More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0854 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0854  50S ribosomal protein L16  100 
 
 		 137 aa  274  3e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000606887  hitchhiker  0.000468877 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3441  50S ribosomal protein L16  73.88 
 
 		 137 aa  216  7e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.882422  normal  0.353645 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3177  50S ribosomal protein L16  73.13 
 
 		 137 aa  216  7e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.943989 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3660  50S ribosomal protein L16  72.39 
 
 		 137 aa  215  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2302  50S ribosomal protein L16  72.39 
 
 		 137 aa  214  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.102329  normal  0.102886 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1371  50S ribosomal protein L16  73.13 
 
 		 137 aa  212  9.999999999999999e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.237512  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1552  50S ribosomal protein L16  72.39 
 
 		 137 aa  210  3.9999999999999995e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2681  50S ribosomal protein L16  72.06 
 
 		 138 aa  206  1e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.428051  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2973  50S ribosomal protein L16  70.59 
 
 		 138 aa  204  4e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0060  50S ribosomal protein L16  68.61 
 
 		 137 aa  204  5e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000262847  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0057  50S ribosomal protein L16  68.61 
 
 		 137 aa  204  5e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000274594  hitchhiker  4.45125e-19 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3485  50S ribosomal protein L16  69.34 
 
 		 138 aa  203  8e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00369776  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3797  50S ribosomal protein L16  69.34 
 
 		 138 aa  203  8e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1931  50S ribosomal protein L16  69.34 
 
 		 138 aa  203  8e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000246201  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2625  50S ribosomal protein L16  69.34 
 
 		 138 aa  203  8e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.623647  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3769  50S ribosomal protein L16  69.34 
 
 		 138 aa  203  8e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000165417  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3739  50S ribosomal protein L16  69.34 
 
 		 138 aa  203  8e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000550662  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3061  50S ribosomal protein L16  69.34 
 
 		 138 aa  203  8e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000117854  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3162  50S ribosomal protein L16  69.34 
 
 		 138 aa  203  8e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000364503  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1346  50S ribosomal protein L16  74.26 
 
 		 143 aa  202  9e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0763592 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0573  50S ribosomal protein L16  73.88 
 
 		 137 aa  201  2e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5063  50S ribosomal protein L16  72.39 
 
 		 137 aa  201  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.568875 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3454  50S ribosomal protein L16  69.34 
 
 		 138 aa  201  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000581922  decreased coverage  0.00396929 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0334  50S ribosomal protein L16  69.4 
 
 		 138 aa  201  3e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0307948  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2752  50S ribosomal protein L16  69.34 
 
 		 138 aa  201  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000962733  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0504  50S ribosomal protein L16  69.4 
 
 		 138 aa  201  3e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.110652  hitchhiker  0.000000000243822 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0355  50S ribosomal protein L16  69.34 
 
 		 138 aa  201  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000176857  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0334  50S ribosomal protein L16  69.34 
 
 		 138 aa  201  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000896805  normal  0.0198335 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0256  50S ribosomal protein L16  68.61 
 
 		 138 aa  201  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00173139  normal  0.0172892 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0321  50S ribosomal protein L16  68.61 
 
 		 138 aa  201  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000904365  decreased coverage  0.00244098 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2833  50S ribosomal protein L16  67.88 
 
 		 138 aa  201  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000261677  normal  0.482727 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3637  50S ribosomal protein L16  68.61 
 
 		 138 aa  201  4e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000627073  hitchhiker  0.0000000000181124 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1256  50S ribosomal protein L16  72.06 
 
 		 144 aa  200  5e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.738534  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2743  50S ribosomal protein L16  72.06 
 
 		 139 aa  200  5e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.059862  normal  0.198129 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0283  50S ribosomal protein L16  69.34 
 
 		 138 aa  200  5e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000045602  normal  0.0248702 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0274  50S ribosomal protein L16  69.34 
 
 		 138 aa  200  5e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000119561  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3012  50S ribosomal protein L16  67.15 
 
 		 138 aa  200  7e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.0000000599816  normal  0.0124022 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3290  50S ribosomal protein L16  67.15 
 
 		 138 aa  200  7e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000483098  decreased coverage  0.000000529176 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2943  50S ribosomal protein L16  67.15 
 
 		 138 aa  200  7e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000488638  hitchhiker  0.000000740815 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1788  50S ribosomal protein L16  69.85 
 
 		 137 aa  199  8e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0987623  normal  0.0786322 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0967  50S ribosomal protein L16  68.66 
 
 		 137 aa  199  9.999999999999999e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00104122  hitchhiker  0.00000106632 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3310  50S ribosomal protein L16  67.15 
 
 		 138 aa  199  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000336027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3172  50S ribosomal protein L16  67.15 
 
 		 138 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000521521  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1939  50S ribosomal protein L16  68.38 
 
 		 138 aa  198  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1686  50S ribosomal protein L16  69.4 
 
 		 137 aa  198  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00000414216  hitchhiker  0.000000385308 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0412  50S ribosomal protein L16  68.66 
 
 		 138 aa  198  3e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000749036  normal  0.231316 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0256  50S ribosomal protein L16  68.15 
 
 		 137 aa  197  3e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2811  50S ribosomal protein L16  72.79 
 
 		 143 aa  196  7e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.647814  normal  0.456586 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3331  50S ribosomal protein L16  66.42 
 
