24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4155 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4155  putative thioredoxin  100 
 
 		 191 aa  391  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3670  putative thioredoxin-like protein  53.93 
 
 		 182 aa  198  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.350576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4964  putative thioredoxin  53.53 
 
 		 197 aa  192  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.598511  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4375  twin-arginine translocation pathway signal  51.81 
 
 		 193 aa  184  8e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.514109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4259  hypothetical protein  48.31 
 
 		 196 aa  182  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.781376  normal  0.40781 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1524  hypothetical protein  43.09 
 
 		 194 aa  144  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.74359 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3719  hypothetical protein  34.42 
 
 		 173 aa  105  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0526022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3919  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  43.12 
 
 		 191 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.231123 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2808  putative thioredoxin  41.35 
 
 		 188 aa  102  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.234004 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4149  thioredoxin SoxW  36.53 
 
 		 186 aa  101  7e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0887  thioredoxin-related protein-like protein  35.06 
 
 		 342 aa  96.7  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.435213 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0061  thioredoxin-related protein-like protein  34.39 
 
 		 349 aa  91.3  8e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2363  hypothetical protein  32.39 
 
 		 174 aa  81.6  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00329227  normal  0.435541 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2493  thioredoxin-related protein-like protein  31.76 
 
 		 357 aa  77.4  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0376  Thioredoxin-related protein-like protein  29.12 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.341694  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0316  Thioredoxin-related protein-like protein  28.75 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173673  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0739  hypothetical protein  24.44 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.1773  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0289  Thioredoxin-related protein-like protein  27.33 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.190044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2117  hypothetical protein  27.68 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.860814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0523  hypothetical protein  26.28 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.419067  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1855  protein of unknown function DUF255  21.74 
 
 		 172 aa  52  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2029  hypothetical protein  22.69 
 
 		 178 aa  44.3  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.213181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0030  hypothetical protein  29.79 
 
 		 169 aa  43.9  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0377  thioredoxin-related protein  20.28 
 
 		 170 aa  43.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.719942  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>