263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1109 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2357  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  62.62 
 
 		 701 aa  849    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.306896  normal  0.223006 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0522  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  55.35 
 
 		 764 aa  734    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2402  glycyl-tRNA synthetase beta chain  51.68 
 
 		 720 aa  671    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0966728  normal  0.754916 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1239  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  60.13 
 
 		 760 aa  855    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0507  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  50.82 
 
 		 697 aa  639    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.250134  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0404  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  53.55 
 
 		 777 aa  741    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2175  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  50.8 
 
 		 728 aa  650    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.754598  normal  0.117585 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0466  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  55.2 
 
 		 721 aa  746    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0728  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  52.88 
 
 		 741 aa  688    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2586  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  63.96 
 
 		 727 aa  884    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.577877  normal  0.134975 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1858  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  50.95 
 
 		 697 aa  640    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2759  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  73.61 
 
 		 704 aa  713    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3096  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  65.49 
 
 		 726 aa  850    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0413  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  53.43 
 
 		 777 aa  741    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2126  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  77.23 
 
 		 821 aa  754    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1095  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  59.48 
 
 		 760 aa  827    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.729278  normal  0.459772 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0956  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  53.69 
 
 		 764 aa  744    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2731  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  49.14 
 
 		 739 aa  653    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0985358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3329  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  62.55 
 
 		 733 aa  869    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4348  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  63.3 
 
 		 728 aa  887    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.314297  hitchhiker  0.00562302 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1138  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  65.8 
 
 		 699 aa  846    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1221  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  69.5 
 
 		 822 aa  708    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.64374 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3210  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  58.66 
 
 		 764 aa  818    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.58245  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2310  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  51.43 
 
 		 687 aa  670    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.75706 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0538  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  56.13 
 
 		 727 aa  766    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.533831  normal  0.300886 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0714  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  54.07 
 
 		 789 aa  768    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1109  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  100 
 
 		 737 aa  1446    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2178  glycine--tRNA ligase  50.79 
 
 		 738 aa  643    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4369  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  67.31 
 
 		 701 aa  899    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0644  glycine--tRNA ligase  49.48 
 
 		 758 aa  636    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.121642  normal  0.442369 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3289  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  65.54 
 
 		 724 aa  834    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0726267  normal  0.258667 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0583  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  55.2 
 
 		 704 aa  756    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.496315 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0540  glycine--tRNA ligase  50.21 
 
 		 685 aa  645    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3416  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  66.35 
 
 		 696 aa  837    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.269984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0380  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  49.33 
 
 		 740 aa  701    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2111  glycine--tRNA ligase  48.37 
 
 		 738 aa  614  9.999999999999999e-175  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.541212  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1611  glycine--tRNA ligase  49.66 
 
 		 723 aa  608  9.999999999999999e-173  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0785205 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4858  glycine--tRNA ligase  51.23 
 
 		 677 aa  594  1e-168  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2955  glycine--tRNA ligase  48.78 
 
 		 721 aa  586  1e-166  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0577  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  46.54 
 
 		 686 aa  493  9.999999999999999e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0505087  hitchhiker  0.0000000000000536601 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2185  glycine--tRNA ligase  45.89 
 
 		 723 aa  482  1e-135  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1022  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  37.53 
 
 		 687 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.208045  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0579  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  38.35 
 
 		 687 aa  409  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0604  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  37.82 
 
 		 694 aa  404  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3059  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  37.04 
 
 		 687 aa  403  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0207  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  37.47 
 
 		 692 aa  401  9.999999999999999e-111  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2116  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  37.52 
 
 		 689 aa  400  9.999999999999999e-111  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0599  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.7 
 
 		 688 aa  397  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487119  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2941  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  37.53 
 
 		 686 aa  399  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.125162  hitchhiker  0.000287233 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0061  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  37.77 
 
 		 689 aa  397  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4934  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  37.06 
 
 		 689 aa  398  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.711684 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4054  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  37.06 
 
 		 689 aa  396  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3881  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.93 
 
 		 689 aa  398  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03410  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.79 
 
 		 689 aa  394  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0152  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  36.79 
 
 		 689 aa  394  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03361  hypothetical protein  36.79 
 
 		 689 aa  394  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3966  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.93 
 
 		 689 aa  395  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  37.58 
 
 		 689 aa  393  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0400  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  38.77 
 
 		 697 aa  396  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.543468 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0156  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.79 
 
 		 689 aa  394  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0043  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  37.23 
 
 		 694 aa  392  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0012  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.22 
 
 		 689 aa  393  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000111985 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2445  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.48 
 
 		 694 aa  393  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0415  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  38.63 
 
 		 697 aa  395  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.474954  normal  0.979484 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3761  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.79 
 
 		 689 aa  394  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.677293  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4130  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  37.18 
 
 		 689 aa  392  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3782  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  37.18 
 
 		 689 aa  392  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0163  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.52 
 
 		 689 aa  390  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2472  glycine--tRNA ligase  35.37 
 
 		 695 aa  391  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0180526  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0023  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  37.18 
 
 		 689 aa  392  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  37.67 
 
 		 689 aa  391  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736647 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3849  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.66 
 
 		 689 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.88 
 
 		 688 aa  388  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3868  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.66 
 
 		 689 aa  388  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0550  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  39.4 
 
 		 739 aa  386  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3977  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.52 
 
 		 689 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3931  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.52 
 
 		 689 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4037  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.52 
 
 		 689 aa  389  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.414013 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0070  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  37.31 
 
 		 689 aa  386  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.118047  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0155  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.7 
 
 		 705 aa  384  1e-105  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.117933  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4167  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.93 
 
 		 689 aa  385  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2347  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  38.74 
 
 		 701 aa  384  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.501634 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0355  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  35.46 
 
 		 690 aa  384  1e-105  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1289  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  38.68 
 
 		 704 aa  384  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.708462 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1686  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  37.21 
 
 		 696 aa  384  1e-105  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.78284  normal  0.0276337 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4449  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.93 
 
 		 689 aa  383  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4177  glycine--tRNA ligase  39.01 
 
 		 708 aa  384  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.787875  normal  0.54331 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0701  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.25 
 
 		 699 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0218  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.25 
 
 		 699 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2350  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.25 
 
 		 699 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0656  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.46 
 
 		 687 aa  381  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70031e-23 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0881  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.11 
 
 		 699 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.59966  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2430  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.25 
 
 		 699 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.726931  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0716  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.25 
 
 		 699 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  37.69 
 
 		 688 aa  382  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0446  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  37.12 
 
 		 707 aa  380  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.45 
 
 		 692 aa  379  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2728  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.25 
 
 		 699 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0185  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  36.66 
 
 		 684 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0373  glycine--tRNA ligase  36.2 
 
 		 691 aa  377  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.87078  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>