More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2559 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_5465  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  76.26 
 
 
437 aa  655    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2296  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  74.6 
 
 
435 aa  644    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.238027 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1240  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  71.62 
 
 
435 aa  635    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.543485 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0656  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  75.57 
 
 
437 aa  637    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.162698 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0257  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  75.8 
 
 
437 aa  652    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0116604 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0129  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  75.29 
 
 
433 aa  650    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.768224  normal  0.321326 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0624  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  75.34 
 
 
437 aa  634    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.67253  normal  0.770577 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0251  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  77.12 
 
 
435 aa  695    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.600656  normal  0.544782 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0403  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  74.37 
 
 
433 aa  652    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.236378 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2559  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  100 
 
 
437 aa  874    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.358535 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0302  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  76.43 
 
 
434 aa  674    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0418  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  75.29 
 
 
433 aa  654    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0120  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  75.74 
 
 
433 aa  655    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.417089  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0308  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  75.74 
 
 
433 aa  664    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0152  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  75.74 
 
 
434 aa  662    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3084  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  75.11 
 
 
437 aa  645    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0435809  normal  0.960617 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0645  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  75.34 
 
 
437 aa  636    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.883439  normal  0.159408 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0031  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  71.85 
 
 
435 aa  625  1e-178  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3983  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  71.17 
 
 
435 aa  626  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2079  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  71.17 
 
 
434 aa  622  1e-177  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4311  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  70.94 
 
 
435 aa  622  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0841  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  71.85 
 
 
434 aa  624  1e-177  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1999  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  70.71 
 
 
434 aa  616  1e-175  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.432724  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3266  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  70.02 
 
 
435 aa  615  1e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3490  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  70.55 
 
 
436 aa  616  1e-175  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2983  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  68.42 
 
 
435 aa  608  1e-173  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1260  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  68.43 
 
 
436 aa  605  9.999999999999999e-173  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3600  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  67.28 
 
 
435 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00234742  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2851  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  64.76 
 
 
436 aa  569  1e-161  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.192992  normal  0.735765 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3441  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  64.46 
 
 
437 aa  565  1e-160  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.37686  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3083  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  63.55 
 
 
438 aa  547  1e-154  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0175697 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2948  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  63.16 
 
 
433 aa  546  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.474337  normal  0.124858 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0182  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  62.93 
 
 
433 aa  545  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.997171  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1532  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  62.93 
 
 
433 aa  544  1e-153  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0187  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  63.49 
 
 
438 aa  542  1e-153  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0444321  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2790  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  62.93 
 
 
435 aa  540  9.999999999999999e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1409  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  65.37 
 
 
439 aa  530  1e-149  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0805  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.58 
 
 
492 aa  520  1e-146  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.332648  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5052  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  66.89 
 
 
431 aa  516  1.0000000000000001e-145  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.42386  normal  0.164562 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1595  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  63.47 
 
 
433 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.472132  normal  0.884744 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0997  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.35 
 
 
487 aa  514  1e-144  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4377  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  64.91 
 
 
433 aa  510  1e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0530  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.84 
 
 
441 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.10008  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0599  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  59.42 
 
 
441 aa  507  9.999999999999999e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0711171  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0067  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.3 
 
 
440 aa  504  9.999999999999999e-143  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4370  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.17 
 
 
443 aa  504  1e-141  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.347338  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0179  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.37 
 
 
443 aa  503  1e-141  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.763175  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0168  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  59.33 
 
 
443 aa  502  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0165  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.37 
 
 
443 aa  502  1e-141  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4192  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.94 
 
 
443 aa  502  1e-141  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3385  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.88 
 
 
443 aa  501  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2015  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.85 
 
 
440 aa  500  1e-140  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.788051  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1190  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.31 
 
 
437 aa  499  1e-140  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.298692  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0113  heat shock protein HslVU, ATPase subunit HslU  56.25 
 
 
443 aa  499  1e-140  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0817  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.14 
 
 
443 aa  499  1e-140  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.544231  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4430  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.72 
 
 
441 aa  499  1e-140  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.193952  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0072  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  59.2 
 
 
447 aa  500  1e-140  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3471  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.28 
 
 
457 aa  499  1e-140  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.425755 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0132  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.65 
 
 
439 aa  499  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0500755 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3708  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.65 
 
 
443 aa  501  1e-140  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4042  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  56.79 
 
 
443 aa  497  1e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0909  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  59.1 
 
 
442 aa  497  1e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2114  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.76 
 
 
465 aa  495  1e-139  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0057  heat shock protein HslVU, ATPase subunit HslU  57.56 
 
 
444 aa  497  1e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.408482  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0112  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.02 
 
 
443 aa  497  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2990  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  56.76 
 
 
446 aa  495  1e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00723  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.04 
 
 
443 aa  497  1e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2634  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  64.37 
 
 
433 aa  496  1e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.206684  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4104  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.02 
 
 
443 aa  497  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2247  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.04 
 
 
443 aa  495  1e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0112  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.02 
 
 
443 aa  497  1e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0015  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  56.99 
 
 
461 aa  497  1e-139  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001749  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  58.26 
 
 
443 aa  497  1e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.28369  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03816  ATP-dependent protease ATP-binding subunit  56.57 
 
 
443 aa  491  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4054  heat shock protein HslVU, ATPase subunit HslU  56.57 
 
 
443 aa  491  9.999999999999999e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5001  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.96 
 
 
447 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0042  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.43 
 
 
443 aa  492  9.999999999999999e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4875  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.96 
 
 
447 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.129232  normal  0.155967 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4163  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.3 
 
 
440 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5388  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  56.57 
 
 
443 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3680  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  56.54 
 
 
446 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4421  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  56.35 
 
 
443 aa  494  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.732607  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4373  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  56.57 
 
 
443 aa  491  9.999999999999999e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.611238 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0446  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  56.6 
 
 
442 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4337  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  56.35 
 
 
443 aa  494  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.321775  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4163  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  56.57 
 
 
443 aa  491  9.999999999999999e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4793  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  56.35 
 
 
444 aa  494  9.999999999999999e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000260414 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04279  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  56.61 
 
 
485 aa  492  9.999999999999999e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3362  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.94 
 
 
441 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4087  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  56.57 
 
 
443 aa  491  9.999999999999999e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4423  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  56.35 
 
 
443 aa  494  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0440  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.17 
 
 
441 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4491  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  56.35 
 
 
443 aa  494  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3798  heat shock protein HslVU, ATPase subunit HslU  56.47 
 
 
443 aa  491  9.999999999999999e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03765  hypothetical protein  56.57 
 
 
443 aa  491  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5051  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.96 
 
 
447 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3782  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.17 
 
 
441 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.268349  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4307  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  56.35 
 
 
443 aa  494  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.114857  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2698  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.11 
 
 
438 aa  490  1e-137  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.408772  decreased coverage  0.000313907 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0811  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  56.88 
 
 
438 aa  488  1e-137  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.706239  normal  0.908147 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>