48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1880 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1880  lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 477 aa  911    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0806  lipopolysaccharide biosynthesis protein  31.2 
 
 		 507 aa  119  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  30.39 
 
 		 738 aa  72.4  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5214  lipopolysaccharide biosynthesis protein  31.63 
 
 		 774 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241921  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0854  exopolysaccharide transport protein family  28.06 
 
 		 709 aa  66.2  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.298615 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0308  lipopolysaccharide biosynthesis protein  31.68 
 
 		 737 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1810  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.56 
 
 		 766 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.499722  normal  0.952814 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2958  lipopolysaccharide biosynthesis protein  33.94 
 
 		 759 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0453248 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2194  lipopolysaccharide biosynthesis protein  31.45 
 
 		 804 aa  63.2  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2661  lipopolysaccharide biosynthesis  38.53 
 
 		 773 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2684  lipopolysaccharide biosynthesis  31.32 
 
 		 742 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0586325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1859  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.82 
 
 		 804 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.708627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2463  lipopolysaccharide biosynthesis  30.48 
 
 		 713 aa  60.1  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.718819  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4605  polysaccharide biosynthesis transporter  35 
 
 		 763 aa  58.9  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.599014 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2697  lipopolysaccharide biosynthesis  30.99 
 
 		 769 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1959  capsular exopolysaccharide family  27.97 
 
 		 732 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.901256 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1666  exopolysaccharide polymerization/transport protein  31.01 
 
 		 747 aa  56.2  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.3 
 
 		 741 aa  55.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4340  hypothetical protein  31.98 
 
 		 482 aa  54.7  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.561828 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1415  lipopolysaccharide biosynthesis  28.57 
 
 		 715 aa  53.9  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.836118 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3091  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.57 
 
 		 784 aa  53.9  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00715976  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  27.27 
 
 		 740 aa  53.9  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1061  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.18 
 
 		 730 aa  53.5  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2505  exopolysaccharide transport protein family  40 
 
 		 735 aa  53.5  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.68 
 
 		 741 aa  51.2  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1457  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.22 
 
 		 576 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  24.81 
 
 		 741 aa  51.2  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1726  exopolysaccharide transporter  25.63 
 
 		 746 aa  51.2  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320019  normal  0.507839 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  25.56 
 
 		 741 aa  50.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.56 
 
 		 741 aa  50.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  25.56 
 
 		 741 aa  50.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  25.68 
 
 		 741 aa  50.4  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  29.38 
 
 		 734 aa  50.1  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3056  protein-tyrosine kinase  28.4 
 
 		 772 aa  48.9  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6261  exopolysaccharide transport protein family  24.09 
 
 		 746 aa  48.5  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.7097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1225  lipopolysaccharide biosynthesis protein  41.56 
 
 		 724 aa  48.5  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0867598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1135  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.2 
 
 		 745 aa  47.8  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1157  exopolysaccharide transport protein family  28.48 
 
 		 720 aa  47.8  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.238721  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4163  lipopolysaccharide biosynthesis  27.63 
 
 		 748 aa  47.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.214287  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4203  lipopolysaccharide biosynthesis  27.63 
 
 		 748 aa  47.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.263405 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3313  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.63 
 
 		 735 aa  47  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1313  lipopolysaccharide biosynthesis protein  40 
 
 		 726 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0674  lipopolysaccharide biosynthesis  28.07 
 
 		 764 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0975294  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0785  hypothetical protein  26.34 
 
 		 220 aa  45.8  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  25.94 
 
 		 739 aa  44.3  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0778  hypothetical protein  25.85 
 
 		 220 aa  44.7  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4816  non-specific protein-tyrosine kinase  28.57 
 
 		 750 aa  44.3  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  23.67 
 
 		 730 aa  43.5  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>