More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4627 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_5215  acyl-CoA synthetase  83.06 
 
 		 549 aa  957    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13548  acyl-CoA synthetase  79.67 
 
 		 548 aa  909    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.89294e-46  hitchhiker  0.000000367112 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4627  acyl-CoA synthetase  100 
 
 		 549 aa  1125    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1543  acyl-CoA synthetase  79.78 
 
 		 549 aa  923    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5009  acyl-CoA synthetase  95.63 
 
 		 549 aa  1084    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4715  acyl-CoA synthetase  100 
 
 		 549 aa  1125    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3959  AMP-dependent synthetase and ligase  56.33 
 
 		 547 aa  624  1e-177  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.511333  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2836  acyl-CoA synthetase  54.93 
 
 		 539 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2639  acyl-CoA synthetase  54.1 
 
 		 540 aa  568  1e-161  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.981359  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2725  acyl-CoA synthetase  51.3 
 
 		 548 aa  533  1e-150  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.105793  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1485  CoA synthetase, long-chain fatty acid:CoA ligase  45.91 
 
 		 528 aa  451  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3980  AMP-dependent synthetase and ligase  44.74 
 
 		 526 aa  444  1e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2174  acyl-CoA synthetase  46.03 
 
 		 540 aa  439  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.264892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4748  AMP-dependent synthetase and ligase  45.28 
 
 		 528 aa  422  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3496  AMP-dependent synthetase and ligase  42.5 
 
 		 544 aa  411  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.38244  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1786  acyl-CoA synthetase  40.88 
 
 		 549 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1833  acyl-CoA synthetase  40.88 
 
 		 549 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.936288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0888  AMP-dependent synthetase and ligase  41.06 
 
 		 545 aa  395  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1767  acyl-CoA synthetase  41.13 
 
 		 549 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.848326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4335  acyl-CoA synthetase  40.37 
 
 		 550 aa  371  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0901424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2010  acyl-CoA synthetase  39.89 
 
 		 550 aa  366  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.324541 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2118  AMP-dependent synthetase and ligase  38.39 
 
 		 545 aa  363  5.0000000000000005e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.172383  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2248  acyl-CoA synthetase  42.4 
 
 		 550 aa  362  1e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2206  acyl-CoA synthetase  39.22 
 
 		 536 aa  357  3.9999999999999996e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0886048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5298  acyl-CoA synthetase  38.92 
 
 		 536 aa  350  3e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0608  AMP-dependent synthetase and ligase  40.07 
 
 		 557 aa  349  7e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.597937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1759  acyl-CoA synthetase  39.37 
 
 		 536 aa  344  2.9999999999999997e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2921  acyl-CoA synthetase  37.43 
 
 		 558 aa  337  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.250918 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2891  acyl-CoA synthetase  37.43 
 
 		 558 aa  337  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2935  acyl-CoA synthetase  37.43 
 
 		 558 aa  337  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.444954  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0290  AMP-dependent synthetase and ligase  36.35 
 
 		 605 aa  294  3e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000671199  hitchhiker  0.000133038 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1775  acyl-CoA synthetase  35.27 
 
 		 542 aa  287  4e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1822  acyl-CoA synthetase  35.27 
 
 		 542 aa  287  4e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.591345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1756  acyl-CoA synthetase  35.27 
 
 		 542 aa  287  4e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.317816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0691  AMP-dependent synthetase and ligase  35.99 
 
 		 553 aa  286  9e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13546  fatty-acid-CoA ligase fadD18  79.27 
 
 		 218 aa  279  1e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.46199e-133  hitchhiker  0.000000428617 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1563  acyl-CoA synthetase  36.8 
 
 		 531 aa  276  9e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.701309  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1995  acyl-CoA synthetase  34.18 
 
 		 541 aa  272  1e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4349  acyl-CoA synthetase  35.07 
 
 		 541 aa  263  4.999999999999999e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1531  acyl-CoA synthetase  33.89 
 
 		 531 aa  243  7e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4096  AMP-dependent synthetase and ligase  32.83 
 
 		 508 aa  218  2e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0377217  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1025  AMP-dependent synthetase and ligase  30.43 
 
 		 528 aa  203  8e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3124  AMP-dependent synthetase and ligase  30.3 
 
 		 545 aa  203  8e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  28.82 
 
 		 516 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1806  AMP-dependent synthetase and ligase  30.06 
 
 		 526 aa  195  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.02 
 
 		 514 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2323  AMP-dependent synthetase and ligase  29.19 
 
