224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0543 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0579  extracellular solute-binding protein family 1  91.5 
 
 		 341 aa  640    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0543  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 341 aa  687    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0570  extracellular solute-binding protein  90.91 
 
 		 341 aa  637    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6288  extracellular solute-binding protein  82.42 
 
 		 341 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6369  extracellular solute-binding protein family 1  75.3 
 
 		 345 aa  512  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.290821  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5861  extracellular solute-binding protein  73.94 
 
 		 345 aa  495  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0700  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  65.94 
 
 		 338 aa  458  9.999999999999999e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0655  putative iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  66.25 
 
 		 380 aa  457  1e-127  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3824  extracellular solute-binding protein  63.55 
 
 		 338 aa  444  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4447  extracellular solute-binding protein  67.94 
 
 		 337 aa  439  9.999999999999999e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.181234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3764  extracellular solute-binding protein  65.92 
 
 		 362 aa  434  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1777  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein, putative  66.35 
 
 		 351 aa  428  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.476301  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1382  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  66.35 
 
 		 351 aa  428  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.560702  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1378  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  66.35 
 
 		 351 aa  428  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215691  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1182  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  66.35 
 
 		 351 aa  428  1e-119  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1511  ABC transporter, substrate binding protein  66.35 
 
 		 351 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0464  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  66.04 
 
 		 351 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.224989  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0688  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  66.04 
 
 		 351 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.163198  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2856  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein, putative  66.67 
 
 		 347 aa  426  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.143151  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2989  extracellular solute-binding protein family 1  58.48 
 
 		 348 aa  420  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1093  extracellular solute-binding protein  64.47 
 
 		 347 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.762259  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1093  extracellular solute-binding protein  64.47 
 
 		 347 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.39155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4318  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  63.52 
 
 		 347 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.434511  normal  0.628753 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1183  extracellular solute-binding protein  63.84 
 
 		 347 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0923795  normal  0.478437 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0730  extracellular solute-binding protein  63.84 
 
 		 347 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1210  extracellular solute-binding protein  63.84 
 
 		 347 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.13233  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1346  extracellular solute-binding protein family 1  61.9 
 
 		 349 aa  416  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0473337  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2093  extracellular solute-binding protein  64.47 
 
 		 347 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412416  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3699  extracellular solute-binding protein family 1  63.75 
 
 		 354 aa  409  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1439  extracellular solute-binding protein  53.89 
 
 		 337 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1463  extracellular solute-binding protein  53.89 
 
 		 338 aa  363  3e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.46603 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4631  extracellular solute-binding protein family 1  53.97 
 
 		 336 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.464324  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3947  extracellular solute-binding protein  52.98 
 
 		 338 aa  358  8e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000383863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0170  extracellular solute-binding protein  50.96 
 
 		 349 aa  347  2e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0327  extracellular solute-binding protein  47.32 
 
 		 346 aa  329  4e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0824216 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1108  extracellular solute-binding protein  47.9 
 
 		 336 aa  328  9e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122481  normal  0.048242 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1557  extracellular solute-binding protein  48.89 
 
 		 336 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.456805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2913  ABC Fe+3 siderophore transporter, periplasmic substrate-binding protein  48.89 
 
 		 336 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0606  extracellular solute-binding protein  43.79 
 
 		 335 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3347  extracellular solute-binding protein  43.2 
 
 		 335 aa  299  4e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1012  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron(III)-binding protein  44.75 
 
 		 335 aa  296  2e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.676586  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3517  extracellular solute-binding protein  44.21 
 
 		 335 aa  297  2e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1092  extracellular solute-binding protein  46.03 
 
 		 337 aa  297  2e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000221625  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002574  ferric iron ABC transporter iron-binding protein  42.03 
 
 		 337 aa  296  4e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000722094  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2588  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  41.74 
 
 		 337 aa  295  8e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0769  extracellular solute-binding protein  46.35 
 
 		 347 aa  293  3e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.302389  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3227  extracellular solute-binding protein  42.99 
 
 		 335 aa  293  3e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03435  hypothetical protein  43.35 
 
 		 337 aa  293  4e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3817  extracellular solute-binding protein  42.48 
 
 		 335 aa  292  7e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.890047 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0744  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron(III)-binding protein  42.31 
 
 		 335 aa  290  3e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3693  extracellular solute-binding protein  42.18 
 
 		 335 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0002551  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3635  extracellular solute-binding protein family 1  42.18 
 
 		 335 aa  288  1e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.84257 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0137  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  41.59 
 
 		 352 aa  286  2.9999999999999996e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000186976  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0636  extracellular solute-binding protein  40.88 
 
