294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2187 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2187  preprotein translocase, YajC subunit  100 
 
 		 111 aa  217  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.548502  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2490  preprotein translocase, YajC subunit  94.59 
 
 		 111 aa  186  8e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.284595 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4599  preprotein translocase, YajC subunit  78.38 
 
 		 110 aa  174  5e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0858963  normal  0.19415 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4229  preprotein translocase, YajC subunit  78.38 
 
 		 110 aa  174  5e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2777  preprotein translocase, YajC subunit  60.55 
 
 		 144 aa  147  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.209285  normal  0.314245 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4748  preprotein translocase, YajC subunit  79.12 
 
 		 110 aa  147  6e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0608539 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4407  protein translocase subunit yajC  60.91 
 
 		 118 aa  142  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.201974 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1000  preprotein translocase, YajC subunit  66.97 
 
 		 111 aa  140  4e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.492649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1798  preprotein translocase, YajC subunit  58.18 
 
 		 133 aa  140  8e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.225845  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2275  preprotein translocase, YajC subunit  72.07 
 
 		 110 aa  137  6e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2854  preprotein translocase, YajC subunit  61.61 
 
 		 114 aa  137  7e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134392 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1770  preprotein translocase subunit, YajC  57.01 
 
 		 133 aa  135  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.131308  decreased coverage  0.00406868 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2337  preprotein translocase, YajC subunit  58.88 
 
 		 113 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.539902  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0890  preprotein translocase, YajC subunit  57.01 
 
 		 113 aa  132  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0886  preprotein translocase, YajC subunit  57.01 
 
 		 113 aa  132  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1173  preprotein translocase, YajC subunit  55.96 
 
 		 110 aa  131  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441411  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4308  preprotein translocase, YajC subunit  65.14 
 
 		 115 aa  129  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2778  preprotein translocase, YajC subunit  59.26 
 
 		 146 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414643  normal  0.627651 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3173  preprotein translocase, YajC subunit  61.29 
 
 		 146 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.407254  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2733  preprotein translocase, YajC subunit  57.8 
 
 		 142 aa  126  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1495  preprotein translocase, YajC subunit  51.3 
 
 		 115 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.528936 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3035  preprotein translocase, YajC subunit  53 
 
 		 104 aa  111  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0995  protein translocase subunit yajC  54.55 
 
 		 94 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  50.46 
 
 		 143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1797  protein translocase subunit yajC  53.33 
 
 		 111 aa  107  7.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.422373  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1083  protein translocase subunit yajC  54.65 
 
 		 93 aa  107  8.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.452709  normal  0.0755092 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0523  preprotein translocase, YajC subunit  55.29 
 
 		 154 aa  106  9.000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0455  preprotein translocase, YajC subunit  55.17 
 
 		 109 aa  102  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0666222  normal  0.0413698 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1860  preprotein translocase subunit  54.76 
 
 		 105 aa  101  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529455  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2659  preprotein tranlocase protein  49 
 
 		 123 aa  102  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.32408  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3109  preprotein translocase, YajC subunit  51.65 
 
 		 102 aa  101  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.173268 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1797  protein translocase subunit yajC  52.87 
 
 		 108 aa  100  7e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.188227  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0443  preprotein translocase, YajC subunit  52.87 
 
 		 108 aa  100  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0153138  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1693  preprotein translocase, YajC subunit  49.57 
 
 		 115 aa  95.5  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3213  protein translocase subunit yajC  40.52 
 
 		 133 aa  95.5  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0534  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 		 123 aa  94.7  4e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  39.25 
 
 		 106 aa  92  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0394  preprotein translocase, YajC subunit  42.45 
 
 		 126 aa  92.4  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.918235  normal  0.672603 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  40.38 
 
 		 107 aa  91.7  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  40.38 
 
 		 107 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  40.38 
 
 		 107 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  40.38 
 
 		 107 aa  91.7  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  40.38 
 
 		 107 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  40.38 
 
 		 107 aa  91.7  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1452  protein translocase subunit yajC  50 
 
 		 112 aa  90.5  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1417  preprotein translocase, YajC subunit  45.98 
 
 		 110 aa  90.5  7e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  39.42 
 
 		 107 aa  90.5  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1008  preprotein translocase, YajC subunit  38.1 
 
 		 125 aa  90.1  1e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.868301  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  38.46 
 
 		 109 aa  88.2  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1900  protein translocase subunit yajC  41.18 
 
