More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0971 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_1002  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  81.43 
 
 		 533 aa  892    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0975  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  97.75 
 
 		 533 aa  1000    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0971  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  100 
 
 		 533 aa  1058    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1706  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  97 
 
 		 533 aa  998    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0468  Na+/solute symporter  67.64 
 
 		 528 aa  714    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.280127  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0425  Na+/solute symporter  60.65 
 
 		 530 aa  613  9.999999999999999e-175  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3721  sodium:proline symporter (proline permease)  55.95 
 
 		 553 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0036  Na+ symporter  53.93 
 
 		 537 aa  564  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.90526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1847  Na+/solute symporter  53.57 
 
 		 543 aa  542  1e-153  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.145671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0037  Na+/solute symporter  53.36 
 
 		 543 aa  525  1e-148  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0049  Na+/solute symporter  53.37 
 
 		 543 aa  522  1e-147  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1134  Na+/solute symporter  52.27 
 
 		 527 aa  523  1e-147  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0034  Na+/solute symporter  52.75 
 
 		 543 aa  521  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.404882  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2326  Na+/solute symporter  51.49 
 
 		 520 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1337  sodium/proline symporter (proline permease)  50.28 
 
 		 531 aa  490  1e-137  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1063  hypothetical protein  50.71 
 
 		 526 aa  451  1e-125  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.771513 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3191  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.76 
 
 		 504 aa  199  9e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.205305  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2279  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.1 
 
 		 504 aa  184  3e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.257788  hitchhiker  0.0000218485 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1464  Na+/solute symporter  27.91 
 
 		 489 aa  177  4e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.675757  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0735  Na+/solute symporter  28.6 
 
 		 489 aa  177  5e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1220  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.18 
 
 		 489 aa  176  8e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0408  Na+/proline symporter-like protein  58.28 
 
 		 377 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2308  sodium/proline symporter  27.64 
 
 		 492 aa  170  7e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.591948  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3090  Na+/solute symporter  27.73 
 
 		 508 aa  169  9e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000664536  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1759  Na+ symporter  28.66 
 
 		 531 aa  166  9e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0612  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.33 
 
 		 503 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000214976  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  28.41 
 
 		 492 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  28.41 
 
 		 493 aa  164  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  28.41 
 
 		 493 aa  164  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3435  sodium/proline symporter family protein  28.41 
 
 		 493 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3705  sodium/proline symporter family protein  28.41 
 
 		 492 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.338299  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3655  sodium/proline symporter family protein  28.41 
 
 		 492 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3677  sodium/proline symporter family protein  28.19 
 
 		 492 aa  163  6e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289137  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1564  sodium/proline symporter family protein  28.19 
 
 		 492 aa  161  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.286578 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3331  sodium/proline symporter  28.19 
 
 		 487 aa  161  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.825412  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3752  sodium/proline symporter family protein  28.19 
 
 		 492 aa  159  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54150  sodium/proline symporter PutP  27.32 
 
 		 506 aa  157  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4736  sodium/proline symporter PutP  26.89 
 
 		 506 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.865445  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07099  hypothetical protein  27.84 
 
 		 518 aa  155  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  27.99 
 
 		 492 aa  155  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  27.51 
 
 		 484 aa  154  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  27.51 
 
 		 492 aa  152  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  27.99 
 
 		 492 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  28.32 
 
 		 492 aa  152  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  27.99 
 
 		 492 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  27.99 
 
 		 492 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  27.8 
 
 		 492 aa  152  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  27.8 
 
 		 492 aa  152  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0364  sodium/proline symporter  27.02 
 
 		 493 aa  150  5e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  27.41 
 
 		 485 aa  150  5e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4420  sodium/panthothenate symporter  26.4 
 
 		 481 aa  150  6e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0607009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2177  sodium/proline symporter  27.97 
 
 		 482 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000107736  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  27.61 
 
 		 492 aa  147  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001019  proline/sodium symporter PutP  27.56 
 
 		 497 aa  147  4.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  26.21 
 
 		 482 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1415  SSS family Na(+)/proline symporter  28.67 
 
