42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2827 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2827  glycosyl transferase-like protein  100 
 
 
650 aa  1243    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.535834 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7225  Glycosyltransferase 28 domain protein  54.65 
 
 
671 aa  473  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.498881  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6473  glycosyltransferase family 28 protein  53.61 
 
 
671 aa  474  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0174404  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3692  hypothetical protein  44.44 
 
 
379 aa  284  3.0000000000000004e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.833754 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5976  Glycosyltransferase 28 domain  43.2 
 
 
382 aa  266  8.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.211682  normal  0.611684 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7129  Glycosyltransferase 28 domain protein  40.75 
 
 
381 aa  246  9e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.379317 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3925  hypothetical protein  41.71 
 
 
366 aa  232  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4598  glycosyltransferase family 28 protein  40 
 
 
384 aa  221  3e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.312674  normal  0.707093 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4586  polysaccharide deacetylase  40.85 
 
 
256 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428823  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3693  hypothetical protein  39.17 
 
 
252 aa  157  9e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.716866  normal  0.729343 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3934  hypothetical protein  41.05 
 
 
247 aa  154  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7102  hypothetical protein  42.08 
 
 
252 aa  152  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.945245 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5958  hypothetical protein  41.35 
 
 
250 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0659507 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0735  hypothetical protein  35.47 
 
 
401 aa  147  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0254  hypothetical protein  29.24 
 
 
374 aa  125  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.965107  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0356  hypothetical protein  31.02 
 
 
386 aa  120  9e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2358  putative glycosyltransferase protein  35.68 
 
 
396 aa  118  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0125042  normal  0.920267 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1765  polysaccharide deacetylase  29.67 
 
 
283 aa  86.3  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.552333 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2724  hypothetical protein  32.72 
 
 
258 aa  86.3  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.353724 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0333  Glycosyltransferase 28 domain protein  22.72 
 
 
414 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4330  hypothetical protein  24.68 
 
 
427 aa  80.9  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.89792  normal  0.0675545 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4270  hypothetical protein  23.74 
 
 
427 aa  79  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1994  putative glycosyltransferase  27.69 
 
 
386 aa  76.6  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0252697  normal  0.74194 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0360  hypothetical protein  23.68 
 
 
391 aa  75.5  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0204  response regulator receiver protein  29.14 
 
 
474 aa  75.5  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2825  hypothetical protein  30.35 
 
 
416 aa  68.2  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.791946  normal  0.436894 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0739  hypothetical protein  25.82 
 
 
391 aa  68.6  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4596  putative membrane-anchored protein  24.11 
 
 
404 aa  62.8  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.576563  normal  0.938247 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0734  hypothetical protein  28.63 
 
 
275 aa  62  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2432  hypothetical protein  25.32 
 
 
423 aa  61.6  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.18236 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0614  hypothetical protein  25.9 
 
 
409 aa  60.5  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0765  glycosyl transferase-like protein  25.9 
 
 
472 aa  60.1  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.51798  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3927  hypothetical protein  27.23 
 
 
402 aa  57  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5974  membrane-anchored protein  24.93 
 
 
401 aa  55.5  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.951983  normal  0.842489 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3688  hypothetical protein  28.17 
 
 
406 aa  55.5  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.112899 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7127  membrane-anchored protein  23.65 
 
 
402 aa  54.3  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.368579 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3905  glycosyltransferase family 28 protein  22.11 
 
 
401 aa  51.2  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0957738 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7222  RedA-like protein  27.89 
 
 
398 aa  48.5  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0752663  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01990  predicted glycosyl transferase  25.81 
 
 
461 aa  46.6  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6470  RedA-like protein  28.04 
 
 
394 aa  46.2  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0693  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  25.41 
 
 
364 aa  44.3  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.421793 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0783  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  26.98 
 
 
364 aa  43.9  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.653399 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>