More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0539 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0539  phenylacetate--CoA ligase  100 
 
 		 477 aa  993    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.757808  decreased coverage  0.00138843 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5019  phenylacetate--CoA ligase  72 
 
 		 477 aa  740    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.173124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3655  phenylacetate--CoA ligase  69.31 
 
 		 481 aa  705    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.174425 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2129  phenylacetate--CoA ligase  58.46 
 
 		 472 aa  565  1e-160  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0790  phenylacetate--CoA ligase  37.5 
 
 		 458 aa  268  1e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1613  Phenylacetate--CoA ligase  36.12 
 
 		 445 aa  263  4e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.297864  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3222  phenylacetate--CoA ligase  36.32 
 
 		 445 aa  263  6e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  34.61 
 
 		 432 aa  262  1e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  34.82 
 
 		 434 aa  258  2e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  34.01 
 
 		 431 aa  256  8e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0561  phenylacetate--CoA ligase  35.86 
 
 		 447 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  35.08 
 
 		 438 aa  251  1e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0169  phenylacetate--CoA ligase  33.78 
 
 		 433 aa  248  2e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  33.03 
 
 		 434 aa  246  6e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  32.06 
 
 		 434 aa  243  5e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  33.49 
 
 		 433 aa  243  5e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  34.68 
 
 		 433 aa  241  2e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  33.26 
 
 		 433 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1624  phenylacetate--CoA ligase  33.48 
 
 		 433 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.962242 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4801  phenylacetate-CoA ligase  34.82 
 
 		 436 aa  239  5.999999999999999e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12484  normal  0.238866 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0709  phenylacetate--CoA ligase  33.11 
 
 		 433 aa  239  8e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0797552 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  33.11 
 
 		 433 aa  238  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158285 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  33.71 
 
 		 430 aa  238  2e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  33.11 
 
 		 433 aa  238  2e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0749  phenylacetate--CoA ligase  32.13 
 
 		 433 aa  237  4e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0461279  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1422  Phenylacetate--CoA ligase  34.09 
 
 		 444 aa  236  6e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2792  phenylacetate--CoA ligase  32.51 
 
 		 440 aa  236  7e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  32.51 
 
 		 432 aa  236  9e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  33.41 
 
 		 434 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  32.51 
 
 		 433 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  31.45 
 
 		 433 aa  234  3e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0207  phenylacetate-CoA ligase  31.69 
 
 		 434 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2084  phenylacetate-CoA ligase  33.03 
 
 		 433 aa  233  5e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.268641  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0469  phenylacetate-CoA ligase  34.4 
 
 		 432 aa  232  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.119457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  32.27 
 
 		 433 aa  232  1e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  33.11 
 
 		 432 aa  232  1e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  31.98 
 
 		 432 aa  231  2e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2872  phenylacetate-CoA ligase  32.81 
 
 		 433 aa  231  2e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0742777  normal  0.0504153 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  31.76 
 
 		 432 aa  231  2e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  31.54 
 
 		 434 aa  230  3e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2693  phenylacetate-CoA ligase  34.91 
 
 		 434 aa  231  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.666778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0444  phenylacetate-CoA ligase  33.94 
 
 		 432 aa  230  4e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2123  Phenylacetate--CoA ligase  32.96 
 
 		 433 aa  229  7e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0656  phenylacetate-CoA ligase  33.33 
 
 		 434 aa  229  7e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0570  phenylacetate-CoA ligase  35.45 
 
 		 434 aa  229  7e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.419756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  33.71 
 
 		 446 aa  229  9e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1237  phenylacetate--CoA ligase  32.88 
 
 		 444 aa  229  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  33.11 
 
 		 444 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  33.11 
 
 		 432 aa  229  1e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  31.53 
 
 		 432 aa  228  2e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0442  Phenylacetate--CoA ligase  33.71 
 
 		 434 aa  228  2e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372138 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0811  Phenylacetate--CoA ligase  32.89 
 
 		 442 aa  228  2e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0511  phenylacetate-CoA ligase  33.94 
 
