94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1177 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_1177  HPr kinase  100 
 
 
175 aa  327  4e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.722715 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1398  HPr kinase  81.42 
 
 
179 aa  265  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.296553 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1236  HPr kinase  82.12 
 
 
175 aa  264  4e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5435  HPr kinase  57.14 
 
 
141 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142999  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0253  HPr kinase  55.14 
 
 
186 aa  101  5e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0460144 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0465  HPr kinase  46.11 
 
 
175 aa  97.4  9e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0369  HPr kinase  48.98 
 
 
153 aa  96.3  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.025129 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0359  HPr kinase  51.54 
 
 
155 aa  95.9  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2847  HPr kinase  56.19 
 
 
149 aa  94.7  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.305565 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7369  HPr kinase  50.38 
 
 
150 aa  89.4  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291783  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0441  HPr kinase  54.55 
 
 
168 aa  86.7  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0346  hypothetical protein  46.77 
 
 
169 aa  83.6  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.26045 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0595  HPr kinase  50.76 
 
 
180 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0343578  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3087  HPr kinase  47.01 
 
 
146 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0198917  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0400  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  46.15 
 
 
149 aa  82  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0476517  normal  0.0509134 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2905  HPr kinase  42.54 
 
 
141 aa  80.5  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2739  HPr kinase  48.09 
 
 
152 aa  79.3  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.192127 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3250  HPr kinase  39.71 
 
 
161 aa  79  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.965417  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2049  HPr kinase  48.08 
 
 
148 aa  74.7  0.0000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.824494  normal  0.123251 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0777  HPr kinase/phosphorylase  36.64 
 
 
313 aa  74.3  0.0000000000008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0046  hypothetical protein  42.75 
 
 
152 aa  73.2  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0826  HPr kinase  40.58 
 
 
160 aa  73.6  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1683  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  51.92 
 
 
142 aa  72  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2439  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  44.8 
 
 
162 aa  72  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.35684  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3449  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  44.27 
 
 
161 aa  71.2  0.000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2563  HPr kinase  47.71 
 
 
142 aa  70.5  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.734603  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3967  HPr kinase  37.98 
 
 
149 aa  69.3  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.363085  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0316  HPr kinase  50 
 
 
142 aa  68.6  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.745007 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0447  HPr kinase  39.71 
 
 
140 aa  65.9  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2851  HPr kinase  44.34 
 
 
142 aa  66.6  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.869678  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4294  HPr kinase  34.92 
 
 
150 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4628  HPr kinase  38.52 
 
 
144 aa  63.2  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.256939  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0757  HPr kinase/phosphorylase  35.66 
 
 
192 aa  62  0.000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.825604  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1208  HPr kinase/phosphorylase  35.66 
 
 
192 aa  62  0.000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0563  Serine kinase of the HPr protein, regulates carbohydrate metabolism  34.51 
 
 
319 aa  61.6  0.000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2092  hypothetical protein  39.42 
 
 
159 aa  61.6  0.000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3573  HPr kinase  41.84 
 
 
138 aa  60.8  0.000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl062  HPr kinase/phosphorylase  41.56 
 
 
310 aa  60.5  0.00000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2012  hypothetical protein  41.74 
 
 
159 aa  58.9  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0388749  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1903  HPr kinase  44.54 
 
 
161 aa  55.5  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.806436  normal  0.279054 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0113  HPr kinase  40 
 
 
158 aa  53.9  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.370636  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0530  HPr kinase/phosphorylase  32.57 
 
 
312 aa  52.4  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.620799  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0538  HPr kinase  38.46 
 
 
154 aa  52  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0719  HPr kinase/phosphorylase  33.57 
 
 
309 aa  50.8  0.000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0597  Serine kinase of the HPr protein, regulates carbohydrate metabolism  30.71 
 
 
321 aa  50.8  0.000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0638  HPr kinase/phosphorylase  32.37 
 
 
310 aa  49.7  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1758  HPr kinase  41.03 
 
 
320 aa  48.9  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0210  HPr kinase/phosphorylase  45 
 
