37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0763 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0763  hypothetical protein  100 
 
 
177 aa  325  2.0000000000000001e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0552714  normal  0.074634 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1269  hypothetical protein  62.86 
 
 
185 aa  221  3e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.637458  normal  0.552236 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1156  hypothetical protein  49.01 
 
 
194 aa  137  1e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.149709  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0444  hypothetical protein  37.34 
 
 
184 aa  105  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2413  hypothetical protein  39.62 
 
 
189 aa  78.2  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0389455 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7679  hypothetical protein  32 
 
 
185 aa  66.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1436  hypothetical protein  32.02 
 
 
210 aa  65.9  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.341725  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2302  hypothetical protein  24.44 
 
 
203 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0620  hypothetical protein  23.33 
 
 
203 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.286873 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0749  hypothetical protein  36.42 
 
 
182 aa  59.7  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.204805 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1163  hypothetical protein  22.78 
 
 
203 aa  57.4  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.242998  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0641  hypothetical protein  27.91 
 
 
182 aa  56.6  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1205  hypothetical protein  27.42 
 
 
208 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.39038  normal  0.418544 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0311  hypothetical protein  27.87 
 
 
207 aa  54.3  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.773139  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6196  hypothetical protein  26.59 
 
 
186 aa  54.3  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4892  hypothetical protein  29.31 
 
 
194 aa  53.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1255  hypothetical protein  26.52 
 
 
219 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.390712 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1416  hypothetical protein  26.52 
 
 
219 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.336817 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71390  hypothetical protein  26.16 
 
 
186 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2447  hypothetical protein  27.91 
 
 
193 aa  52.4  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.632564  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3322  hypothetical protein  28.74 
 
 
208 aa  52  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552455  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3835  hypothetical protein  26.74 
 
 
190 aa  51.6  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3375  protein of unknown function DUF308 membrane  29.48 
 
 
192 aa  50.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00523019  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0213  hypothetical protein  27.91 
 
 
179 aa  50.4  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4031  protein of unknown function DUF308 membrane  32.94 
 
 
196 aa  50.4  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3822  hypothetical protein  27.17 
 
 
183 aa  50.1  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108994  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2295  hypothetical protein  27.62 
 
 
207 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.357303  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4468  hypothetical protein  23.16 
 
 
215 aa  48.5  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.075562  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0940  protein of unknown function DUF308 membrane  28.82 
 
 
192 aa  47.8  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315068  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5490  hypothetical protein  31.01 
 
 
191 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2504  hypothetical protein  30.32 
 
 
244 aa  46.2  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0379278  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5301  hypothetical protein  25 
 
 
186 aa  46.2  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0585  protein of unknown function DUF308 membrane  25.29 
 
 
228 aa  45.8  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7805  hypothetical protein  22.16 
 
 
204 aa  44.7  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0167986  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0410  hypothetical protein  22.78 
 
 
206 aa  44.7  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.144489  normal  0.754821 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0332  hypothetical protein  25.75 
 
 
177 aa  43.1  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2690  hypothetical protein  27.27 
 
 
203 aa  41.6  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>