 		 432 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.948349  normal  0.684224 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  31.53 
 
 		 433 aa  227  3e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0466  phenylacetate-CoA ligase  34.43 
 
 		 434 aa  227  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  32.27 
 
 		 435 aa  228  3e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0066  phenylacetate--CoA ligase  32.58 
 
 		 432 aa  227  4e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.922632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1321  Phenylacetate--CoA ligase  30.99 
 
 		 449 aa  227  4e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.710343  normal  0.230718 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0901  phenylacetate-CoA ligase  34.43 
 
 		 445 aa  227  4e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2566  phenylacetate-CoA ligase  33.71 
 
 		 432 aa  227  4e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0539  phenylacetate-CoA ligase  33.71 
 
 		 432 aa  227  4e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.743587  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  32.27 
 
 		 435 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2855  phenylacetate-CoA ligase  33.26 
 
 		 432 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.343301  normal  0.707193 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  30.7 
 
 		 435 aa  226  6e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  30.63 
 
 		 433 aa  226  6e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0073  Phenylacetate--CoA ligase  31.08 
 
 		 433 aa  226  7e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  32.21 
 
 		 436 aa  226  7e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000190319  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3626  phenylacetate-CoA ligase  32.8 
 
 		 432 aa  225  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0611072  normal  0.539384 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3490  phenylacetate-CoA ligase  33.33 
 
 		 434 aa  225  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352435  hitchhiker  0.000125806 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1457  phenylacetate-CoA ligase  31.54 
 
 		 428 aa  225  1e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.387558 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1590  phenylacetate--CoA ligase  30.86 
 
 		 432 aa  225  2e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  31.17 
 
 		 433 aa  224  2e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1574  phenylacetate--CoA ligase  31.69 
 
 		 441 aa  224  2e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.888855  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  30.16 
 
 		 433 aa  224  3e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  31.98 
 
 		 439 aa  223  4e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  31.05 
 
 		 433 aa  223  4.9999999999999996e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  31.05 
 
 		 434 aa  223  6e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5526  phenylacetate-CoA ligase  34.3 
 
 		 449 aa  223  6e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0759485  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2152  Phenylacetate--CoA ligase  32.66 
 
 		 446 aa  223  8e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65736  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3367  phenylacetate-CoA ligase  33.26 
 
 		 443 aa  222  9e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322757  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2322  Phenylacetate--CoA ligase  31.35 
 
 		 449 aa  221  9.999999999999999e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3165  phenylacetate-CoA ligase  32.34 
 
 		 434 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0404023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  30.16 
 
 		 433 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  31.98 
 
 		 434 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1754  phenylacetate--CoA ligase  31.31 
 
 		 435 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384873  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0409  Phenylacetate--CoA ligase  32.17 
 
 		 447 aa  221  3e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0103532 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1976  phenylacetate-CoA ligase  33.11 
 
 		 437 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1729  phenylacetate-CoA ligase  32.06 
 
 		 433 aa  220  5e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  30.86 
 
 		 439 aa  219  7.999999999999999e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  30.82 
 
 		 434 aa  219  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000365841 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0986  phenylacetate-CoA ligase  34.47 
 
 		 435 aa  219  1e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.337709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  29.41 
 
 		 433 aa  218  1e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0797  Phenylacetate--CoA ligase  31.51 
 
 		 433 aa  218  2e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1456  phenylacetate-CoA ligase  31.83 
 
 		 433 aa  218  2e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.386345 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  31.96 
 
 		 435 aa  218  2e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000376262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5775  phenylacetate-CoA ligase  34.39 
 
 		 440 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3839  phenylacetate-CoA ligase  33.94 
 
 		 440 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0383671  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4529  phenylacetate-CoA ligase  33.94 
 
 		 440 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0652745  normal  0.906833 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0039  phenylacetate--CoA ligase  33.94 
 
 		 441 aa  218  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.728722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2904  phenylacetate-CoA ligase  32.35 
 
 		 432 aa  217  4e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0773804  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>