More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5671 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_5671  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 
343 aa  684    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2124  L-idonate 5-dehydrogenase, NAD-binding  67.06 
 
 
343 aa  457  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0948  putative L-idonate 5-dehydrogenase oxidoreductase protein  58.31 
 
 
344 aa  404  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.593328 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5030  zinc-binding dehydrogenase  57.73 
 
 
343 aa  404  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.959168  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4509  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  58.31 
 
 
343 aa  401  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6416  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  57.73 
 
 
343 aa  401  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.124082  normal  0.304265 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3728  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  57.65 
 
 
352 aa  391  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.854934  normal  0.447633 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0159  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  57.65 
 
 
347 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.306594  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0609  alcohol dehydrogenase  57.65 
 
 
352 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0295083  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0642  alcohol dehydrogenase  57.65 
 
 
352 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3340  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  55.88 
 
 
356 aa  385  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3621  alcohol dehydrogenase  56.1 
 
 
347 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5333  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  55.81 
 
 
345 aa  376  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0397204  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4094  alcohol dehydrogenase  50.29 
 
 
358 aa  349  3e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.958788  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3685  alcohol dehydrogenase  54.14 
 
 
347 aa  346  3e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.112233 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4771  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  53.25 
 
 
344 aa  345  5e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.107599 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5063  alcohol dehydrogenase  53.85 
 
 
347 aa  340  2.9999999999999998e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.724577  normal  0.863659 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4821  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  53.55 
 
 
344 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111851  normal  0.477759 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3523  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  51.9 
 
 
349 aa  333  2e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.538037  normal  0.114116 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1590  alcohol dehydrogenase  51.31 
 
 
342 aa  317  2e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00466455  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4724  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.84 
 
 
348 aa  316  4e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.383474  normal  0.446449 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2436  alcohol dehydrogenase  47.54 
 
 
345 aa  315  5e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3565  alcohol dehydrogenase  46.67 
 
 
345 aa  298  1e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2879  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.59 
 
 
345 aa  294  2e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.268542  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1538  L-idonate 5-dehydrogenase  43.79 
 
 
347 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04133  L-idonate 5-dehydrogenase, NAD-binding  44.97 
 
 
343 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3730  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.97 
 
 
343 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4523  L-idonate 5-dehydrogenase  44.97 
 
 
343 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0181227  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04097  hypothetical protein  44.97 
 
 
343 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4748  L-idonate 5-dehydrogenase  44.62 
 
 
343 aa  272  7e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1915  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  48.51 
 
 
349 aa  271  2e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.482777  normal  0.264492 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3287  L-idonate 5-dehydrogenase  40.52 
 
 
344 aa  268  1e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0221  L-idonate 5-dehydrogenase  43.67 
 
 
343 aa  265  5.999999999999999e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4739  L-idonate 5-dehydrogenase  41.82 
 
 
343 aa  263  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.130148 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4769  L-idonate 5-dehydrogenase  41.82 
 
 
343 aa  262  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0966138  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4888  L-idonate 5-dehydrogenase  41.82 
 
 
343 aa  263  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.138899  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4869  L-idonate 5-dehydrogenase  41.82 
 
 
343 aa  262  6.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0951463 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4832  L-idonate 5-dehydrogenase  41.82 
 
 
343 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0944  L-idonate 5-dehydrogenase  42.01 
 
 
350 aa  258  1e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.272351  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3545  alcohol dehydrogenase  44.22 
 
 
345 aa  253  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.715464  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0472  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.81 
 
 
368 aa  207  2e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2451  alcohol dehydrogenase  40.29 
 
 
355 aa  205  8e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5057  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.86 
 
 
340 aa  201  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.73696  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1003  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.84 
 
 
342 aa  200  3e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.124693 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3492  hypothetical protein  39.24 
 
 
342 aa  199  7e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835811  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2793  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.82 
 
 
356 aa  199  7e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630976  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2056  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.09 
 
 
342 aa  199  7.999999999999999e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20290  xylitol dehydrogeanse  38.68 
 
 
347 aa  198  9e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.92253  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02400  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  38.15 
 
 
345 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.242832  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16590  xylitol dehydrogenase, zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  38.22 
 
 
346 aa  198  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6746  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.13 
 
 
347 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270529  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5833  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.16 
 
 
347 aa  197  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.119386  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0836  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.51 
 
 
347 aa  197  3e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2786  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  37.06 
 
 
341 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2830  alcohol dehydrogenase  37.06 
 
 
341 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.782331  normal  0.335133 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3277  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.46 
 
 
345 aa  195  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28190  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  37.17 
 
 
345 aa  195  1e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2330  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.26 
 
 
352 aa  194  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.752502  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2813  alcohol dehydrogenase  36.76 
 
 
341 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0594163  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0849  alcohol dehydrogenase  38.58 
 
 
344 aa  194  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0438742 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3810  alcohol dehydrogenase  35.45 
 
 
348 aa  193  3e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0863215  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10900  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  37.54 
 
 
352 aa  193  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.867442  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09064  hypothetical protein similar to xylitol dehydrogenase (Broad)  34.04 
 
 
359 aa  192  5e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.715081 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1714  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.88 
 
 
352 aa  192  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2713  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.8 
 
 
333 aa  189  4e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02580  sorbitol dehydrogenase, putative  32.1 
 
 
416 aa  187  2e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2864  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.16 
 
 
359 aa  186  4e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01050  sorbitol dehydrogenase, putative  35.06 
 
 
379 aa  186  5e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.917438  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1000  putative alcohol dehydrogenase  37.54 
 
 
352 aa  186  7e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0252  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.61 
 
 
347 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1176  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  36.31 
 
 
344 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0136787  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21210  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  38.06 
 
 
336 aa  179  5.999999999999999e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3068  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.45 
 
 
344 aa  179  9e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558038  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5001  alcohol dehydrogenase  36.11 
 
 
373 aa  179  9e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0351  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  35.45 
 
 
344 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.773676  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1076  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  35.45 
 
 
344 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.444364  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1235  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  35.45 
 
 
344 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.355726  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1742  D-xylulose reductase  35.45 
 
 
344 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.247806  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2061  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  34.95 
 
 
339 aa  178  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0068  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  35.45 
 
 
344 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.493904  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1653  putative D-xylulose reductase  35.45 
 
 
344 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0234  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  35.45 
 
 
344 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2013  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.26 
 
 
344 aa  177  2e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.238084  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5133  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.72 
 
 
373 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5726  alcohol dehydrogenase  36.72 
 
 
373 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4382  alcohol dehydrogenase  35.73 
 
 
344 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2609  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.01 
 
 
348 aa  177  3e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5063  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.73 
 
 
344 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.392538  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4497  alcohol dehydrogenase  36.72 
 
 
373 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5797  alcohol dehydrogenase  35.73 
 
 
344 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0202299  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2163  alcohol dehydrogenase  35.82 
 
 
345 aa  177  3e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01090  xylitol dehydrogenase, putative  34.9 
 
 
375 aa  176  5e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2131  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.73 
 
 
349 aa  176  6e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3230  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.6 
 
 
346 aa  175  9.999999999999999e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.282549  normal  0.671349 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2341  alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
348 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.231034 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.26 
 
 
373 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3580  hypothetical protein  34.29 
 
 
350 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.885973 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2189  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.58 
 
 
346 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0551  D-xylulose reductase  36.13 
 
 
347 aa  172  5e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0173  alcohol dehydrogenase  33.24 
 
 
337 aa  173  5e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.976128  normal  0.272839 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>