43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1715 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1715  uncharacterized ABC-type transport system permease component-like protein  100 
 
 		 177 aa  335  9.999999999999999e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4269  exopolysaccharide synthesis ExoD  32.54 
 
 		 200 aa  76.3  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.528198  decreased coverage  0.0088823 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1827  exopolysaccharide synthesis, ExoD  32.32 
 
 		 227 aa  70.9  0.000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1027  Exopolysaccharide synthesis ExoD  28.05 
 
 		 220 aa  67  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.494207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1368  exopolysaccharide synthesis protein  26.58 
 
 		 200 aa  67  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0481317  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1428  exopolysaccharide synthesis protein ExoD  26.58 
 
 		 200 aa  67  0.0000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3452  Exopolysaccharide synthesis ExoD  29.81 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2869  exopolysaccharide synthesis, ExoD  33.33 
 
 		 220 aa  65.1  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3754  Exopolysaccharide synthesis ExoD  28.57 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0369  exopolysaccharide synthesis, ExoD  30.99 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2841  Exopolysaccharide synthesis ExoD  27.93 
 
 		 316 aa  59.3  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.61734 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4959  exopolysaccharide synthesis ExoD  31.18 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.938152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1022  exopolysaccharide synthesis, ExoD  26.9 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0915242 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2866  Exopolysaccharide synthesis ExoD  34.19 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2728  Exopolysaccharide synthesis ExoD  25.95 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0212409 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1096  hypothetical protein  24.83 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2415  Exopolysaccharide synthesis ExoD  27.87 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2365  Exopolysaccharide synthesis ExoD  27.87 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1479  exopolysaccharide synthesis ExoD  26.11 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.438541  normal  0.222219 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1099  hypothetical protein  24.16 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3870  uncharacterized ABC-type transport system permease protein  29.37 
 
 		 212 aa  53.1  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0769  exopolysaccharide synthesis protein  23.84 
 
 		 209 aa  53.1  0.000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0140556  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4382  Exopolysaccharide synthesis ExoD  26.67 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0680521 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2622  exopolysaccharide synthesis, ExoD  25.43 
 
 		 208 aa  52  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.512151  normal  0.293711 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01796  Exopolysaccharide synthesis, ExoD  30 
 
 		 191 aa  52  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0457786  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5360  hypothetical protein  33.57 
 
 		 317 aa  51.6  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290755  hitchhiker  0.00309893 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2346  exopolysaccharide synthesis, ExoD  32.12 
 
 		 210 aa  51.6  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5009  exoD protein  34.32 
 
 		 212 aa  51.6  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0307  exopolysaccharide synthesis, ExoD  24.52 
 
 		 209 aa  49.7  0.00002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2945  exopolysaccharide synthesis, ExoD  34.64 
 
 		 251 aa  49.3  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0152237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4949  Exopolysaccharide synthesis ExoD  22.14 
 
 		 198 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.811076 
 
 
-
 
NC_002978  WD0151  exopolysaccharide synthesis protein ExoD-related protein  23.03 
 
 		 218 aa  46.6  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2731  exopolysaccharide synthesis, ExoD  49.02 
 
 		 214 aa  47  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176932  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0150  exopolysaccharide synthesis protein ExoD-related protein  21.99 
 
 		 218 aa  45.4  0.0004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4288  exopolysaccharide synthesis protein, putative  31.94 
 
 		 210 aa  45.1  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3786  Exopolysaccharide synthesis ExoD  29.17 
 
 		 220 aa  44.7  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.232502  normal  0.886093 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0209  exopolysaccharide synthesis protein  25.66 
 
 		 198 aa  44.3  0.001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.742112  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2501  exopolysaccharide synthesis, ExoD  33.04 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00116546  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1981  ABC transporter permease  24.67 
 
 		 191 aa  43.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.328917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1687  exopolysaccharide synthesis ExoD  26.24 
 
 		 313 aa  42  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.882846 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2195  exopolysaccharide synthesis ExoD  29.17 
 
 		 202 aa  41.6  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1212  Exopolysaccharide synthesis ExoD  23.68 
 
 		 201 aa  40.8  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1242  Exopolysaccharide synthesis ExoD  23.68 
 
 		 201 aa  40.8  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.345513 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>