36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2404 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2404  hypothetical protein  100 
 
 		 306 aa  622  1e-177  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.839065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2176  hypothetical protein  94.75 
 
 		 306 aa  593  1e-168  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.19482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2871  hypothetical protein  85.57 
 
 		 306 aa  548  1e-155  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199374  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0933  hypothetical protein  86.56 
 
 		 284 aa  528  1e-149  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0874  hypothetical protein  51.64 
 
 		 330 aa  295  6e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.801729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0904  hypothetical protein  51.64 
 
 		 330 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472436  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0425  hypothetical protein  51.64 
 
 		 330 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1162  hypothetical protein  50.83 
 
 		 304 aa  286  2e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4370  hypothetical protein  50 
 
 		 307 aa  284  1.0000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0962975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1562  hypothetical protein  50.68 
 
 		 306 aa  281  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.252328  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25120  hypothetical protein  77.06 
 
 		 304 aa  278  7e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6035  hypothetical protein  48.2 
 
 		 316 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0348  hypothetical protein  45.52 
 
 		 304 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.975914  normal  0.279252 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1964  hypothetical protein  41.47 
 
 		 305 aa  215  5.9999999999999996e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0455905 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1976  hypothetical protein  44.6 
 
 		 307 aa  215  7e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4611  hypothetical protein  43.24 
 
 		 310 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.626183  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4769  hypothetical protein  43.86 
 
 		 307 aa  211  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.184998  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1199  hypothetical protein  37.05 
 
 		 308 aa  203  3e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000000053087  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1991  hypothetical protein  37.67 
 
 		 311 aa  189  5e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.061979  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1880  hypothetical protein  37.33 
 
 		 311 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.118335  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0439  hypothetical protein  43.06 
 
 		 305 aa  183  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0688498  normal  0.363441 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3364  hypothetical protein  38.16 
 
 		 315 aa  163  3e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.041289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6591  hypothetical protein  37.46 
 
 		 318 aa  156  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0570  hypothetical protein  44.37 
 
 		 199 aa  112  6e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1141  hypothetical protein  33.06 
 
 		 146 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6340  hypothetical protein  62.3 
 
 		 65 aa  70.9  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.932896  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0196  hypothetical protein  32.92 
 
 		 320 aa  67  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11430  protein of unknown function (DUF1814)  29.52 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.442396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0514  hypothetical protein  28.65 
 
 		 256 aa  53.9  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.583693  normal  0.38508 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0068  hypothetical protein  24.62 
 
 		 291 aa  52  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0784  hypothetical protein  60.98 
 
 		 84 aa  51.2  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0191  Domain of unknown function DUF1814  29.55 
 
 		 250 aa  48.9  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.233104  hitchhiker  0.00266112 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0715  hypothetical protein  26.92 
 
 		 277 aa  47.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0102185 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3801  hypothetical protein  26.76 
 
 		 259 aa  45.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0441026  normal  0.572466 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2735  hypothetical protein  29.52 
 
 		 147 aa  44.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.342457 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0261  hypothetical protein  27.75 
 
 		 271 aa  44.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>