47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2186 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2186  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
377 aa  781    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4909  group 1 glycosyl transferase  21.89 
 
 
364 aa  77.4  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3679  glycosyl transferase group 1  22.79 
 
 
375 aa  64.3  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.568294 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1188  glycosyl transferase, group 1  22.22 
 
 
360 aa  60.5  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3116  glycosyl transferase group 1  21.65 
 
 
377 aa  59.7  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.304233 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1032  glycosyl transferase group 1  23.93 
 
 
390 aa  59.7  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0821  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 
351 aa  58.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.534399  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4124  glycosyl transferase, group 1  22.33 
 
 
349 aa  58.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1868  glycosyl transferase  23.2 
 
 
375 aa  53.1  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1073  glycosyl transferase, group 1  24.86 
 
 
1261 aa  52.4  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2856  glycosyl transferase, group 1  24.77 
 
 
388 aa  51.6  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.258995 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1696  glycosyl transferase group 1  25.68 
 
 
406 aa  51.6  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1496  glycosyl transferase, group 1  23.67 
 
 
364 aa  50.4  0.00005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.476221  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3023  glycosyl transferase, group 1  26.37 
 
 
385 aa  50.1  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1008  glycosyl transferase group 1  21.46 
 
 
353 aa  49.7  0.00008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000479257  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2015  glycosyl transferase, group 1  21.74 
 
 
382 aa  48.5  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0395  glycosyl transferase group 1  22.45 
 
 
378 aa  48.9  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.988234  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0474  glycosyl transferase, group 1  23.43 
 
 
376 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249061  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01298  predicted glycosyltransferase  20.13 
 
 
361 aa  48.1  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.65788  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1160  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.77 
 
 
383 aa  48.1  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.121321  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2160  glycosyl transferase, group 1  27.05 
 
 
461 aa  47.8  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.355932  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3496  Zinc carboxypeptidase A metalloprotease (M14)  23.14 
 
 
503 aa  47  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0241  lipopolysaccharide transferase family protein  26.45 
 
 
384 aa  47  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  19.88 
 
 
423 aa  47.4  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0683  glycosyl transferase, group 1  23.01 
 
 
482 aa  47  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0144645  normal  0.0442463 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  23.71 
 
 
381 aa  47  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4992  glycosyl transferase group 1  24.6 
 
 
376 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1369  hypothetical protein  23.49 
 
 
335 aa  46.6  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0255  glycosyl transferase group 1  26.15 
 
 
358 aa  46.6  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4943  glycosyl transferase, putative  21.45 
 
 
376 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2282  glycosyl transferase group 1  25.35 
 
 
381 aa  46.2  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.823032  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4492  glycosyl transferase group 1  24.09 
 
 
399 aa  46.2  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0132524  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1688  glycosyl transferase, group 1  17.97 
 
 
400 aa  45.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3140  zinc carboxypeptidase A metalloprotease (M14)  22.31 
 
 
357 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0299032 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1370  glycosyl transferase, group 1 family protein  21 
 
 
373 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165091  normal  0.289041 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2757  glycosyl transferase group 1  26.06 
 
 
400 aa  45.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.164612  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0525  glycosyl transferase group 1  23.26 
 
 
376 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.566558  normal  0.175968 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  26.34 
 
 
375 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4815  glycosyl transferase, group 1  21.33 
 
 
376 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  26.23 
 
 
402 aa  45.1  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71920  glycosyltransferase WbpY  26.34 
 
 
375 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0965  glycosyl transferase, group 1  21.74 
 
 
398 aa  45.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.699884  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4450  GumI protein  24.64 
 
 
350 aa  43.9  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0627  UDP-N-acetylglucosamine  24.35 
 
 
438 aa  43.5  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2400  glycosyl transferase, group 1  27.03 
 
 
452 aa  43.5  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2571  glycosyl transferase group 1  23.35 
 
 
386 aa  43.5  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4250  glycosyl transferase group 1  22.38 
 
 
388 aa  42.7  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.142252  normal  0.104385 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>