More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3782 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_3786  3-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  100 
 
 
274 aa  550  1e-156  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.71727  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3782  3-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  100 
 
 
274 aa  550  1e-156  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3855  3-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  100 
 
 
274 aa  550  1e-156  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.420893  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2405  3-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  63.6 
 
 
271 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4241  3-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  62.81 
 
 
251 aa  301  6.000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0895  3-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  40.54 
 
 
274 aa  172  5.999999999999999e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.013191  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0504  3-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  37.25 
 
 
255 aa  156  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1462  3-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  37.5 
 
 
255 aa  150  2e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.759595  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1390  3-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  36.18 
 
 
255 aa  143  2e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2949  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  35.57 
 
 
255 aa  142  6e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.084933  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2733  3-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  34.25 
 
 
255 aa  142  8e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.694898  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0129  3-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  38.96 
 
 
255 aa  139  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.735405 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.26 
 
 
291 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.400564  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4796  3-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  38.55 
 
 
261 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.616684  normal  0.0456615 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2716  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 
265 aa  138  8.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.839992  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4885  3-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  38.15 
 
 
261 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.726379 
 
 
-
 
NC_003296  RS05193  3-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  37.25 
 
 
255 aa  135  5e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00510841  normal  0.489476 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2008  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.36 
 
 
261 aa  129  6e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.959898  normal  0.356317 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.43 
 
 
293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305242  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 
274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2450  3-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  33.58 
 
 
257 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0588797  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2549  short chain dehydrogenase  31.07 
 
 
272 aa  103  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2499  short chain dehydrogenase  31.07 
 
 
272 aa  103  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.496805  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0581  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.96 
 
 
274 aa  102  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.97 
 
 
255 aa  102  6e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.52 
 
 
274 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.435201 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4725  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.3 
 
 
253 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4345  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.3 
 
 
253 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.108758  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4431  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.3 
 
 
253 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.564431  normal  0.112699 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.02 
 
 
282 aa  96.7  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.06 
 
 
253 aa  95.9  7e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.228313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2237  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.57 
 
 
252 aa  95.5  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.635702  normal  0.434149 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.66 
 
 
246 aa  94  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.93 
 
 
264 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.473895  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2045  short chain dehydrogenase  29.29 
 
 
272 aa  93.6  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.66 
 
 
246 aa  93.2  4e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6443  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.8 
 
 
253 aa  92.8  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.246968  normal  0.169503 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4508  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.42 
 
 
273 aa  92.4  8e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.19021  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1409  aldose dehydrogenase  30.34 
 
 
258 aa  90.9  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1517  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.78 
 
 
263 aa  90.1  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05640  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  34.62 
 
 
263 aa  90.5  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1680  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.84 
 
 
251 aa  90.1  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447885  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.96 
 
 
276 aa  90.1  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.185872  hitchhiker  0.0000125896 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.23 
 
 
254 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.23 
 
 
254 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5253  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.81 
 
 
273 aa  88.6  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0213  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.21 
 
 
264 aa  88.6  9e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1802  gluconate 5-dehydrogenase  27.92 
 
 
260 aa  88.2  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0175  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.04 
 
 
247 aa  88.2  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1861  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.58 
 
 
268 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651686  normal  0.848972 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.47 
 
 
247 aa  87  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.585241  normal  0.0114993 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2114  3 alpha-hydroxysteroid dehydrogenase/carbonyl reductase  29.76 
 
 
259 aa  86.7  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.138604  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0908  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.88 
 
 
257 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.117831  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5486  short chain dehydrogenase  32.47 
 
 
262 aa  85.5  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.398056  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6772  short chain dehydrogenase  32.47 
 
 
262 aa  85.5  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.646299 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4503  reductase  33.72 
 
 
267 aa  85.5  9e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.642287  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_7370  short-chain alcohol dehydrogenase  29.71 
 
 
247 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.11 
 
 
263 aa  85.1  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.49 
 
 
256 aa  85.5  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.346824  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0465  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 
258 aa  85.1  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4615  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 
247 aa  84.7  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.991587  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7178  short chain dehydrogenase  32.09 
 
 
262 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0959368 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.72 
 
 
245 aa  84  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.17766  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8214  short chain dehydrogenase  30.34 
 
 
248 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.09 
 
 
249 aa  84.3  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.876035 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.41 
 
 
245 aa  84.3  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0013  2,3-dihydroxybenzoate-2,3-dehydrogenase  29.82 
 
 
258 aa  83.6  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0010  2,3-dihydroxybenzoate-2,3-dehydrogenase  29.82 
 
 
258 aa  83.6  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1724  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.06 
 
 
266 aa  83.6  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0573572  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1561  short chain dehydrogenase  30.3 
 
 
516 aa  83.2  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.636243  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.83 
 
 
256 aa  83.2  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0601767 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4175  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.03 
 
 
258 aa  83.2  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0509  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.57 
 
 
245 aa  83.2  0.000000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6308  short chain dehydrogenase  32.09 
 
 
262 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.435974  normal  0.367823 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6360  short chain dehydrogenase  32.46 
 
 
262 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.49 
 
 
253 aa  82.8  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1662  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.52 
 
 
245 aa  82.4  0.000000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.59 
 
 
240 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3434  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.2 
 
 
263 aa  82.4  0.000000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.101369  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2477  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.35 
 
 
236 aa  82.4  0.000000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.433499  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.3 
 
 
233 aa  82.4  0.000000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.981974  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.96 
 
 
280 aa  82  0.000000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.439013  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6863  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.17 
 
 
261 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.224503  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0348  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.26 
 
 
244 aa  81.3  0.00000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.708158  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1671  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  26.81 
 
 
246 aa  82  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1835  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.78 
 
 
244 aa  82  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.686329  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.22 
 
 
248 aa  81.6  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2474  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.18 
 
 
263 aa  82  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.170949  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1022  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.17 
 
 
257 aa  81.3  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.522598  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4062  short chain dehydrogenase  31.99 
 
 
257 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.171649  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2377  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.32 
 
 
249 aa  81.6  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.496864  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.86 
 
 
258 aa  82  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1669  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.26 
 
 
242 aa  82  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3519  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.42 
 
 
252 aa  81.6  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6012  short chain dehydrogenase  31.72 
 
 
262 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.998031 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3979  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.14 
 
 
246 aa  81.6  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00235885 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5611  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.61 
 
 
279 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.288274  normal  0.29741 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2060  short chain dehydrogenase  30.63 
 
 
257 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.26 
 
 
247 aa  81.3  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5718  short chain dehydrogenase  30.58 
 
 
264 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>