More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2376 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_2461  glycosyl transferase group 1  89.74 
 
 
390 aa  682    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2376  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
412 aa  823    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2683  glycosyl transferase group 1  89.81 
 
 
412 aa  723    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.765474 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4003  glycosyl transferase, group 1  43.73 
 
 
406 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1254  glycosyl transferase group 1  41.56 
 
 
413 aa  296  4e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1956  glycosyl transferase group 1  43.38 
 
 
443 aa  291  2e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0552  glycosyl transferase, group 1  40.44 
 
 
455 aa  287  2.9999999999999996e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.410076  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0530  glycosyl transferase, group 1  42.89 
 
 
407 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.307998 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0629  glycosyl transferase group 1  41.75 
 
 
408 aa  280  4e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0700  glycosyltransferase  42.93 
 
 
407 aa  280  4e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1873  glycosyl transferase group 1  40.58 
 
 
428 aa  279  7e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113427  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2355  glycosyl transferase, group 1  42.68 
 
 
407 aa  278  1e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.359383  normal  0.146668 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1066  glycosyl transferase, group 1  39.85 
 
 
453 aa  277  3e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.48395  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1625  glycosyltransferase  37.9 
 
 
407 aa  275  1.0000000000000001e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0764414  normal  0.185019 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1739  glycosyl transferase, group 1  38.78 
 
 
402 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00699985 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4925  glycosyl transferase, group 1  42.23 
 
 
409 aa  271  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3962  glycosyl transferase group 1  40.57 
 
 
411 aa  271  2e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.114116  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3818  glycosyl transferase group 1  44.09 
 
 
413 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.731283  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1803  glycosyl transferase, group 1  40.6 
 
 
405 aa  262  8.999999999999999e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.143321 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0219  putative glycosyltransferase  37.29 
 
 
415 aa  260  2e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0559  glycosyl transferase, group 1  38.3 
 
 
420 aa  256  4e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.34709 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2591  glycosyl transferase group 1  37.68 
 
 
410 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2318  glycosyl transferase, group 1  36.5 
 
 
406 aa  253  6e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3088  glycosyl transferase, group 1  35.23 
 
 
402 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.708464  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0447  hypothetical protein  36.8 
 
 
412 aa  245  9.999999999999999e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.607814  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21031  glycosyltransferase  32.07 
 
 
407 aa  234  3e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1248  glycosyl transferase group 1  34.4 
 
 
405 aa  232  8.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0503  glycosyl transferase group 1  36.48 
 
 
403 aa  227  4e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1356  glycosyl transferase, group 1  32.82 
 
 
423 aa  221  1.9999999999999999e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.699846  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4715  glycosyl transferase group 1  37.53 
 
 
415 aa  219  5e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0188107 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0078  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
432 aa  218  1e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.938289  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0578  glycosyl transferase, group 1  36.79 
 
 
518 aa  216  5.9999999999999996e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.941896  normal  0.221198 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3439  glycosyl transferase group 1  34.83 
 
 
406 aa  207  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1893  glycosyl transferase, group 1  34.86 
 
 
460 aa  207  4e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0365  hypothetical protein  35.95 
 
 
369 aa  204  3e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.309757  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01271  glycosyltransferase  31.64 
 
 
385 aa  203  4e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2888  glycosyl transferase group 1  36.93 
 
 
425 aa  202  7e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.378477  normal  0.0208188 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3858  glycosyl transferase, group 1  31.48 
 
 
417 aa  192  7e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2766  putative glycosyltransferase  34.35 
 
 
437 aa  178  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0109  glycosyltransferase  28.97 
 
 
401 aa  164  4.0000000000000004e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.927996  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0111  glycosyltransferase  29.49 
 
 
401 aa  159  8e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.451915  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01261  hypothetical protein  24.87 
 
 
412 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.96532 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0638  glycosyl transferase group 1  28.83 
 
 
406 aa  124  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4495  glycosyl transferase group 1  44.04 
 
