More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2428 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2428  nitroreductase  100 
 
 		 200 aa  405  1.0000000000000001e-112  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3073  nitroreductase  64.82 
 
 		 201 aa  253  1.0000000000000001e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000978726  normal  0.396217 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4738  nitroreductase  51.6 
 
 		 184 aa  177  8e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1628  nitroreductase  41.79 
 
 		 207 aa  144  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.627423 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1450  nitroreductase  38.54 
 
 		 192 aa  135  5e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.761824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1600  nitroreductase  39.78 
 
 		 192 aa  134  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04940  Nitroreductase family protein  38.71 
 
 		 185 aa  133  1.9999999999999998e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.680935  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2649  nitroreductase  40.31 
 
 		 192 aa  129  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1291  nitroreductase  38.34 
 
 		 191 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2170  nitroreductase  37.57 
 
 		 204 aa  102  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3170  nitroreductase  35.11 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2036  nitroreductase  32.11 
 
 		 187 aa  97.4  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.378927  normal  0.848302 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1668  nitroreductase  31.05 
 
 		 187 aa  97.4  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.145589  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2494  nitroreductase  32.52 
 
 		 182 aa  95.9  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.838709  hitchhiker  0.00693244 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1800  nitroreductase  31.25 
 
 		 182 aa  95.5  5e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.493936  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2374  nitroreductase  32.52 
 
 		 182 aa  95.1  6e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.611093  normal  0.915737 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4233  nitroreductase  34.92 
 
 		 209 aa  94.7  9e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.064349  normal  0.419848 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2304  nitroreductase  31.9 
 
 		 182 aa  94.4  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0131618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2478  nitroreductase  31.25 
 
 		 182 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.981358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0450  nitroreductase  34.12 
 
 		 187 aa  93.2  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.58966 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1847  nitroreductase  30.59 
 
 		 182 aa  93.2  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1808  nitroreductase  31.25 
 
 		 182 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1833  nitroreductase  32.1 
 
 		 182 aa  92.4  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0967243  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7221  nitroreductase  33.33 
 
 		 221 aa  92  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1665  nitroreductase  32.05 
 
 		 182 aa  91.3  9e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2708  nitroreductase family protein  32.12 
 
 		 182 aa  89.7  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0266  nitroreductase  33.15 
 
 		 187 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1828  nitroreductase  32.48 
 
 		 186 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5206  hypothetical protein  30.65 
 
 		 187 aa  89.7  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130059 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2747  nitroreductase  33.99 
 
 		 182 aa  89  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.501163 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0053  nitroreductase  31.38 
 
 		 188 aa  89  5e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1919  hypothetical protein  34.12 
 
 		 186 aa  88.2  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2199  nitroreductase  34.87 
 
 		 188 aa  87  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.654603 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1763  nitroreductase  34.55 
 
 		 190 aa  86.7  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6294  nitroreductase  28.95 
 
 		 187 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167962  normal  0.193293 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22710  hypothetical protein  34.12 
 
 		 186 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0282238 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2163  nitroreductase  34.9 
 
 		 169 aa  85.5  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0519328 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1532  nitroreductase  30.2 
 
 		 182 aa  85.5  5e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2674  nitroreductase  32.94 
 
 		 194 aa  85.1  6e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1095  nitroreductase  30.16 
 
 		 219 aa  85.1  6e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.42931 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2220  nitroreductase family protein  30.16 
 
 		 194 aa  84.7  7e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.605376  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002916  protein ydjA  30.18 
 
 		 182 aa  84.3  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2590  nitroreductase family protein  27.66 
 
 		 198 aa  84  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.236049  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1967  hypothetical protein  27.27 
 
 		 183 aa  84  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1891  nitroreductase  32.93 
 
 		 182 aa  84  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1287  aldehyde dehydrogenase  30.81 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3262  nitroreductase  30.95 
 
 		 191 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561471  normal  0.0279896 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4506  nitroreductase  33.81 
 
 		 185 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1405  nitroreductase  33.81 
 
