26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0487 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0487  parallel beta-helix repeat-containing protein  100 
 
 		 254 aa  501  1e-141  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.503376  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1421  parallel beta-helix repeat-containing protein  81.03 
 
 		 255 aa  377  1e-103  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.670143  normal  0.74275 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1661  parallel beta-helix repeat-containing protein  53.81 
 
 		 230 aa  190  2e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.98661  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0596  hypothetical protein  43.93 
 
 		 304 aa  148  8e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.743466  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0240  hypothetical protein  42.93 
 
 		 215 aa  97.8  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  29.73 
 
 		 1931 aa  58.2  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0597  hypothetical protein  28.97 
 
 		 161 aa  58.2  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1287  periplasmic copper-binding  31.12 
 
 		 831 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0060  periplasmic copper-binding  27.27 
 
 		 294 aa  52.8  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3733  parallel beta-helix repeat-containing protein  28.43 
 
 		 379 aa  52.8  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00966756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  30.91 
 
 		 777 aa  51.6  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1833  periplasmic copper-binding  28.68 
 
 		 595 aa  49.3  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107364 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0686  periplasmic copper-binding  31.73 
 
 		 461 aa  48.5  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.241556 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1273  parallel beta-helix repeat-containing protein  26.22 
 
 		 510 aa  48.1  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.429071  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  30.46 
 
 		 838 aa  48.5  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1686  periplasmic copper-binding  25.13 
 
 		 1056 aa  48.1  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482609  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0803  hypothetical protein  37.23 
 
 		 427 aa  47.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0967  periplasmic copper-binding  30.89 
 
 		 720 aa  46.2  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.118197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1008  periplasmic copper-binding  28.07 
 
 		 698 aa  46.2  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  24.57 
 
 		 709 aa  45.8  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  27.04 
 
 		 1121 aa  45.4  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0677  periplasmic copper-binding  29.74 
 
 		 820 aa  44.3  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1838  Carbohydrate binding family 6  33.67 
 
 		 1035 aa  42.7  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.533489  normal  0.441295 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2677  NosL family protein  27.73 
 
 		 651 aa  42.4  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1037  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  30.68 
 
 		 614 aa  42.4  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1781  hypothetical protein  25.36 
 
 		 724 aa  42  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>