38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0938 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0938  hypothetical protein  100 
 
 
210 aa  419  1e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.919268 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3504  twin-arginine translocation pathway signal  38.46 
 
 
203 aa  75.9  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.369986 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1665  twin-arginine translocation pathway signal  35.56 
 
 
228 aa  75.9  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.267089  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2716  hypothetical protein  36.41 
 
 
216 aa  68.2  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0285801  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3503  twin-arginine translocation pathway signal  31.61 
 
 
228 aa  67.4  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.770727 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1645  hypothetical protein  32.48 
 
 
320 aa  59.7  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0388574 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3389  hypothetical protein  31.49 
 
 
190 aa  58.5  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.133287  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4137  hypothetical protein  34.33 
 
 
190 aa  57.8  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4335  hypothetical protein  36.36 
 
 
227 aa  57.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1522  hypothetical protein  32.9 
 
 
229 aa  57.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.529559 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2811  hypothetical protein  34.32 
 
 
266 aa  57.8  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1649  hypothetical protein  31.43 
 
 
206 aa  55.8  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.108582  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4334  hypothetical protein  36.81 
 
 
247 aa  55.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2125  hypothetical protein  35.82 
 
 
192 aa  54.7  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.25809  hitchhiker  0.00273266 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0698  hypothetical protein  31.61 
 
 
204 aa  53.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3167  hypothetical protein  31.29 
 
 
271 aa  53.1  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.516329  normal  0.554216 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2360  hypothetical protein  32.9 
 
 
203 aa  52  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.167171 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4517  hypothetical protein  31.46 
 
 
247 aa  52.4  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2574  hypothetical protein  33.33 
 
 
201 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.317138 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0385  hypothetical protein  30.57 
 
 
234 aa  49.7  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0630  hypothetical protein  34.91 
 
 
275 aa  49.3  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04980  conserved hypothetical protein  28.65 
 
 
312 aa  47.8  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2170  hypothetical protein  31.28 
 
 
201 aa  47.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.264761 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5555  hypothetical protein  32.74 
 
 
269 aa  46.6  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3241  conserved hypothetical protein, secreted  30.41 
 
 
262 aa  46.2  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.797318 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1614  hypothetical protein  33.09 
 
 
248 aa  45.1  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.328172  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1587  hypothetical protein  26.6 
 
 
284 aa  44.7  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.260029  normal  0.0327578 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2717  hypothetical protein  29.8 
 
 
218 aa  44.7  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000628487  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0162  hypothetical protein  28.78 
 
 
310 aa  44.3  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.390523 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3652  hypothetical protein  32.61 
 
 
221 aa  44.7  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.209693  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1458  hypothetical protein  35.46 
 
 
237 aa  44.3  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0671711  normal  0.0432371 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2962  hypothetical protein  32.61 
 
 
196 aa  43.9  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0898019  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6381  hypothetical protein  31.87 
 
 
189 aa  42.7  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3704  hypothetical protein  27.71 
 
 
251 aa  42.7  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1847  hypothetical protein  29.85 
 
 
198 aa  42  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.604576 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5432  conserved hypothetical protein, secreted  30.71 
 
 
263 aa  41.6  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0701309 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5433  hypothetical protein  26.91 
 
 
237 aa  41.2  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.447331  normal  0.0742075 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5246  hypothetical protein  24.76 
 
 
290 aa  41.6  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.435436 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>