52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3638 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3751  hypothetical protein  97.79 
 
 		 499 aa  949    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0972722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3442  hypothetical protein  97.79 
 
 		 499 aa  950    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.41425  normal  0.022696 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5552  hypothetical protein  81.2 
 
 		 498 aa  739    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.508667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3638  hypothetical protein  100 
 
 		 500 aa  974    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.689622  normal  0.0322237 
 
 
-
 
NC_004310  BR1534  hypothetical protein  64.44 
 
 		 513 aa  595  1e-169  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.74675  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1483  hypothetical protein  64.44 
 
 		 511 aa  596  1e-169  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16085  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1632  hypothetical protein  63.87 
 
 		 514 aa  592  1e-168  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1920  hypothetical protein  60.96 
 
 		 526 aa  585  1e-166  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2283  AAA ATPase  65.5 
 
 		 511 aa  580  1e-164  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.635866 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1948  AAA ATPase  60.32 
 
 		 503 aa  579  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.315114  normal  0.618024 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7061  AAA ATPase  66.8 
 
 		 500 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0332905  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2157  AAA ATPase  60.85 
 
 		 504 aa  568  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.969754  normal  0.641302 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1515  AAA ATPase  58.86 
 
 		 504 aa  551  1e-156  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6246  AAA ATPase  65.64 
 
 		 520 aa  534  1e-150  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0844208 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1579  ATPase-like protein  61.51 
 
 		 498 aa  533  1e-150  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0994986  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6263  hypothetical protein  60.28 
 
 		 504 aa  528  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.311693 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3413  ATPase  59.43 
 
 		 516 aa  523  1e-147  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.747505 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2167  AAA ATPase  59.55 
 
 		 507 aa  525  1e-147  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.283139  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2732  hypothetical protein  59.88 
 
 		 510 aa  521  1e-146  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.393853  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0592  hypothetical protein  61.41 
 
 		 498 aa  519  1e-146  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000492944 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2035  ATPase  60.59 
 
 		 506 aa  518  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.322219 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4482  ATPase  59.58 
 
 		 502 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.197027 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3657  ATPase-like protein  56.77 
 
 		 490 aa  501  1e-140  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.16812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1720  ATPase  56.12 
 
 		 504 aa  477  1e-133  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0461  ATPase  54.53 
 
 		 492 aa  466  9.999999999999999e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0252  ATPase-like protein  27.84 
 
 		 537 aa  109  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2778  hypothetical protein  27.73 
 
 		 580 aa  64.3  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145513  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1865  hypothetical protein  25.65 
 
 		 655 aa  62.4  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0131162 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3041  protein of unknown function DUF87  29.18 
 
 		 744 aa  61.6  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2369  hypothetical protein  27.73 
 
 		 659 aa  58.5  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.70292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5115  hypothetical protein  27.9 
 
 		 595 aa  57.4  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0355  ATPase-like protein  23.81 
 
 		 250 aa  56.2  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8838  hypothetical protein  39.06 
 
 		 572 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.139707 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1112  hypothetical protein  33.33 
 
 		 524 aa  51.6  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0756  hypothetical protein  33.16 
 
 		 645 aa  50.4  0.00007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00608077 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0395  hypothetical protein  28.21 
 
 		 523 aa  48.9  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.190309  normal  0.0716823 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1610  hypothetical protein  27.35 
 
 		 628 aa  48.5  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.891235 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3486  ATPase-like protein  31.15 
 
 		 574 aa  48.5  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.123894  normal  0.207133 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2164  hypothetical protein  28.83 
 
 		 582 aa  47.8  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000710411 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5533  hypothetical protein  27.05 
 
 		 608 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.423742  normal  0.336707 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5935  hypothetical protein  27.05 
 
 		 608 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0918921  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0443  protein of unknown function DUF87  28.24 
 
 		 360 aa  47.4  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0177789  normal  0.220913 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5073  ATPase-like  30.06 
 
 		 567 aa  47.4  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3925  protein of unknown function DUF87  27.33 
 
 		 581 aa  47  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1359  hypothetical protein  34.57 
 
 		 570 aa  45.8  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997931 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1723  hypothetical protein  26.5 
 
 		 524 aa  45.4  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1877  protein of unknown function DUF87  20.21 
 
 		 560 aa  44.7  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4576  ATPase-like protein  34.25 
 
 		 664 aa  44.7  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26835  normal  0.0312719 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4980  hypothetical protein  30.83 
 
 		 570 aa  43.9  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1423  HAD family hydrolase  35 
 
 		 550 aa  43.5  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0753  protein of unknown function DUF87  31.53 
 
 		 506 aa  43.5  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0799035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5089  AAA ATPase  31.67 
 
 		 1100 aa  43.5  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0231758  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>