85.5  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00884521  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3026  hypothetical protein  31.82 
 
 
190 aa  85.5  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.754775  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0976  hypothetical protein  32.39 
 
 
190 aa  85.9  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0349597 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0538  hypothetical protein  32.39 
 
 
190 aa  85.5  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2611  hypothetical protein  31.82 
 
 
190 aa  85.5  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0983  hypothetical protein  31.82 
 
 
190 aa  85.5  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.674293  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2920  hypothetical protein  31.82 
 
 
190 aa  85.5  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465994  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2980  hypothetical protein  31.82 
 
 
190 aa  85.5  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0164  hypothetical protein  31.82 
 
 
190 aa  85.5  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.549532  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4128  hypothetical protein  32.57 
 
 
218 aa  85.5  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.37766  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0395  hypothetical protein  36.69 
 
 
216 aa  85.1  6e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000330292  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0895  hypothetical protein  31.03 
 
 
184 aa  84.3  9e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.363973  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3467  hypothetical protein  31.03 
 
 
184 aa  84.3  9e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0950509  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1145  hypothetical protein  32.07 
 
 
194 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4713  hypothetical protein  34.78 
 
 
194 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.133421  normal  0.150702 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6459  hypothetical protein  34.24 
 
 
360 aa  84  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0115  hypothetical protein  29.48 
 
 
189 aa  84  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.454945  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0551  protein of unknown function UPF0016  34.07 
 
 
195 aa  84  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000259464  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3391  protein of unknown function UPF0016  30.46 
 
 
184 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3189  hypothetical protein  31.43 
 
 
184 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.372005  normal  0.740442 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3590  hypothetical protein  30.46 
 
 
184 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.976053  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0985  hypothetical protein  31.52 
 
 
194 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.172763  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0802  hypothetical protein  34.24 
 
 
194 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2039  protein of unknown function UPF0016  31.18 
 
 
196 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.589069  hitchhiker  0.00000000898807 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0094  hypothetical protein  29.71 
 
 
190 aa  81.3  0.000000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00169792 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4428  hypothetical protein  33.7 
 
 
194 aa  81.6  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0640  hypothetical protein  29.89 
 
 
184 aa  81.3  0.000000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0366  putative transmembrane protein  32.57 
 
 
191 aa  81.3  0.000000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0909  hypothetical protein  30.86 
 
 
197 aa  81.3  0.000000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0121906  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3028  hypothetical protein  30.29 
 
 
198 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.521433 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0946  hypothetical protein  30.29 
 
 
198 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.452942  normal  0.0960568 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0521  protein of unknown function UPF0016  36.57 
 
 
187 aa  79.7  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0925  hypothetical protein  30.46 
 
 
190 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21119  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0688  hypothetical protein  31.43 
 
 
190 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155693  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2100  hypothetical protein  31.25 
 
 
204 aa  79.3  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.636196 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2431  transmembrane protein  33.7 
 
 
206 aa  79.3  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447861  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0667  hypothetical protein  32.39 
 
 
191 aa  79.3  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3666  hypothetical protein  36.48 
 
 
194 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3880  hypothetical protein  29.61 
 
 
188 aa  79  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000226161  hitchhiker  0.000000250469 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1137  protein of unknown function UPF0016  32.77 
 
 
219 aa  78.6  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.562577  normal  0.745829 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0933  hypothetical protein  34.52 
 
 
201 aa  78.6  0.00000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413996  normal  0.753002 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0447  hypothetical protein  31.98 
 
 
191 aa  78.2  0.00000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.243135  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2416  hypothetical protein  34.5 
 
 
205 aa  77.4  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2117  hypothetical protein  33.15 
 
 
194 aa  77.4  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0176125 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0914  hypothetical protein  31.03 
 
 
184 aa  77  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1071  hypothetical protein  29.31 
 
 
197 aa  77  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5289  protein of unknown function UPF0016  32.39 
 
 
187 aa  76.6  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41260  hypothetical protein  31.32 
 
 
194 aa  76.6  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140731  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2260  hypothetical protein  32.61 
 
 
195 aa  76.6  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3939  hypothetical protein  28.49 
 
 
204 aa  77  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.143914  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1998  hypothetical protein  29.53 
 
 
200 aa  76.6  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.579109  normal  0.0445396 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2072  hypothetical protein  31.36 
 
 
201 aa  76.6  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0921348  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2940  hypothetical protein  31.64 
 
 
186 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.835594  normal  0.0290979 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2497  hypothetical protein  34.62 
 
 
200 aa  76.3  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2513  hypothetical protein  31.67 
 
 
221 aa  75.1  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0274541  normal  0.55837 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5105  protein of unknown function UPF0016  31.79 
 
 
197 aa  75.1  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.440587 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0760  hypothetical protein  34.24 
 
 
194 aa  74.3  0.0000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0788  hypothetical protein  34.24 
 
 
194 aa  74.7  0.0000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.632611 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3626  hypothetical protein  29.94 
 
 
185 aa  74.3  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1080  membrane protein  30.22 
 
 
189 aa  73.9  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2251  protein of unknown function UPF0016  32.34 
 
 
190 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.305842  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1927  protein of unknown function UPF0016  33.53 
 
 
190 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.14267  normal  0.0417322 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2778  hypothetical protein  29.31 
 
 
188 aa  73.6  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.130489  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1430  hypothetical protein  31.43 
 
 
186 aa  73.6  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000236998  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5275  hypothetical protein  36.13 
 
 
192 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.932867  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001996  hypothetical protein  29.94 
 
 
184 aa  72.8  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61260  hypothetical protein  36.13 
 
 
192 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00451  hypothetical protein  27.78 
 
 
184 aa  72.8  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0241  hypothetical protein  32.16 
 
 
191 aa  72  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41250  hypothetical protein  36.9 
 
 
193 aa  70.9  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.396742  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0155  protein of unknown function UPF0016  32.02 
 
 
238 aa  70.9  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.915442  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4726  protein of unknown function UPF0016  30.73 
 
 
270 aa  70.5  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>