 		 511 aa  189  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1180  hypothetical protein  28.23 
 
 		 544 aa  187  5e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4595  AMP-dependent synthetase and ligase  28.71 
 
 		 525 aa  186  6e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2032  AMP-dependent synthetase and ligase  30.75 
 
 		 551 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.367958 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  29.77 
 
 		 509 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2806  acyl-CoA synthetase  28.15 
 
 		 556 aa  183  6e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.688057 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3565  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.01 
 
 		 526 aa  182  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011282  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0734  AMP-dependent synthetase and ligase  31.05 
 
 		 511 aa  182  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4181  AMP-dependent synthetase and ligase  31.13 
 
 		 527 aa  181  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1984  AMP-dependent synthetase and ligase  28.7 
 
 		 552 aa  180  5.999999999999999e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  27.52 
 
 		 662 aa  179  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  30.07 
 
 		 520 aa  179  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  29.47 
 
 		 512 aa  178  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  27.7 
 
 		 523 aa  178  3e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2879  AMP-dependent synthetase and ligase  27.51 
 
 		 862 aa  177  4e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2089  AMP-dependent synthetase and ligase  28.75 
 
 		 530 aa  177  4e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5438  AMP-dependent synthetase and ligase  28.79 
 
 		 515 aa  177  5e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4826  AMP-dependent synthetase and ligase  30.06 
 
 		 520 aa  176  7e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0178748  normal  0.551416 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4867  AMP-binding domain protein  30.67 
 
 		 538 aa  176  7e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.223701  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3704  AMP-dependent synthetase and ligase  28.31 
 
 		 515 aa  176  8e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0990866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  28.79 
 
 		 520 aa  176  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2038  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  28.12 
 
 		 565 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5310  acyl-CoA synthetase  30.43 
 
 		 516 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2924  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.61 
 
 		 526 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.42655 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0327  AMP-binding domain protein  29.68 
 
 		 549 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.347146  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0606  AMP-dependent synthetase and ligase  29.29 
 
 		 560 aa  174  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0135962 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1041  AMP-binding domain protein  29.62 
 
 		 549 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6618  AMP-dependent synthetase and ligase  30.65 
 
 		 493 aa  174  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1585  AMP-binding domain protein  29.32 
 
 		 549 aa  174  5e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  29.26 
 
 		 509 aa  174  5e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1133  AMP-dependent synthetase and ligase  27.36 
 
 		 518 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.508244  normal  0.50206 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2434  AMP-dependent synthetase and ligase  27.32 
 
 		 534 aa  173  9e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.097494  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3076  acyl-CoA synthetase  27.92 
 
 		 545 aa  173  9e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1724  AMP-dependent synthetase and ligase  28.12 
 
 		 515 aa  172  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0701995  normal  0.167784 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.32 
 
 		 519 aa  172  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  30.34 
 
 		 521 aa  172  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.03 
 
 		 524 aa  172  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1563  AMP-binding domain protein  30.19 
 
 		 538 aa  172  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716975 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0582  AMP-binding domain protein  27.59 
 
 		 587 aa  172  2e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.44238  normal  0.647319 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2821  AMP-binding domain protein  28.88 
 
 		 552 aa  171  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.187557 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  28.7 
 
 		 549 aa  171  3e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1868  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.46 
 
 		 525 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.205754 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3475  AMP-dependent synthetase and ligase  28.79 
 
 		 524 aa  171  4e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.440115  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4073  AMP-dependent synthetase and ligase  31.41 
 
 		 535 aa  170  6e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0666092  normal  0.751022 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1442  AMP-binding domain protein  28.96 
 
 		 550 aa  170  7e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.684137  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2382  AMP-dependent synthetase and ligase  29.82 
 
 		 561 aa  170  8e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1438  acyl-CoA synthetase  28 
 
 		 549 aa  169  8e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.603543  decreased coverage  0.00000173613 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0142  AMP-dependent synthetase and ligase  29.4 
 
 		 508 aa  169  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1676  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.16 
 
 		 526 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.591328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0337  AMP-dependent synthetase and ligase  28.26 
 
 		 577 aa  169  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.238028  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2083  AMP-dependent synthetase and ligase  30.69 
 
 		 544 aa  168  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2203  AMP-dependent synthetase and ligase  26.86 
 
 		 534 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334168  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1052  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.22 
 
 		 518 aa  168  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2283  AMP-dependent synthetase and ligase  29.29 
 
 		 513 aa  169  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>