More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4158 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_4158  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  100 
 
 
337 aa  678    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.119875  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0260  hypothetical protein  47.4 
 
 
329 aa  304  2.0000000000000002e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0255  hypothetical protein  46.79 
 
 
329 aa  300  2e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02215  cytochrome D ubiquinol oxidase, subunit II  45.48 
 
 
339 aa  294  1e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.262545  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0091  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  45.27 
 
 
338 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.243968  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4671  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  46.59 
 
 
334 aa  286  4e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.297118  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3926  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  48.05 
 
 
337 aa  281  8.000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3271  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  44.94 
 
 
335 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.327803  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4379  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  45.7 
 
 
334 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.811647  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1178  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  43.7 
 
 
335 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3377  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  43.49 
 
 
335 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13040  CioB, cyanide insensitive terminal oxidase  43.7 
 
 
335 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3951  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  43.49 
 
 
335 aa  277  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0963  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  43.79 
 
 
335 aa  276  2e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.238614  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0927  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  43.79 
 
 
335 aa  276  3e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.304728  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0929  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  43.79 
 
 
335 aa  276  4e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3210  quinol oxidase subunit II QxtB  43.79 
 
 
335 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2149  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  43.49 
 
 
335 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1464  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  44.84 
 
 
333 aa  273  2.0000000000000002e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.663367  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3131  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  42.77 
 
 
336 aa  274  2.0000000000000002e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.305422 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3857  hypothetical protein  43.49 
 
 
335 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.346842  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0913  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  43.24 
 
 
335 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1251  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  43.88 
 
 
347 aa  273  3e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3450  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  42.9 
 
 
335 aa  273  3e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000388  putative Cytochrome bd2 subunit II  43.24 
 
 
335 aa  273  4.0000000000000004e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3152  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  44.97 
 
 
335 aa  272  5.000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1516  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  43.36 
 
 
338 aa  273  5.000000000000001e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.475209  normal  0.900385 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3574  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  42.9 
 
 
335 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0902156 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1836  cyanide-insensitive terminal oxidase  43.2 
 
 
335 aa  272  7e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.077494  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0837  cyanide-insensitive terminal oxidase  43.2 
 
 
335 aa  272  7e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177421  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2101  cyanide-insensitive terminal oxidase  43.2 
 
 
335 aa  272  7e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1128  cyanide-insensitive terminal oxidase  43.2 
 
 
335 aa  272  7e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.852695  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2132  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  42.77 
 
 
336 aa  271  1e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.19324  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1769  cyanide-insensitive terminal oxidase  43.2 
 
 
335 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.211291  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1695  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  43.81 
 
 
338 aa  271  1e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0476582  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0334  cyanide-insensitive terminal oxidase CioB  43.2 
 
 
335 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0427  cyanide-insensitive terminal oxidase CioB  43.2 
 
 
335 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0170  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  46.45 
 
 
334 aa  270  2e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.96994 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0788  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  42.94 
 
 
335 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.470202  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3332  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  44.74 
 
 
335 aa  269  4e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.223334  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0707  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II (cydB, qxtB)  43.2 
 
 
336 aa  268  8.999999999999999e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4892  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  42.77 
 
 
335 aa  268  1e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4065  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  46.2 
 
 
334 aa  268  1e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508288  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5280  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  45.4 
 
 
334 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.797585  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1267  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  43.77 
 
 
334 aa  266  4e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.690113 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4281  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  43.86 
 
 
335 aa  266  5e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.207239  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0192  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  44.02 
 
 
337 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3592  Cytochrome bd type quinol oxidase subunit 2 protein  43.2 
 
 
334 aa  264  2e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.925835  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3839  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  39.64 
 
 
335 aa  264  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.425133  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0595  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  46.73 
 
 
336 aa  264  2e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173418  normal  0.217419 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5725  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  39.94 
 
 
335 aa  263  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31475  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6191  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  39.94 
 
 
335 aa  263  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4073  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  43.07 
 
 
336 aa  262  6.999999999999999e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.889217  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1786  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 2  44.21 
 
 
334 aa  261  8.999999999999999e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.703016  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1421  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  41.42 
 
 
335 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6408  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  41.42 
 
 
335 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4650  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  42.11 
 
 
335 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4647  cyanide-insensitive terminal oxidase CioB  43.57 
 
 
335 aa  261  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4852  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  44.08 
 
 
334 aa  261  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.285444  normal  0.0415092 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4644  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  42.11 
 
 
335 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.39866  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5401  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  40.24 
 
 
335 aa  260  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.117755  normal  0.0278093 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4512  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  41.81 
 
 
335 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.595783  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2528  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  43.07 
 
 
335 aa  260  2e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1811  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  43.79 
 
 
334 aa  261  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.890434  normal  0.117686 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0942  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  44.08 
 
 
335 aa  260  3e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.616376 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1086  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  44.08 
 
 
335 aa  260  3e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3306  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  44.67 
 
 
335 aa  259  6e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.167701 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6442  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  41.3 
 
 
335 aa  259  6e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.42498 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6969  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  40.83 
 
 
335 aa  258  8e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1026  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  44.18 
 
 
332 aa  258  1e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5684  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  41.3 
 
 
335 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.326794 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5131  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  43.24 
 
 
336 aa  257  2e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.555192 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4956  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit II  42.52 
 
 
335 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.545349  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2000  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  41.81 
 
 
333 aa  256  3e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.257779  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4142  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  42.94 
 
 
336 aa  256  4e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7067  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  41.12 
 
 
335 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.660644  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0120  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  39.94 
 
 
335 aa  256  5e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1473  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  42.18 
 
 
335 aa  256  5e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3833  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  42.65 
 
 
336 aa  256  5e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5119  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  43.98 
 
 
333 aa  256  6e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.187118 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5382  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  43.79 
 
 
335 aa  255  7e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4819  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  42.9 
 
 
335 aa  255  7e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4790  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  43.79 
 
 
335 aa  255  7e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5479  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  43.79 
 
 
335 aa  255  7e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0779913  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2643  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  41.35 
 
 
335 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5366  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  43.2 
 
 
335 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11040  Cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  42.18 
 
 
335 aa  253  3e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0174  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  43.2 
 
 
335 aa  253  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.153758 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2044  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  44.25 
 
 
333 aa  253  3e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4324  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  42.77 
 
 
334 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0713  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  45.32 
 
 
347 aa  251  8.000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.231723  normal  0.297933 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0702  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  45.32 
 
 
347 aa  251  8.000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00094  ubiquinol oxidase subunit II, cyanide insensitive  43.07 
 
 
333 aa  250  2e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.582622  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6551  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  39.94 
 
 
335 aa  249  5e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0675  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  45.02 
 
 
347 aa  249  5e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.340894 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4928  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  43.24 
 
 
335 aa  249  7e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000554234 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4100  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  42.48 
 
 
335 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00146207  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0401  cytochrome D ubiquinol oxidase subunit II  42.18 
 
 
336 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000259271 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0395  cytochrome D ubiquinol oxidase, subunit II  42.18 
 
 
336 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0413  cytochrome D ubiquinol oxidase subunit II  41.89 
 
 
336 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000306054 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>