30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5820 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_5820  hypothetical protein  100 
 
 
270 aa  528  1e-149  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.330441  normal  0.0260789 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2355  hypothetical protein  42.53 
 
 
300 aa  182  6e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.555476  normal  0.544076 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1805  hypothetical protein  42.47 
 
 
262 aa  167  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0989937  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2976  hypothetical protein  44.33 
 
 
286 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.514057  normal  0.101883 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1825  hypothetical protein  40.19 
 
 
278 aa  151  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2890  hypothetical protein  41.02 
 
 
281 aa  139  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.105579 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3085  hypothetical protein  36.51 
 
 
287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.422699  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2750  hypothetical protein  36.33 
 
 
282 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0283  hypothetical protein  40.33 
 
 
302 aa  116  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3322  hypothetical protein  31.65 
 
 
286 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.470211  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1147  hypothetical protein  39.33 
 
 
285 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0434891 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1036  hypothetical protein  37.64 
 
 
285 aa  99.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4332  hypothetical protein  36.31 
 
 
285 aa  98.6  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.318075  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2106  hypothetical protein  30.3 
 
 
283 aa  80.1  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4376  hypothetical protein  30.85 
 
 
266 aa  64.7  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1792  hypothetical protein  28.9 
 
 
298 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0409814  hitchhiker  0.00116581 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3224  hypothetical protein  29.65 
 
 
297 aa  63.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.643218  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4201  hypothetical protein  24.76 
 
 
290 aa  61.6  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.602002 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2785  hypothetical protein  28.83 
 
 
289 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0719299  normal  0.726284 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0511  hypothetical protein  26.86 
 
 
297 aa  56.6  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.252109 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1599  hypothetical protein  27.52 
 
 
298 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.647468  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1070  hypothetical protein  26.24 
 
 
296 aa  51.2  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.12114  normal  0.566405 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0032  hypothetical protein  22.75 
 
 
258 aa  48.5  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000724697  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2476  hypothetical protein  24.7 
 
 
291 aa  46.2  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.372575 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0523  hypothetical protein  28.33 
 
 
244 aa  45.8  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3520  hypothetical protein  26.78 
 
 
249 aa  45.8  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.347044  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0218  hypothetical protein  27.18 
 
 
240 aa  45.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0773  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.81 
 
 
289 aa  45.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2821  hypothetical protein  28.48 
 
 
289 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.612498  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1862  hypothetical protein  34.23 
 
 
212 aa  42  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>