More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2029 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2029  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  100 
 
 
342 aa  699    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.948095  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2751  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  78.85 
 
 
331 aa  552  1e-156  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1611  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.13 
 
 
350 aa  369  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3431  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.18 
 
 
337 aa  364  1e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00846703 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0305  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.92 
 
 
342 aa  364  1e-99  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3079  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.63 
 
 
342 aa  353  2e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.544275  unclonable  0.000000030667 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1685  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.46 
 
 
342 aa  349  4e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0260  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.17 
 
 
327 aa  343  2e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0380  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.04 
 
 
312 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4138  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.31 
 
 
330 aa  334  1e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000244942 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2404  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.31 
 
 
323 aa  333  3e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.672695  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3680  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.56 
 
 
341 aa  330  2e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00834015  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2232  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.02 
 
 
318 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4468  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.65 
 
 
337 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2182  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.24 
 
 
340 aa  323  2e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1314  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50 
 
 
307 aa  323  2e-87  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4443  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.9 
 
 
336 aa  323  4e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5789  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.55 
 
 
331 aa  323  4e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0435819 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0186  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.16 
 
 
320 aa  322  5e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0231  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.28 
 
 
318 aa  321  9.999999999999999e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.592131  normal  0.59425 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1447  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.38 
 
 
329 aa  321  9.999999999999999e-87  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4443  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.85 
 
 
336 aa  319  3e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4288  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50 
 
 
336 aa  320  3e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4425  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.1 
 
 
336 aa  318  7.999999999999999e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0590  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.19 
 
 
307 aa  316  4e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3035  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.87 
 
 
362 aa  316  5e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0056  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.49 
 
 
318 aa  315  6e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1298  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.42 
 
 
322 aa  312  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895742 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1117  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.11 
 
 
322 aa  312  6.999999999999999e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0565824  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1337  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.79 
 
 
322 aa  310  2e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.120656  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1137  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.11 
 
 
322 aa  310  2e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1111  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.11 
 
 
322 aa  310  2e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1230  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.11 
 
 
322 aa  310  2e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1375  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.11 
 
 
322 aa  309  4e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0141  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.41 
 
 
340 aa  309  5e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.215848 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4128  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.29 
 
 
352 aa  308  8e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0972084  hitchhiker  0.00000000618238 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1269  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.48 
 
 
323 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.281724  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0632  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.32 
 
 
340 aa  307  2.0000000000000002e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4298  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.75 
 
 
354 aa  306  3e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.901656 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4072  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.17 
 
 
323 aa  306  3e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.416009  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0939  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.62 
 
 
323 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2336  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.39 
 
 
357 aa  305  6e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.930883  normal  0.268504 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1136  dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase  45.69 
 
 
360 aa  305  6e-82  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0311464 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0734  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.37 
 
 
335 aa  305  8.000000000000001e-82  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.290638  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0956  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.94 
 
 
344 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.417373  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4724  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.81 
 
 
330 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0256  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.37 
 
 
334 aa  301  1e-80  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00101554  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1704  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.47 
 
 
340 aa  301  1e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00817913  normal  0.680282 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2146  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.16 
 
 
308 aa  300  2e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.478357  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06090  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.47 
 
 
330 aa  298  8e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262708  normal  0.550779 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1124  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.82 
 
 
323 aa  296  4e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0644506  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0415  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.07 
 
 
324 aa  296  4e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.021137  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2884  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.02 
 
 
341 aa  295  9e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.543075  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6490  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.22 
 
 
325 aa  294  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1072  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.3 
 
 
352 aa  293  3e-78  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0939  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.48 
 
 
348 aa  293  3e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1669  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.96 
 
 
357 aa  293  3e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1064  hypothetical protein  46.57 
 
 
337 aa  293  3e-78  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.732456 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0512  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.13 
 
 
339 aa  293  3e-78  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3273  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.31 
 
 
357 aa  292  5e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4331  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.93 
 
 
331 aa  292  6e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3235  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.31 
 
 
352 aa  292  6e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0307  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  44.71 
 
 
339 aa  292  6e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6347  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.63 
 
 
330 aa  292  7e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.378586  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3465  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.64 
 
 
360 aa  291  9e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.848345  normal  0.362131 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4211  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.26 
 
 
331 aa  290  2e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.315212 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2639  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  44.25 
 
 
356 aa  290  2e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.997652  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2799  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.98 
 
 
336 aa  290  3e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0141685  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0899  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.69 
 
 
355 aa  290  3e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4439400000000002e-32 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0957  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  42.49 
 
 
357 aa  289  4e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.177421 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2366  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.55 
 
 
358 aa  289  6e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.501885  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1658  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  44.66 
 
 
359 aa  289  6e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.548961  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1217  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.93 
 
 
308 aa  288  7e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0354  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  44.35 
 
 
348 aa  288  1e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001808  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.61 
 
 
355 aa  288  1e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14390  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  43.94 
 
 
356 aa  287  2e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.449381  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0120  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.49 
 
 
353 aa  287  2e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2593  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.18 
 
 
362 aa  287  2e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2473  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.29 
 
 
358 aa  287  2e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2097  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.52 
 
 
347 aa  287  2e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0494  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  42.61 
 
 
355 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.774907  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0516  dTDP-D-glucose-4,6-dehydratase  46.36 
 
 
355 aa  286  2.9999999999999996e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3346  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.82 
 
 
355 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4152  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.19 
 
 
355 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2317  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.32 
 
 
367 aa  286  4e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.150256 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4029  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.36 
 
 
355 aa  285  5.999999999999999e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0186  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.36 
 
 
355 aa  285  5.999999999999999e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2182  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.88 
 
 
354 aa  285  7e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0103955  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2319  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.46 
 
 
353 aa  285  7e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.251448 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3072  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.74 
 
 
351 aa  285  7e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.611799  normal  0.380858 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1568  dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase  44.38 
 
 
340 aa  285  9e-76  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3994  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.81 
 
 
355 aa  285  9e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.353509  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03666  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  44.9 
 
 
355 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1560  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  43.07 
 
 
354 aa  284  1.0000000000000001e-75  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0861  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.05 
 
 
337 aa  284  1.0000000000000001e-75  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.18378  hitchhiker  0.0000000578516 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03615  hypothetical protein  44.9 
 
 
355 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0419  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.27 
 
 
350 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1405  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.8 
 
 
354 aa  285  1.0000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2098  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.1 
 
 
356 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1758  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  42.98 
 
 
355 aa  284  1.0000000000000001e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0506683 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>