 		 335 aa  286  4e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.632135  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0861  extracellular solute-binding protein  42.35 
 
 		 335 aa  281  1e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0666  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron(III)-binding protein  42.99 
 
 		 335 aa  280  4e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0053906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0945  extracellular solute-binding protein  40.85 
 
 		 335 aa  278  7e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.248074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0996  extracellular solute-binding protein  42.54 
 
 		 335 aa  277  2e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000369263 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0783  periplasmic iron-binding protein  44.3 
 
 		 338 aa  277  2e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.27536  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0844  extracellular solute-binding protein  40.96 
 
 		 335 aa  275  6e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.680673  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3007  ABC iron(III) transporter periplasmic binding protein  39.81 
 
 		 339 aa  269  5.9999999999999995e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.050744  normal  0.546259 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1728  extracellular solute-binding protein  43.17 
 
 		 374 aa  232  6e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.224389  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0299  extracellular solute-binding protein family 1  41.32 
 
 		 345 aa  231  9e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0978527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0128  extracellular solute-binding protein  38.39 
 
 		 347 aa  231  1e-59  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0515184  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1547  ABC iron transporter, periplasmic binding protein  42.54 
 
 		 374 aa  230  3e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.231784  normal  0.33336 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4743  extracellular solute-binding protein  40.55 
 
 		 348 aa  229  4e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.326241  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3377  extracellular solute-binding protein  39.38 
 
 		 349 aa  229  4e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1371  putative iron binding protein component of ABC iron transporter  41.85 
 
 		 347 aa  227  2e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0455  extracellular solute-binding protein  41.4 
 
 		 345 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.479907  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2289  extracellular solute-binding protein  39.29 
 
 		 351 aa  225  8e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2587  extracellular solute-binding protein family 1  39.45 
 
 		 337 aa  224  1e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.390541  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0189  putative iron-binding protein  35.82 
 
 		 346 aa  224  2e-57  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.120226  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0549  extracellular solute-binding protein  38.63 
 
 		 341 aa  224  2e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0429047  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1443  extracellular solute-binding protein family 1  38.29 
 
 		 365 aa  223  3e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1469  extracellular solute-binding protein family 1  38.29 
 
 		 365 aa  223  3e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1056  extracellular solute-binding protein  40.37 
 
 		 337 aa  222  7e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.835874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3754  extracellular solute-binding protein  38.8 
 
 		 355 aa  221  9.999999999999999e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.684526  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1188  extracellular solute-binding protein  38.41 
 
 		 335 aa  219  5e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1529  extracellular solute-binding protein  35.99 
 
 		 355 aa  219  7e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014925  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1596  extracellular solute-binding protein  33.73 
 
 		 351 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.924744  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1409  iron transport system substrate-binding protein  37.58 
 
 		 340 aa  218  1e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2758  extracellular solute-binding protein  39.02 
 
 		 347 aa  218  1e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181201  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1200  extracellular solute-binding protein  38.92 
 
 		 337 aa  217  2e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2866  extracellular solute-binding protein  38.75 
 
 		 351 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.608635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2574  extracellular solute-binding protein  37.62 
 
 		 339 aa  216  5e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232421 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1181  ABC Fe+3 siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  39.94 
 
 		 347 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0582814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0732  extracellular solute-binding protein  37.34 
 
 		 337 aa  212  5.999999999999999e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.23005  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3844  extracellular solute-binding protein  37.88 
 
 		 347 aa  212  7e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.367273  hitchhiker  0.0000000311792 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1470  extracellular solute-binding protein family 1  36.76 
 
 		 350 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0897  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  36.79 
 
 		 341 aa  211  1e-53  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.502953  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1444  extracellular solute-binding protein family 1  36.76 
 
 		 350 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0118  extracellular solute-binding protein  36.44 
 
 		 339 aa  210  3e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2175  transport system substrate-binding protein  39.2 
 
 		 366 aa  210  4e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0189  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  32.34 
 
 		 334 aa  209  4e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0869  extracellular solute-binding protein  38.58 
 
 		 372 aa  209  6e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.107686  hitchhiker  0.000000984124 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3092  extracellular solute-binding protein  39.02 
 
 		 352 aa  209  6e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00849212  normal  0.375383 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0168  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  32.04 
 
 		 334 aa  209  7e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1607  extracellular solute-binding protein  39.33 
 
 		 349 aa  209  7e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1610  extracellular solute-binding protein  39.45 
 
 		 352 aa  208  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00405926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0005  iron-binding protein  35.62 
 
 		 335 aa  207  2e-52  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000237726  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>