 		 113 aa  87.8  5e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.743684  normal  0.257956 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1115  preprotein translocase, YajC subunit  38.46 
 
 		 120 aa  87.4  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.242644  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1715  preprotein translocase, YajC subunit  48.84 
 
 		 178 aa  86.3  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3279  preprotein translocase subunit YajC  39.05 
 
 		 108 aa  85.9  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.198543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0343  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 		 127 aa  85.9  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23698 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0276  protein translocase subunit yajC  41.11 
 
 		 108 aa  85.5  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.865381  normal  0.0326765 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2646  preprotein translocase, YajC subunit  36.19 
 
 		 108 aa  84.3  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808918  hitchhiker  0.00137205 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0700  preprotein translocase subunit YajC  36.54 
 
 		 109 aa  84  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 		 143 aa  84  6e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000092041  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  36.54 
 
 		 120 aa  84  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2834  protein translocase subunit yajC  43.81 
 
 		 109 aa  84  6e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1698  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 		 123 aa  82.4  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2483  preprotein translocase subunit YajC  32.41 
 
 		 110 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000329003  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4645  protein translocase subunit yajC  40.96 
 
 		 91 aa  81.3  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3356  preprotein translocase, YajC subunit  40.96 
 
 		 110 aa  81.3  0.000000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4006  protein translocase subunit yajC  40.96 
 
 		 109 aa  80.9  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0839  preprotein translocase, YajC subunit  38.71 
 
 		 111 aa  80.9  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2806  preprotein translocase subunit YajC  31.48 
 
 		 110 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000242137  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2881  preprotein translocase subunit YajC  31.48 
 
 		 110 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000118136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1277  preprotein translocase subunit YajC  37.21 
 
 		 108 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1571  preprotein translocase subunit YajC  31.48 
 
 		 110 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000298712  hitchhiker  0.0000000623922 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2786  preprotein translocase subunit YajC  31.48 
 
 		 110 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000416487  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3112  preprotein translocase subunit YajC  32.41 
 
 		 110 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1383  preprotein translocase subunit YajC  32.41 
 
 		 110 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000313492  hitchhiker  0.00000720992 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1799  preprotein translocase, YajC subunit  40.96 
 
 		 107 aa  80.5  0.000000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.675653  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  37.21 
 
 		 108 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  37.21 
 
 		 108 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  37.21 
 
 		 108 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3372  preprotein translocase subunit YajC  37.21 
 
 		 108 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0302  preprotein translocase subunit YajC  37.21 
 
 		 108 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  37.21 
 
 		 108 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  37.21 
 
 		 108 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2298  preprotein translocase, YajC subunit  37.78 
 
 		 118 aa  78.6  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000341875  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1893  preprotein translocase, YajC subunit  46.84 
 
 		 103 aa  79.3  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.49225e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0853  protein translocase subunit yajC  38.14 
 
 		 106 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2067  preprotein translocase, YajC subunit  47.44 
 
 		 109 aa  79  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2618  preprotein translocase, YajC subunit  38.75 
 
 		 106 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1716  preprotein translocase, YajC subunit  38.64 
 
 		 111 aa  78.2  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.741067 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2058  preprotein translocase, YajC subunit  38.64 
 
 		 111 aa  78.2  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.674684  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1332  preprotein translocase, YajC subunit  37.14 
 
 		 111 aa  78.2  0.00000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0235382  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1471  preprotein translocase subunit YajC  33.33 
 
 		 110 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000169079  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2458  protein translocase subunit yajC  33.33 
 
 		 117 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107187  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1240  preprotein translocase, YajC subunit  42.68 
 
 		 114 aa  77.4  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.659198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1304  preprotein translocase, YajC subunit  42.17 
 
 		 109 aa  77  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2183  preprotein translocase, YajC subunit  40.91 
 
 		 113 aa  77  0.00000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3408  preprotein translocase subunit YajC  40.7 
 
 		 108 aa  77  0.00000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.327995  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0446  preprotein translocase subunit YajC  41.84 
 
 		 110 aa  76.6  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0445  preprotein translocase subunit YajC  41.84 
 
 		 110 aa  76.6  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0452  preprotein translocase subunit YajC  41.84 
 
 		 110 aa  76.6  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.654019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0506  preprotein translocase subunit YajC  41.84 
 
 		 110 aa  76.6  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0465  preprotein translocase subunit YajC  41.84 
 
 		 110 aa  76.6  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>