More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4810 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4810  glutamine amidotransferase class-II  100 
 
 
297 aa  598  1e-170  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.917981  hitchhiker  0.00206329 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1575  glutamine amidotransferase class-II  77.74 
 
 
316 aa  474  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1656  glutamine amidotransferase class-II  78.33 
 
 
311 aa  475  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.670859  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1938  glutamine amidotransferase class-II  77.67 
 
 
311 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.210707  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1942  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  69.7 
 
 
297 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.738445 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4695  glutamine amidotransferase class-II  68.01 
 
 
299 aa  404  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.903048 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2632  glutamine amidotransferase class-II  66.33 
 
 
299 aa  387  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1138  glutamine amidotransferase, class-II  68.01 
 
 
298 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.16804 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1870  putative glutamine amidotransferase  66.11 
 
 
308 aa  382  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117624  normal  0.828633 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6575  glutamine amidotransferase class-II  62.58 
 
 
302 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0505165 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6008  glutamine amidotransferase class-II  62.84 
 
 
301 aa  372  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.362161  decreased coverage  0.00354269 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5638  glutamine amidotransferase class-II  63 
 
 
301 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.52916  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3291  glutamine amidotransferase class-II  63.76 
 
 
301 aa  370  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5749  amidophosphoribosyltransferase  60.74 
 
 
301 aa  369  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2274  glutamine amidotransferase, class-II  61.51 
 
 
306 aa  363  2e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0107042 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2583  glutamine amidotransferase, class-II protein  61 
 
 
306 aa  359  3e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0230258  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3467  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  60.54 
 
 
299 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.836717  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2248  glutamine amidotransferase class-II  61.2 
 
 
301 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.280725 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1346  glutamine amidotransferase, class-II  55.22 
 
 
299 aa  341  8e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1699  glutamine amidotransferase class-II  52.12 
 
 
296 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5919  glutamine amidotransferase class-II  50.66 
 
 
302 aa  293  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116128  normal  0.458284 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0457  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  47.02 
 
 
298 aa  290  2e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.598323  normal  0.402222 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2499  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  47.84 
 
 
305 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0705172  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3033  glutamine amidotransferase, class-II  47.35 
 
 
302 aa  282  4.0000000000000003e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0167  glutamine amidotransferase class-II  47.68 
 
 
302 aa  280  2e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3524  glutamine amidotransferase class-II  50 
 
 
302 aa  273  4.0000000000000004e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0234475 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4806  glutamine amidotransferase class-II  48.83 
 
 
298 aa  264  1e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5510  glutamine amidotransferase, class-II  47.85 
 
 
302 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.623211  normal  0.154748 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5261  glutamine amidotransferase, class-II  46.69 
 
 
298 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.228434 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4893  glutamine amidotransferase, class-II  46.69 
 
 
298 aa  250  2e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4982  glutamine amidotransferase, class-II  46.69 
 
 
298 aa  250  2e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1299  glutamine amidotransferase, class-II  47.25 
 
 
302 aa  248  7e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0375941  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0772  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  38.94 
 
 
608 aa  84  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.900207  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0039  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  36.09 
 
 
610 aa  83.6  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1448  amidophosphoribosyltransferase  28.18 
 
 
474 aa  83.2  0.000000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1419  amidophosphoribosyltransferase  30.95 
 
 
461 aa  82.8  0.000000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0127132  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0007  amidophosphoribosyltransferase  32.61 
 
 
487 aa  82  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30048  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3872  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  36.22 
 
 
610 aa  81.6  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00831  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  38.39 
 
 
610 aa  81.3  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0708  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  44.23 
 
 
612 aa  81.3  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2822  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  36.17 
 
 
610 aa  81.3  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0085  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  33.81 
 
 
611 aa  81.3  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.800313  normal  0.506708 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0228  amidophosphoribosyltransferase  30.54 
 
 
478 aa  80.1  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.629689  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1536  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  33.07 
 
 
610 aa  80.1  0.00000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0665  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  25.79 
 
 
350 aa  79.7  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1475  amidophosphoribosyltransferase  30.65 
 
 
472 aa  79  0.00000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1766  amidophosphoribosyltransferase  32.4 
 
 
488 aa  78.6  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0501857 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2184  amidophosphoribosyltransferase  26.84 
 
 
487 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3743  amidophosphoribosyltransferase  35.62 
 
