38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3815 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3815  hypothetical protein  100 
 
 		 909 aa  1788    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0211463 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0051  hypothetical protein  49.72 
 
 		 859 aa  741    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1680  hypothetical protein  45.19 
 
 		 873 aa  567  1e-160  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4849  hypothetical protein  43.33 
 
 		 878 aa  513  1e-144  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.151765 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1161  hypothetical protein  37.95 
 
 		 888 aa  501  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0100721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5221  hypothetical protein  39.32 
 
 		 850 aa  502  1e-140  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.954731  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1537  hypothetical protein  46.21 
 
 		 908 aa  491  1e-137  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161966 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1817  hypothetical protein  46.36 
 
 		 910 aa  493  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.373268  normal  0.202162 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0940  hypothetical protein  41.45 
 
 		 851 aa  492  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0664  hypothetical protein  39.34 
 
 		 844 aa  488  1e-136  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.44285  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0831  hypothetical protein  39.67 
 
 		 846 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.844423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0573  hypothetical protein  40.07 
 
 		 828 aa  477  1e-133  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.292146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4872  hypothetical protein  40.2 
 
 		 850 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0548997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1706  hypothetical protein  45.86 
 
 		 914 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2956  hypothetical protein  42.07 
 
 		 879 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1984  hypothetical protein  37.13 
 
 		 881 aa  429  1e-119  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1909  hypothetical protein  36.66 
 
 		 881 aa  425  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1882  hypothetical protein  37.71 
 
 		 866 aa  418  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0996  hypothetical protein  36.05 
 
 		 897 aa  410  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3097  hypothetical protein  35.35 
 
 		 862 aa  402  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1599  hypothetical protein  34.49 
 
 		 832 aa  365  2e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3861  hypothetical protein  34.01 
 
 		 884 aa  352  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.193877 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2539  hypothetical protein  34.52 
 
 		 884 aa  350  5e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3568  hypothetical protein  32.92 
 
 		 897 aa  349  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.159826 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0057  hypothetical protein  30.11 
 
 		 805 aa  322  3e-86  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4021  hypothetical protein  31.93 
 
 		 914 aa  315  3.9999999999999997e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2385  hypothetical protein  31.47 
 
 		 834 aa  297  6e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0225171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0730  hypothetical protein  30.91 
 
 		 834 aa  296  8e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223584  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0480  hypothetical protein  32.13 
 
 		 850 aa  285  3.0000000000000004e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2449  hypothetical protein  30.07 
 
 		 830 aa  282  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.313088  normal  0.324274 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2372  hypothetical protein  30.32 
 
 		 867 aa  252  3e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.190188 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3496  hypothetical protein  31.34 
 
 		 883 aa  243  1e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.735765 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3058  conserved hypothetical protein TIGR02302  32.42 
 
 		 894 aa  235  2.0000000000000002e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.56238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2019  hypothetical protein  29.54 
 
 		 834 aa  216  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0867221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3378  hypothetical protein  28.8 
 
 		 963 aa  184  9.000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.143577 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0232  hypothetical protein  28.07 
 
 		 904 aa  153  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.122461  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0743  hypothetical protein  27.31 
 
 		 767 aa  99.8  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf497  massive surface protein MspF  21.94 
 
 		 2993 aa  47  0.002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.378464  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>