23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4606 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4492  hypothetical protein  83.33 
 
 		 1853 aa  2487    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.664727 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4606  hypothetical protein  100 
 
 		 1574 aa  3091    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4124  hypothetical protein  83.52 
 
 		 1853 aa  2492    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.888798 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  39.6 
 
 		 2170 aa  419  9.999999999999999e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0137  Kelch repeat protein  36.68 
 
 		 1656 aa  399  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.175208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0358  hemolysin-type calcium-binding region  81.07 
 
 		 503 aa  275  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2426  hemolysin-type calcium-binding region  88.31 
 
 		 503 aa  275  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1231  NHL repeat-containing protein  29.11 
 
 		 1049 aa  198  9e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.001634  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1232  PKD domain-containing protein  28.01 
 
 		 2706 aa  101  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0182  hypothetical protein  39.87 
 
 		 933 aa  95.9  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.132644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2672  glycosy hydrolase family protein  26.43 
 
 		 1193 aa  80.1  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.947842  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  28.93 
 
 		 1762 aa  79.7  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2792  hypothetical protein  38.06 
 
 		 938 aa  77  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2666  glycosy hydrolase family protein  34.04 
 
 		 970 aa  73.9  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48253  predicted protein  36.3 
 
 		 1461 aa  70.1  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0799297  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0565  hypothetical protein  33.33 
 
 		 524 aa  66.6  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.333932  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0957  PA14 domain protein  28.49 
 
 		 3802 aa  62.8  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.168147 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7134  Chitinase-like protein  34.41 
 
 		 662 aa  58.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2816  Beta-galactosidase  30.37 
 
 		 1171 aa  56.2  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3497  hypothetical protein  29.03 
 
 		 1170 aa  53.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4075  glycoside hydrolase family protein  27.22 
 
 		 1175 aa  48.5  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589786  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2229  hypothetical protein  33.59 
 
 		 1018 aa  46.6  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.394559  normal  0.0986595 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  28.7 
 
 		 1667 aa  45.4  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>