More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1633 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_1633  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 
410 aa  815    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  53.83 
 
 
404 aa  388  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  53.05 
 
 
404 aa  380  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  52.81 
 
 
422 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  52.55 
 
 
404 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  51.53 
 
 
404 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6277  monooxygenase FAD-binding  52.24 
 
 
405 aa  366  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146167  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  37.5 
 
 
391 aa  241  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  36.84 
 
 
396 aa  233  5e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4207  salicylate 1-monooxygenase  39.59 
 
 
406 aa  224  2e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  36.68 
 
 
403 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  35.75 
 
 
386 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  36.43 
 
 
385 aa  211  2e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  37.74 
 
 
397 aa  209  5e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  34.69 
 
 
421 aa  207  4e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5419  salicylate 1-monooxygenase  39.57 
 
 
395 aa  206  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00608306  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  34.52 
 
 
402 aa  206  6e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2182  monooxygenase, FAD-binding  40.93 
 
 
412 aa  203  4e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  33.24 
 
 
377 aa  202  6e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3927  salicylate 1-monooxygenase  34.78 
 
 
385 aa  200  3.9999999999999996e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.0279633 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3149  salicylate 1-monooxygenase  37.63 
 
 
398 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.136472  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1853  monooxygenase FAD-binding  33.91 
 
 
385 aa  196  6e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2140  monooxygenase FAD-binding  34.43 
 
 
382 aa  196  7e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2131  salicylate 1-monooxygenase  38.36 
 
 
400 aa  195  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2584  monooxygenase, FAD-binding  37.97 
 
 
400 aa  193  4e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613825  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2515  salicylate 1-monooxygenase  33.15 
 
 
386 aa  192  6e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4547  monooxygenase FAD-binding  34.16 
 
 
385 aa  192  7e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3662  monooxygenase, FAD-binding  33.71 
 
 
395 aa  192  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555838  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0923  monooxygenase FAD-binding  37.25 
 
 
412 aa  191  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.264093 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3231  monooxygenase FAD-binding  38.21 
 
 
400 aa  190  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3579  monooxygenase FAD-binding  33.67 
 
 
382 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.817981 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1893  monooxygenase, FAD-binding  33.33 
 
 
382 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3944  salicylate hydroxylase  33.5 
 
 
382 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0448295  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6042  monooxygenase FAD-binding  32.36 
 
 
378 aa  187  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233658  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0982  monooxygenase FAD-binding  37.57 
 
 
399 aa  184  3e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0183396 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3162  monooxygenase FAD-binding  32.94 
 
 
387 aa  183  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2311  monooxygenase FAD-binding  32.97 
 
 
383 aa  181  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5237  putative salicylate 1-monooxygenase  38.99 
 
 
399 aa  181  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.192496 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2253  monooxygenase FAD-binding protein  32.17 
 
 
401 aa  180  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4324  salicylate 1-monooxygenase  32.78 
 
 
385 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524787  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4042  salicylate 1-monooxygenase  32.78 
 
 
385 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00369253  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3483  monooxygenase FAD-binding  32.51 
 
 
385 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147662 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2055  monooxygenase, FAD-binding  33.62 
 
 
416 aa  177  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6459  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1762  monooxygenase FAD-binding  35.52 
 
 
384 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.638414  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1565  monooxygenase FAD-binding  35.1 
 
 
384 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156985 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6859  FAD dependent oxidoreductase  34.04 
 
 
420 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.87929 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1885  putative salicylate hydroxylase  35.85 
 
 
389 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122899  normal  0.226674 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0481  salicylate 1-monooxygenase  34.13 
 
 
373 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2905  monooxygenase FAD-binding  35.19 
 
 
381 aa  174  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00589473 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3292  salicylate 1-monooxygenase  37.8 
 
 
404 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0110847 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0310  monooxygenase FAD-binding protein  36.27 
 
 
309 aa  169  6e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0496808  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3586  salicylate 1-monooxygenase  31.39 
 
 
427 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.942873 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3612  monooxygenase FAD-binding  34.44 
 
 
430 aa  167  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0302868  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50409  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  29.72 
 
