More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3458 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001307  ANIA_02315  ATP synthase beta chain, mitochondrial (Eurofung)  71.06 
 
 
518 aa  681    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.80478  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03616  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.88 
 
 
460 aa  637    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.587237  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4235  ATP synthase F1, beta subunit  68.88 
 
 
460 aa  637    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0606  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.61 
 
 
471 aa  676    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391377  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0113  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.67 
 
 
470 aa  691    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800377  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2201  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.27 
 
 
475 aa  739    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1939  ATP synthase F1 subunit beta  67.09 
 
 
482 aa  653    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0012  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.02 
 
 
460 aa  644    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0203  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.22 
 
 
475 aa  687    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.838406  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0917  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.94 
 
 
465 aa  650    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00508196  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5430  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.13 
 
 
468 aa  657    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2922  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.82 
 
 
509 aa  702    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0102  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.08 
 
 
465 aa  650    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.532539  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0623  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.96 
 
 
484 aa  722    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.722449 
 
 
-
 
NC_004310  BR1799  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.82 
 
 
521 aa  701    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.469261  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0372  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.31 
 
 
476 aa  636    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.678758 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5599  ATP synthase F1, beta subunit  67.81 
 
 
459 aa  636    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5155  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.34 
 
 
469 aa  655    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0181879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4987  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.34 
 
 
469 aa  655    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5005  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.34 
 
 
469 aa  655    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.509964  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3948  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.88 
 
 
460 aa  638    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.440283  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2139  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.66 
 
 
470 aa  635    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.12979  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0408  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.52 
 
 
480 aa  703    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.364668 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00570  conserved hypothetical protein  70.61 
 
 
547 aa  679    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0429252  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5121  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.81 
 
 
459 aa  635    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2024  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.6 
 
 
477 aa  646    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.531003 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0197  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.74 
 
 
471 aa  642    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2195  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.28 
 
 
470 aa  673    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0459  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.15 
 
 
507 aa  659    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00202199  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2797  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.24 
 
 
459 aa  640    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0433  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.91 
 
 
476 aa  725    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2298  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.16 
 
 
482 aa  660    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1105  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.82 
 
 
517 aa  703    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3074  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.45 
 
 
458 aa  634    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0114  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.64 
 
 
484 aa  647    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000729583  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2299  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.27 
 
 
475 aa  738    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0962572  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0949  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.73 
 
 
468 aa  697    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.740096  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3131  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.73 
 
 
468 aa  696    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4495  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.68 
 
 
481 aa  682    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.632426  normal  0.0177309 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0021  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.31 
 
 
482 aa  668    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.141679 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1507  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.4 
 
 
471 aa  676    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2014  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.1 
 
 
462 aa  664    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1738  F0F1 ATP synthase subunit beta  70 
 
 
465 aa  658    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.31199  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3406  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.4 
 
 
470 aa  686    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.732253  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0985  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.41 
 
 
470 aa  669    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.197353  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2165  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.88 
 
 
459 aa  639    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5547  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.34 
 
 
469 aa  655    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00288434  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1403  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.59 
 
 
468 aa  640    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.593007  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0026  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.95 
 
 
466 aa  644    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.122802  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2177  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.66 
 
 
470 aa  635    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.104678  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0310  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.45 
 
 
459 aa  635    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.239632  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1226  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.08 
 
 
474 aa  717    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.877196  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2378  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.26 
 
 
462 aa  700    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0603  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.73 
 
 
467 aa  671    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00132647  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4348  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.34 
 
 
482 aa  650    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0265  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.43 
 
 
476 aa  718    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2402  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.53 
 
 
481 aa  712    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0763  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.09 
 
 
474 aa  667    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0573  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.5 
 
 
507 aa  646    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1049  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.03 
 
 
474 aa  707    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0193  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.32 
 
 
475 aa  649    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.196024  normal  0.0120657 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77492  F1F0-ATPase complex, F1 beta subunit  74.56 
 
 
503 aa  679    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.686531  normal  0.984135 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0174  F0F1 ATP synthase subunit beta  75 
 
 
476 aa  716    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0308  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.53 
 
 
468 aa  638    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0848804 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4462  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.38 
 
 
458 aa  634    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.718336  hitchhiker  0.0000000225829 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2528  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.95 
 
 
467 aa  640    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1465  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.12 
 
 
478 aa  718    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.58444  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0559  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.43 
 
 
476 aa  717    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.29252 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3284  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.24 
 
 
458 aa  639    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0529  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.15 
 
 
476 aa  711    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2327  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.39 
 
 
477 aa  643    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.568138  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0255  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.53 
 
 
474 aa  637    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0651281  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1525  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.09 
 
 
465 aa  647    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00013374  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3825  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.66 
 
 
464 aa  654    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2086  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.54 
 
 
474 aa  728    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.531544  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2288  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.32 
 
 
513 aa  711    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.966957  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0687  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.15 
 
 
465 aa  651    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0516039  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4263  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.85 
 
 
470 aa  677    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.439057  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3218  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.85 
 
 
519 aa  716    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.409534  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1681  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.26 
 
 
476 aa  739    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2452  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.67 
 
 
465 aa  654    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2162  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.88 
 
 
465 aa  656    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0325  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.55 
 
 
472 aa  649    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2080  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.05 
 
 
478 aa  718    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.331414 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2608  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.85 
 
 
464 aa  672    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0114  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.1 
 
 
537 aa  712    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2869  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.31 
 
 
458 aa  639    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.761227  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0142  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.08 
 
 
465 aa  650    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0029087  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2382  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.32 
 
 
476 aa  653    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2802  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.13 
 
 
479 aa  689    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.472945  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00421  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.52 
 
 
467 aa  635    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3818  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.66 
 
 
474 aa  732    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119590  ATP synthase beta chain, mitochondrial precursor  72.9 
 
 
530 aa  701    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.114737  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0480  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.31 
 
 
471 aa  636    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0049  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.88 
 
 
462 aa  666    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.534709  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1732  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.82 
 
 
521 aa  701    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.352683  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0521  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.15 
 
 
468 aa  639    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00662178  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4247  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.88 
 
 
460 aa  637    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000144412  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2582  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.77 
 
 
469 aa  671    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.646569  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3458  F0F1 ATP synthase subunit beta  100 
 
 
474 aa  962    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>