33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4164 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4164  protein of unknown function DUF1791  100 
 
 		 153 aa  308  2e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.965103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6915  YchN-like domain-containing protein  48.67 
 
 		 151 aa  140  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.521749 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4264  hypothetical protein  50.39 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.901179  normal  0.594903 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4380  hypothetical protein  52.76 
 
 		 150 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4969  hypothetical protein  50.39 
 
 		 150 aa  133  9e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.808263  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2894  hypothetical protein  48.2 
 
 		 156 aa  124  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090759 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3669  hypothetical protein  50.39 
 
 		 150 aa  124  5e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.522918  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0139  hypothetical protein  48.76 
 
 		 151 aa  120  9e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.433672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3678  hypothetical protein  39.42 
 
 		 144 aa  95.9  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0173  hypothetical protein  42.31 
 
 		 159 aa  84.7  5e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.129014  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3025  hypothetical protein  38.33 
 
 		 162 aa  82.8  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2583  hypothetical protein  36.5 
 
 		 150 aa  74.3  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0140  hypothetical protein  37.82 
 
 		 155 aa  73.9  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.422607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2157  hypothetical protein  35.62 
 
 		 152 aa  73.2  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0563  hypothetical protein  26.54 
 
 		 246 aa  65.1  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3670  hypothetical protein  30.25 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0171  hypothetical protein  29.41 
 
 		 256 aa  61.2  0.000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.471424  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0180  hypothetical protein  34.43 
 
 		 181 aa  60.5  0.000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0526709  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2302  Domain of unknown function DUF1791  23.65 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.162762  normal  0.0557387 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1835  hypothetical protein  30.77 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292483 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2758  hypothetical protein  29.17 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0056  hypothetical protein  29.03 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3049  hypothetical protein  31.97 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1803  hypothetical protein  30.19 
 
 		 116 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.268314 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3680  hypothetical protein  31.33 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.803572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4871  hypothetical protein  24.32 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0547  hypothetical protein  28.35 
 
 		 169 aa  46.2  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.733611  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0468  hypothetical protein  32.2 
 
 		 112 aa  47  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2602  hypothetical protein  26.23 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00587907  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1583  hypothetical protein  27.5 
 
 		 119 aa  44.3  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0253638  normal  0.163534 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1146  hypothetical protein  24.41 
 
 		 160 aa  43.9  0.0009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.545594  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1472  hypothetical protein  21.52 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00198336  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0461  hypothetical protein  26.27 
 
 		 251 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.114453  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>