 
466 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000189021 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0394  amidophosphoribosyltransferase  31.14 
 
 
470 aa  77.4  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0144451 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4234  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  37.5 
 
 
609 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.235934  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001643  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase (isomerizing)  36.61 
 
 
610 aa  76.6  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0244363  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1632  amidophosphoribosyltransferase  33.73 
 
 
469 aa  76.6  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1511  amidophosphoribosyltransferase  35.62 
 
 
466 aa  76.3  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.409813  normal  0.0292739 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0033  amidophosphoribosyltransferase  30.2 
 
 
497 aa  75.9  0.0000000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2741  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  34.11 
 
 
611 aa  75.9  0.0000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.214537 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0095  amidophosphoribosyltransferase  28.14 
 
 
476 aa  75.5  0.0000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1147  amidophosphoribosyltransferase  28.16 
 
 
478 aa  75.5  0.0000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.218005  normal  0.314166 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4064  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  37.69 
 
 
614 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4741  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  38.24 
 
 
609 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2426  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  39.32 
 
 
609 aa  75.5  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.184466  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3948  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  34.62 
 
 
611 aa  75.5  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.739647  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3743  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  38.76 
 
 
609 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1366  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  38.24 
 
 
607 aa  75.5  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1778  hypothetical protein  30.72 
 
 
475 aa  75.1  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000929805  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4481  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  36.13 
 
 
609 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000322632 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5409  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  38.98 
 
 
611 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.323982  hitchhiker  0.00848262 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5291  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  38.98 
 
 
611 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268199  normal  0.456401 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0324  amidophosphoribosyltransferase  34.81 
 
 
471 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2047  amidophosphoribosyltransferase  31.28 
 
 
465 aa  74.7  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.330153 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0368  amidophosphoribosyltransferase  34.81 
 
 
471 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4125  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  37.25 
 
 
609 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.513895  normal  0.539293 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4571  amidophosphoribosyltransferase  31.79 
 
 
468 aa  74.3  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.470676  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22120  amidophosphoribosyltransferase  32.4 
 
 
480 aa  74.7  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.357347  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4217  amidophosphoribosyltransferase  32.22 
 
 
494 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0468  amidophosphoribosyltransferase  28.48 
 
 
456 aa  73.9  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.350158  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4178  amidophosphoribosyltransferase  32.22 
 
 
494 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1249  amidophosphoribosyltransferase  25 
 
 
488 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.917797  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01750  amidophosphoribosyltransferase  28.76 
 
 
482 aa  73.9  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.674101  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1377  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  38.85 
 
 
610 aa  73.9  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.986235  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0230  amidophosphoribosyltransferase  30.59 
 
 
463 aa  73.6  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0884272  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1338  glutamine amidotransferase, class-II  29.97 
 
 
364 aa  73.9  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.845818 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6142  amidophosphoribosyltransferase  32.81 
 
 
519 aa  73.6  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2748  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  33.07 
 
 
604 aa  73.6  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0274  amidophosphoribosyltransferase  34.81 
 
 
471 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0138  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  29.69 
 
 
612 aa  73.6  0.000000000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.266568  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2491  glutamine amidotransferase, class-II  26.89 
 
 
371 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0396  amidophosphoribosyltransferase  27.88 
 
 
459 aa  73.2  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4318  amidophosphoribosyltransferase  30.34 
 
 
496 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0724  amidophosphoribosyltransferase  30.26 
 
 
500 aa  73.6  0.000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00225283  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0507  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  41.84 
 
 
612 aa  73.2  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00435471 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4979  amidophosphoribosyltransferase  32.91 
 
 
471 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1202  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  38.41 
 
 
607 aa  73.2  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10337  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0536  glutamine amidotransferase class-II  29.72 
 
 
372 aa  73.2  0.000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3280  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  33.85 
 
 
610 aa  73.2  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.333472  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2095  amidophosphoribosyltransferase  31.67 
 
 
480 aa  73.2  0.000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.778059 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3639  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  34.96 
 
 
609 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000255668  normal  0.139839 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0439  amidophosphoribosyltransferase  27.88 
 
 
459 aa  72.8  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0270  amidophosphoribosyltransferase  32.91 
 
 
471 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0522  glutamine amidotransferase, class-II  29.72 
 
 
395 aa  72.8  0.000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>