 
188 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4431  glycosyl transferase group 1  44.04 
 
 
188 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  22.05 
 
 
410 aa  76.3  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4273  glycosyl transferase group 1  27.82 
 
 
407 aa  74.3  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17450  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29.8 
 
 
402 aa  72.8  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.792945  normal  0.169163 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0991  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.8 
 
 
421 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  30.48 
 
 
411 aa  66.2  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  26.43 
 
 
748 aa  66.2  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  30.36 
 
 
415 aa  65.5  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  29.78 
 
 
386 aa  63.5  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1149  glycosyl transferase group 1  30.15 
 
 
389 aa  63.5  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3047  glycosyl transferase group 1  28.09 
 
 
374 aa  62.4  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284334  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3834  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  32.2 
 
 
376 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0382059 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1374  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 
400 aa  61.2  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0717655  normal  0.0508272 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11690  glycogen synthase  27.23 
 
 
398 aa  60.8  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.328537  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21730  glycogen synthase  30.13 
 
 
404 aa  60.8  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  27.88 
 
 
394 aa  60.8  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2112  glycogen synthase  31.08 
 
 
396 aa  60.5  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  28.64 
 
 
423 aa  60.5  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2645  glycosyl transferase, group 1  31.84 
 
 
384 aa  59.7  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  29.11 
 
 
419 aa  58.9  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15860  glycogen synthase  28.38 
 
 
397 aa  59.7  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121629  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0294  glycosyl transferase, group 1  32.92 
 
 
413 aa  58.2  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1382  glycosyl transferase group 1  25.56 
 
 
376 aa  58.9  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0731677  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  25.21 
 
 
383 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2096  glycosyltransferase  26.72 
 
 
415 aa  58.9  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  22.18 
 
 
360 aa  58.5  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1426  glycosyl transferase group 1  29.19 
 
 
387 aa  57.4  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  26.38 
 
 
415 aa  57  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  30.07 
 
 
377 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  33 
 
 
407 aa  57  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2620  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  30.52 
 
 
385 aa  56.6  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2681  glycosyl transferase group 1  27.8 
 
 
376 aa  56.6  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2246  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  31.43 
 
 
374 aa  56.6  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.638485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2293  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  31.43 
 
 
374 aa  56.6  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.387023  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2285  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  31.43 
 
 
374 aa  56.6  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1287  glycosyl transferase group 1  26.81 
 
 
392 aa  55.8  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3146  glycosyl transferase group 1  27.34 
 
 
384 aa  55.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  28.71 
 
 
370 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5302  glycosyl transferase group 1  28.37 
 
 
351 aa  55.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12629  alpha-mannosyltransferase pimA  29.49 
 
 
378 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5152  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 
377 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.011173  decreased coverage  0.000105469 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2141  glycogen synthase  26.94 
 
 
401 aa  54.7  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309796  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0389  glycosyl transferase group 1  26.38 
 
 
359 aa  54.3  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1838  glycosyl transferase group 1  26.83 
 
 
500 aa  54.7  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  27.56 
 
 
386 aa  54.3  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2900  glycogen synthase  30.59 
 
 
396 aa  54.3  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.823096  normal  0.0634792 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5430  glycosyl transferase group 1  20.15 
 
 
378 aa  53.9  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1099  glycosyl transferase, group 1  27.43 
 
 
380 aa  53.9  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.209796  normal  0.0258816 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2562  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  31.11 
 
 
384 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  28.02 
 
 
390 aa  53.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1822  glycogen synthase  26.79 
 
 
398 aa  53.9  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.222954 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  28.67 
 
 
377 aa  53.5  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2407  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  31.08 
 
 
385 aa  53.5  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0928502 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0657  glycosyltransferase  24.77 
 
 
358 aa  53.5  0.000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.326106  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3184  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29.24 
 
 
404 aa  53.5  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  21.67 
 
 
408 aa  53.5  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>