35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1282 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1282  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 141 aa  280  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.214185  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1299  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 141 aa  280  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0217116  normal  0.0379224 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1311  anti-sigma-factor antagonist  98.58 
 
 		 141 aa  278  2e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1661  anti-sigma-factor antagonist  59.56 
 
 		 147 aa  154  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.744835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4788  anti-sigma-factor antagonist  53.12 
 
 		 144 aa  135  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0365587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2928  anti-sigma-factor antagonist  44.44 
 
 		 148 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402963  normal  0.280016 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2942  anti-sigma-factor antagonist  44.44 
 
 		 148 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2898  anti-sigma-factor antagonist  44.44 
 
 		 148 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.703942  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2530  anti-sigma-factor antagonist  36.43 
 
 		 155 aa  90.1  9e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3879  anti-sigma-factor antagonist  38.79 
 
 		 155 aa  89  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.337917 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0702  anti-sigma-factor antagonist  47.06 
 
 		 152 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.44246  normal  0.0163472 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0916  anti-sigma-factor antagonist  43.69 
 
 		 106 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.239585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0905  anti-sigma-factor antagonist  43.69 
 
 		 106 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0599283 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0899  anti-sigma-factor antagonist  43.69 
 
 		 106 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.562306  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0203  anti-sigma-factor antagonist  42.72 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.359071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2023  anti-sigma-factor antagonist  43.02 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.861552  normal  0.437325 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5536  hypothetical protein  41.9 
 
 		 139 aa  70.1  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0792595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4700  anti-sigma-factor antagonist  43.37 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.572839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0359  anti-sigma-factor antagonist  38.3 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.280316  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0348  anti-sigma-factor antagonist  38.3 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0369  anti-sigma-factor antagonist  38.3 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.189526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10527  hypothetical protein  34.82 
 
 		 158 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3164  anti-sigma-factor antagonist  38.54 
 
 		 114 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.833812  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11933  hypothetical protein  27.5 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0395  anti-sigma-factor antagonist  34.38 
 
 		 135 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.062058  normal  0.536153 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1819  anti-sigma-factor antagonist  34.25 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12900  anti-anti-sigma factor  29.73 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27120  anti-anti-sigma factor  37.36 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1153  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  26.8 
 
 		 129 aa  41.6  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.406028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5403  anti-sigma-factor antagonist  37.68 
 
 		 118 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0343  anti-sigma-factor antagonist  36.46 
 
 		 135 aa  41.2  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2253  anti-sigma-factor antagonist  42.86 
 
 		 136 aa  41.2  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326742  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06941  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  27.55 
 
 		 115 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  decreased coverage  0.00555121  normal  0.159245 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15781  STAS domain-containing protein  26.53 
 
 		 118 aa  40.4  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3990  anti-sigma-factor antagonist  35.44 
 
 		 117 aa  40  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000129231  normal  0.121632 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>