 		 499 aa  145  1e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.631202 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1542  sodium/proline symporter  25.98 
 
 		 502 aa  145  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.13082 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4018  sodium/proline symporter  28.07 
 
 		 494 aa  146  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0148  sodium/proline symporter  27.63 
 
 		 499 aa  145  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.720955  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  29.42 
 
 		 492 aa  145  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1939  sodium/proline symporter  26.86 
 
 		 498 aa  145  2e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4210  sodium/proline symporter  27.66 
 
 		 494 aa  144  5e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4843  SSS sodium solute transporter superfamily  27.81 
 
 		 544 aa  144  5e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1250  sodium/proline symporter  26.44 
 
 		 496 aa  143  7e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654808  normal  0.469552 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0453  Sodium/proline symporter  26.2 
 
 		 494 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0949  sodium/proline symporter  28.04 
 
 		 488 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000419009  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0734  sodium/proline symporter  27.64 
 
 		 492 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1221  sodium/proline symporter  27.92 
 
 		 492 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1209  sodium/panthothenate symporter  25.23 
 
 		 484 aa  141  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00169799  normal  0.818802 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0455  sodium/panthothenate symporter  25.23 
 
 		 484 aa  141  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0389  sodium/panthothenate symporter  25.23 
 
 		 484 aa  141  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00229851  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1081  sodium/proline symporter  29.14 
 
 		 498 aa  142  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000772394  unclonable  0.00000000000701401 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1854  sodium/proline permease  26.55 
 
 		 489 aa  142  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.794377  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3696  sodium/panthothenate symporter  25.11 
 
 		 483 aa  141  3e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1465  sodium/proline symporter  27.64 
 
 		 492 aa  141  3e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3742  sodium/panthothenate symporter  25.93 
 
 		 483 aa  141  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.133198 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3645  sodium/panthothenate symporter  25.93 
 
 		 483 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060524 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3573  sodium/panthothenate symporter  25.93 
 
 		 483 aa  141  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0131777  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3574  sodium/panthothenate symporter  25.93 
 
 		 483 aa  141  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2435  sodium/proline symporter  27.33 
 
 		 483 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.015008  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3680  sodium/panthothenate symporter  25.93 
 
 		 483 aa  140  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.433126 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3490  sodium/proline symporter  27.65 
 
 		 498 aa  140  4.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.753009  normal  0.0181041 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1494  sodium/proline permease  26.34 
 
 		 489 aa  140  6e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.858456  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03116  sodium/panthothenate symporter  25.17 
 
 		 483 aa  140  7e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.735141  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0448  sodium/pantothenate symporter  25.17 
 
 		 483 aa  140  7e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.293948  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3742  sodium/panthothenate symporter  25.17 
 
 		 483 aa  140  7e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150129  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4575  sodium/panthothenate symporter  25.17 
 
 		 483 aa  140  7e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000690231  normal  0.130163 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1326  Sodium/proline symporter  27.75 
 
 		 488 aa  140  7e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0529188  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03067  hypothetical protein  25.17 
 
 		 483 aa  140  7e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.647307  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3450  sodium/panthothenate symporter  25.17 
 
 		 483 aa  140  7e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000724112  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0448  sodium/panthothenate symporter  25.17 
 
 		 483 aa  140  7e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.024979  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1675  sodium/proline permease  26.34 
 
 		 489 aa  140  7.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1619  sodium/proline symporter  26.89 
 
 		 483 aa  140  7.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000146301  decreased coverage  0.00000122936 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4995  sodium/proline symporter  25.32 
 
 		 492 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1190  sodium/proline symporter  26.35 
 
 		 502 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.969329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1200  sodium/proline symporter  26.35 
 
 		 502 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.133838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1398  sodium/proline symporter  26.89 
 
 		 483 aa  139  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0934266  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1220  sodium/proline symporter  26.35 
 
 		 502 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.405046 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1235  sodium/proline symporter  26.35 
 
 		 502 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0211084  normal  0.60164 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3036  sodium/proline symporter  26.44 
 
 		 488 aa  138  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000692388  normal  0.0245093 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>