 		 138 aa  196  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000490254  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2317  50S ribosomal protein L16  70.15 
 
 		 137 aa  195  2.0000000000000003e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000221172  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2317  50S ribosomal protein L16  66.42 
 
 		 137 aa  195  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0179145  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0774  50S ribosomal protein L16  65.69 
 
 		 138 aa  194  4.0000000000000005e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000401097  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0346  50S ribosomal protein L16  68.66 
 
 		 137 aa  194  5.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1915  50S ribosomal protein L16  68.66 
 
 		 137 aa  193  7e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.108117  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0302  50S ribosomal protein L16  66.42 
 
 		 137 aa  193  8.000000000000001e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00320104  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2365  50S ribosomal protein L16  67.16 
 
 		 137 aa  192  1e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.309525  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2162  ribosomal protein L16  68.15 
 
 		 137 aa  192  1e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00554254  normal  0.180391 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0286  50S ribosomal protein L16  66.42 
 
 		 138 aa  192  1e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233606  hitchhiker  0.00000173013 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0428  50S ribosomal protein L16  65.67 
 
 		 137 aa  192  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0983834  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2566  50S ribosomal protein L16  67.16 
 
 		 141 aa  192  1e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0698  50S ribosomal protein L16  67.16 
 
 		 142 aa  192  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000251243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0491  50S ribosomal protein L16  64.93 
 
 		 137 aa  191  3e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000419023  normal  0.026966 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1671  50S ribosomal protein L16  68.66 
 
 		 137 aa  191  3e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0460624  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0401  50S ribosomal protein L16  67.94 
 
 		 137 aa  190  4e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0376  50S ribosomal protein L16  67.94 
 
 		 137 aa  190  4e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0289  50S ribosomal protein L16  68.15 
 
 		 137 aa  190  5e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0866  50S ribosomal protein L16  66.42 
 
 		 137 aa  190  5e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0245  50S ribosomal protein L16  64.18 
 
 		 139 aa  190  5e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0592  50S ribosomal protein L16  67.41 
 
 		 137 aa  190  5e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0242  50S ribosomal protein L16  64.18 
 
 		 139 aa  190  5e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0496  50S ribosomal protein L16  64.18 
 
 		 137 aa  190  6e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000877255  hitchhiker  0.00385796 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0726  50S ribosomal protein L16  67.16 
 
 		 137 aa  189  8e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00162053  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2527  50S ribosomal protein L16  67.41 
 
 		 137 aa  189  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1723  50S ribosomal protein L16  67.41 
 
 		 137 aa  189  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.936678  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0433  50S ribosomal protein L16  64.93 
 
 		 137 aa  189  1e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000574852  hitchhiker  0.0000247561 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3992  50S ribosomal protein L16  64.93 
 
 		 138 aa  189  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000729687 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4269  50S ribosomal protein L16  70.15 
 
 		 137 aa  189  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000832167  unclonable  0.00000000000355687 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0368  50S ribosomal protein L16  67.41 
 
 		 137 aa  189  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.518001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3436  50S ribosomal protein L16  63.5 
 
 		 138 aa  189  1e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.109776  normal  0.197856 
 
 
-
 
NC_004310  BR1226  50S ribosomal protein L16  64.93 
 
 		 137 aa  188  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1567  50S ribosomal protein L16  62.69 
 
 		 142 aa  189  2e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00199901  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3994  50S ribosomal protein L16  65.67 
 
 		 136 aa  189  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000110255  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0190  50S ribosomal protein L16  67.41 
 
 		 140 aa  188  2e-47  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.307321 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1299  50S ribosomal protein L16  63.7 
 
 		 140 aa  189  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.210849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1189  50S ribosomal protein L16  64.93 
 
 		 137 aa  188  2e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.62552  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3815  50S ribosomal protein L16  65.67 
 
 		 136 aa  189  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000419502  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00452  50S ribosomal protein L16  65.67 
 
 		 136 aa  188  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0232467  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3710  50S ribosomal protein L16  62.96 
 
 		 139 aa  187  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1963  50S ribosomal protein L16  64.93 
 
 		 137 aa  187  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0108267  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0766  50S ribosomal protein L16  65.93 
 
 		 137 aa  187  2.9999999999999997e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0436008  normal  0.507228 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1361  50S ribosomal protein L16  74.63 
 
 		 137 aa  187  5e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.577979  normal  0.0350409 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0330  ribosomal protein L16  64.93 
 
 		 136 aa  186  7e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000097682  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0412  ribosomal protein L16  64.93 
 
 		 136 aa  186  9e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0307436  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0673  50S ribosomal protein L16  64.93 
 
 		 137 aa  186  1e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000002435  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3744  50S ribosomal protein L16  64.93 
 
 		 136 aa  186  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000101532  hitchhiker  0.0036093 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0708  50S ribosomal protein L16  62.96 
 
 		 141 aa  186  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000940858  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0993  50S ribosomal protein L16  64.93 
 
 		 137 aa  186  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0292243 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0705  50S ribosomal protein L16  64.93 
 
 		 137 aa  186  1e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000113976  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0220  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 136 aa  185  1e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000896692  unclonable  0.00000708625 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0398  50S ribosomal protein L16  61.31 
 
 		 138 aa  185  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>