 
447 aa  166  5e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0406434 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20710  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  33.25 
 
 
414 aa  166  6.9999999999999995e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336211  normal  0.159251 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2172  monooxygenase, FAD-binding  30.9 
 
 
413 aa  164  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0762  monooxygenase FAD-binding  31.01 
 
 
421 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121092 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1110  monooxygenase FAD-binding  33.92 
 
 
389 aa  163  5.0000000000000005e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7504  normal  0.659993 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02114  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05260)  31.36 
 
 
448 aa  163  6e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  34.6 
 
 
373 aa  160  4e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3920  monooxygenase FAD-binding  37 
 
 
397 aa  160  6e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1886  salicylate hydroxylase  31.52 
 
 
402 aa  159  8e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1117  monooxygenase, FAD-binding  31.74 
 
 
399 aa  158  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56402  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  28.23 
 
 
426 aa  157  4e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.476468  normal  0.198075 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0052  monooxygenase, FAD-binding  31.32 
 
 
413 aa  156  6e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31126  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  28.76 
 
 
411 aa  155  1e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1154  monooxygenase, FAD-binding  35.08 
 
 
412 aa  155  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2962  monooxygenase FAD-binding protein  32.08 
 
 
397 aa  154  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4439  salicylate hydroxylase  30.79 
 
 
402 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0982291  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2160  monooxygenase FAD-binding  36.59 
 
 
395 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2480  monooxygenase FAD-binding  35.22 
 
 
395 aa  154  4e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1313  monooxygenase, FAD-binding  33.6 
 
 
391 aa  153  5e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2656  putative salicylate hydroxylase (salicylate 1-monooxygenase)  33.6 
 
 
391 aa  153  5e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1193  monooxygenase, FAD-binding  33.6 
 
 
390 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155257  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0871  salicylate hydroxylase  28.85 
 
 
422 aa  151  2e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0457769  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3144  salicylate hydroxylase  30.85 
 
 
400 aa  150  6e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.403778  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4148  salicylate hydroxylase  30.55 
 
 
402 aa  149  7e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0202605  normal  0.0490833 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3669  salicylate hydroxylase  31.3 
 
 
400 aa  148  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4218  salicylate hydroxylase  30.55 
 
 
402 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.820412  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3371  salicylate hydroxylase  30.37 
 
 
402 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0591709  normal  0.3753 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2203  monooxygenase FAD-binding  35.22 
 
 
395 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7505  monooxygenase FAD-binding  37.68 
 
 
407 aa  145  9e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.426443  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3703  salicylate hydroxylase  31.2 
 
 
402 aa  145  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0229464  normal  0.0740994 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0740  salicylate hydroxylase  31.28 
 
 
401 aa  145  1e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5319  monooxygenase FAD-binding protein  32.64 
 
 
390 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0746  salicylate hydroxylase  31.28 
 
 
401 aa  144  3e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3311  monooxygenase, FAD-binding  29.92 
 
 
401 aa  144  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0896  monooxygenase, FAD-binding  32.75 
 
 
389 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2414  salicylate hydroxylase  30.06 
 
 
397 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.285012  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2410  salicylate hydroxylase  29.48 
 
 
397 aa  141  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.228446  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2365  salicylate hydroxylase  29.48 
 
 
397 aa  141  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.602992  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2321  salicylate hydroxylase  29.48 
 
 
397 aa  141  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02033  conserved hypothetical protein  28.74 
 
 
435 aa  141  3e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.637061 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2522  salicylate hydroxylase  29.48 
 
 
397 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5278  monooxygenase, FAD-binding  30.23 
 
 
395 aa  140  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.630865 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05260  conserved hypothetical protein  26.37 
 
 
446 aa  140  4.999999999999999e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2680  monooxygenase, FAD-binding  30.93 
 
 
384 aa  140  4.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.156834  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2128  salicylate hydroxylase  30.41 
 
 
397 aa  139  6e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.453627  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3565  monooxygenase FAD-binding  30.25 
 
 
384 aa  139  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0355  salicylate hydroxylase  31.1 
 
 
427 aa  139  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>