 
145 aa  48.1  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2164  HPr kinase/phosphorylase  33.1 
 
 
319 aa  47  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0238  HPr kinase  29.36 
 
 
320 aa  46.2  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3171  HPr kinase/phosphorylase  33.83 
 
 
311 aa  46.6  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0369  HPr kinase  31.58 
 
 
320 aa  46.2  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0428  HPr kinase/phosphorylase  37.89 
 
 
310 aa  46.2  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1043  HPr kinase  31.58 
 
 
346 aa  45.8  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000020952  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1764  HPr kinase/phosphorylase  32.09 
 
 
333 aa  46.2  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0736  HPr kinase/phosphorylase  32.14 
 
 
311 aa  45.4  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4209  HPr kinase  37.89 
 
 
339 aa  45.4  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.250553  normal  0.955997 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0801  HPr kinase/phosphorylase  38.1 
 
 
310 aa  45.1  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0784  HPr kinase/phosphorylase  38.1 
 
 
310 aa  45.1  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.35663  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0082  HPr kinase/phosphorylase  33.33 
 
 
308 aa  45.1  0.0005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1002  HPr kinase/phosphorylase  33.09 
 
 
318 aa  44.3  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1328  HPr kinase/phosphorylase  38.75 
 
 
319 aa  44.3  0.0008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000959329  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1074  HPr kinase/phosphorylase  37.97 
 
 
307 aa  44.3  0.0009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0637079  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1261  HPr kinase/phosphorylase  37.97 
 
 
307 aa  44.3  0.0009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000389746  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0144  HPr kinase/phosphorylase  29.2 
 
 
319 aa  44.3  0.0009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.840136 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0602  HPr kinase/phosphorylase  32.35 
 
 
318 aa  43.9  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.159484  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3925  HPr kinase/phosphorylase  33.09 
 
 
318 aa  43.9  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4556  HPr kinase/phosphorylase  33.09 
 
 
318 aa  43.5  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3273  HPr kinase/phosphorylase  33.09 
 
 
318 aa  43.9  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.617288  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5282  HPr kinase/phosphorylase  31.5 
 
 
309 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.101146  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5267  HPr kinase/phosphorylase  31.5 
 
 
309 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2987  HPr kinase/phosphorylase  32.33 
 
 
311 aa  43.5  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.223835  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5012  HPr kinase/phosphorylase  31.5 
 
 
309 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4841  HPr kinase/phosphorylase  31.5 
 
 
309 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5248  HPr kinase/phosphorylase  31.5 
 
 
309 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4856  HPr kinase/phosphorylase  31.5 
 
 
309 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5392  HPr kinase/phosphorylase  31.5 
 
 
309 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5324  HPr kinase/phosphorylase  31.5 
 
 
309 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0566  HPr kinase/phosphorylase  30.77 
 
 
322 aa  42.4  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0976  HPr kinase/phosphorylase  28.97 
 
 
319 aa  42.4  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0405  HPr kinase/phosphorylase  32.26 
 
 
319 aa  42.7  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4956  HPr kinase/phosphorylase  31.5 
 
 
309 aa  42  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5675  HPr kinase/phosphorylase  31.5 
 
 
309 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16040  HPr kinase  31.15 
 
 
308 aa  41.6  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2630  HPr kinase  32.85 
 
 
310 aa  42  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3022  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  32.85 
 
 
310 aa  42  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0613  HPr kinase/phosphorylase  33.02 
 
 
330 aa  41.2  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.796182  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3792  HPr kinase/phosphorylase  33.06 
 
 
316 aa  41.2  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0754  HPr kinase/phosphorylase  33.96 
 
 
316 aa  41.6  0.007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.46702  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0668  HPr kinase/phosphorylase  33.96 
 
 
316 aa  41.6  0.007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4611  HPr kinase/phosphorylase  31.45 
 
 
316 aa  41.2  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2129  HPr kinase  43.94 
 
 
173 aa  41.2  0.008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.163054  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02224  HPr kinase/phosphorylase  33.96 
 
 
316 aa  40.8  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.375894  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2293  HPr kinase  30 
 
 
308 aa  40.8  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>