64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4734 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4734  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
264 aa  531  1e-150  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.590817  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0742  alpha/beta hydrolase fold  52.09 
 
 
273 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4655  Alpha/beta hydrolase  49.43 
 
 
273 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.875827 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0879  alpha/beta hydrolase fold  48.3 
 
 
273 aa  238  9e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.46004  normal  0.445527 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0748  alpha/beta family hydrolase  49.03 
 
 
267 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4372  alpha/beta family hydrolase  45.71 
 
 
270 aa  189  2.9999999999999997e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.686172 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1010  alpha/beta family hydrolase  55.11 
 
 
176 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.47639 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1623  alpha/beta hydrolase fold  41.7 
 
 
280 aa  181  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2830  Alpha/beta hydrolase fold  40.49 
 
 
257 aa  180  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2949  alpha/beta hydrolase fold  40.4 
 
 
271 aa  179  2.9999999999999997e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.545682  normal  0.28971 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1418  putative lactonase (box pathway)  42 
 
 
282 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.104299  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3026  hypothetical protein  42.86 
 
 
277 aa  177  1e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2701  alpha/beta hydrolase fold  39.84 
 
 
284 aa  174  9e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.832615  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2862  Alpha/beta hydrolase fold  41.63 
 
 
271 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1544  alpha/beta hydrolase fold protein  39.84 
 
 
284 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3654  alpha/beta hydrolase fold  37.83 
 
 
272 aa  171  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0215  alpha/beta hydrolase  39.36 
 
 
271 aa  169  4e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.296554  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0897  putative lactonase (box pathway)  39.92 
 
 
287 aa  169  5e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0425746  normal  0.277892 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0882  hypothetical protein  40.65 
 
 
276 aa  166  4e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0088  alpha/beta hydrolase fold protein  39.76 
 
 
267 aa  162  4.0000000000000004e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1328  Alpha/beta hydrolase fold  36.9 
 
 
271 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3398  Alpha/beta hydrolase fold  41.8 
 
 
255 aa  160  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3406  putative hydrolase-related protein  44.44 
 
 
266 aa  159  4e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0670  alpha/beta hydrolase  40.16 
 
 
258 aa  155  9e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1225  alpha/beta hydrolase fold  37.82 
 
 
271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16662  normal  0.108175 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4621  alpha/beta hydrolase fold  34.62 
 
 
285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.312074 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4645  alpha/beta hydrolase fold  34.31 
 
 
265 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.917363  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3718  alpha/beta hydrolase fold  34.31 
 
 
265 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0380543 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0377  alpha/beta fold family hydrolase  33.05 
 
 
277 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2393  Alpha/beta hydrolase  35.17 
 
 
286 aa  112  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.590588  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0554  lactonase  33.05 
 
 
390 aa  112  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0364  alpha/beta fold family hydrolase  33.05 
 
 
277 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3803  alpha/beta hydrolase fold  34.87 
 
 
265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.695303 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0322  lactonase  31.47 
 
 
277 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5009  alpha/beta hydrolase fold  35.22 
 
 
288 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.97318  normal  0.569979 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4964  alpha/beta hydrolase fold  33.47 
 
 
275 aa  108  7.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102964  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3602  alpha/beta hydrolase fold  33.8 
 
 
280 aa  106  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.949623  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5458  alpha/beta hydrolase fold  33.79 
 
 
285 aa  105  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4108  alpha/beta hydrolase fold  32.53 
 
 
270 aa  105  9e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.24138 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4220  alpha/beta hydrolase fold protein  32.53 
 
 
270 aa  105  9e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1771  alpha/beta hydrolase fold protein  29.61 
 
 
279 aa  100  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3299  alpha/beta hydrolase fold  30.12 
 
 
259 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26310  Alpha/beta hydrolase fold protein  28.63 
 
 
275 aa  88.6  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.201822  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  28.69 
 
 
387 aa  53.1  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  27.45 
 
 
387 aa  52  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1391  putative hydrolase  28.86 
 
 
387 aa  50.4  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  24.89 
 
 
562 aa  48.1  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0178  alpha/beta fold family hydrolase  37.19 
 
 
296 aa  46.2  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1084  alpha/beta hydrolase fold  26.29 
 
 
387 aa  46.2  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3568  Alpha/beta hydrolase fold  33.64 
 
 
296 aa  45.4  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0257229  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0122  alpha/beta hydrolase fold  26.27 
 
 
268 aa  45.4  0.0009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7062  alpha/beta hydrolase fold  34.75 
 
 
296 aa  44.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  34.29 
 
 
267 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1166  alpha/beta hydrolase fold protein  24.22 
 
 
333 aa  44.3  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  24.72 
 
 
298 aa  43.9  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  27.46 
 
 
312 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  27.46 
 
 
312 aa  43.5  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  33.06 
 
 
299 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  33.06 
 
 
299 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25500  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  37.89 
 
 
294 aa  42.7  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0257089  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0741  hypothetical protein  40.28 
 
 
292 aa  42.7  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  22.59 
 
 
286 aa  42.4  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1759  Alpha/beta hydrolase fold hydrolase or acyltransferase  24.32 
 
 
265 aa  42.4  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11889  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5766  alpha/beta hydrolase fold protein  35.45 
 
 
302 aa  42  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>