 		 185 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000113316  normal  0.729658 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1923  nitroreductase family protein  30.11 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2209  hypothetical protein  29.41 
 
 		 183 aa  82.8  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.601257  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1740  nitroreductase  29.41 
 
 		 182 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2592  nitroreductase  31.18 
 
 		 195 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.28104 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2271  nitroreductase  31.72 
 
 		 194 aa  82  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.800886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1818  nitroreductase  30.89 
 
 		 208 aa  81.3  0.000000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3592  nitroreductase  31.95 
 
 		 186 aa  81.3  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0449801  normal  0.683239 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4012  nitroreductase  33.09 
 
 		 185 aa  81.3  0.000000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.147997  hitchhiker  0.000154736 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2317  nitroreductase  30.65 
 
 		 197 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.844939  normal  0.193364 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1635  nitroreductase  34.88 
 
 		 187 aa  80.5  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.191312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0191  nitroreductase  30.32 
 
 		 217 aa  80.1  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.104049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1354  nitroreductase  30.63 
 
 		 186 aa  80.1  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000836569  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1457  nitroreductase family protein  31.41 
 
 		 182 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1068  nitroreductase family protein  31.45 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2043  nitroreductase family protein  31.45 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.144976  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0968  hypothetical protein  30 
 
 		 191 aa  79.3  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1783  nitroreductase family protein  31.45 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0498  hypothetical protein  29.7 
 
 		 183 aa  79.3  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.228432  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0775  nitroreductase family protein  31.45 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3795  nitroreductase  33.09 
 
 		 185 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000177685 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2050  nitroreductase family protein  31.45 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1495  hypothetical protein  27.66 
 
 		 187 aa  79.3  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0669321 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0671  nitroreductase family protein  30.82 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2721  hypothetical protein  27.98 
 
 		 183 aa  79.3  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.6916  hitchhiker  0.00284611 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12251  hypothetical protein  29.7 
 
 		 183 aa  79  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1480  nitroreductase  28.92 
 
 		 188 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0228393  normal  0.126132 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0173  nitroreductase  33.33 
 
 		 191 aa  78.6  0.00000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000256246 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1617  nitroreductase  31.87 
 
 		 183 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0850  nitroreductase  30 
 
 		 191 aa  78.6  0.00000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.811499  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0566  hypothetical protein  30.64 
 
 		 182 aa  78.2  0.00000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.121072  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0762  nitroreductase family protein  30.82 
 
 		 207 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01646  putative nitroreductase  29.59 
 
 		 183 aa  77.8  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00644737  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2315  nitroreductase  28.92 
 
 		 182 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2345  hypothetical protein  26.74 
 
 		 183 aa  76.6  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000126395  hitchhiker  0.00560319 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1981  hypothetical protein  26.74 
 
 		 183 aa  76.6  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000959579  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2090  hypothetical protein  26.74 
 
 		 183 aa  76.6  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.363519  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1061  nitroreductase  29.07 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.425769  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01734  predicted oxidoreductase  29.48 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00353733  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1877  nitroreductase  29.48 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000380394  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1988  hypothetical protein  29.48 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00470911  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2485  hypothetical protein  29.48 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.175131  normal  0.297695 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1867  hypothetical protein  29.48 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0147803  decreased coverage  0.00000404862 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01722  hypothetical protein  29.48 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00796019  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2020  hypothetical protein  29.48 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242439  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1849  hypothetical protein  29.48 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000672951  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2042  nitroreductase  29.57 
 
 		 194 aa  75.9  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.258273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1426  hypothetical protein  29.48 
 
 		 183 aa  75.5  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00297236  normal  0.808801 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1843  nitroreductase  29.57 
 
 		 194 aa  75.1  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.32071  normal  0.0306824 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13071  hypothetical protein  29.48 
 
 		 183 aa  75.1  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.212182  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2050  hypothetical protein  30.26 
 
 		 183 aa  74.7  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.658191  normal  0.425687 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1879  hypothetical protein  30.26 
 
 		 183 aa  74.7  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000572902  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>