52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1973 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1973  acylneuraminate cytidylyltransferase  100 
 
 		 242 aa  485  1e-136  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1198  acylneuraminate cytidylyltransferase  40.98 
 
 		 244 aa  126  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.474804 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1771  acylneuraminate cytidylyltransferase  38.1 
 
 		 243 aa  124  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.360914  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3211  acylneuraminate cytidylyltransferase  35.12 
 
 		 241 aa  122  7e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0583  acylneuraminate cytidylyltransferase  36.97 
 
 		 256 aa  121  9e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2634  acylneuraminate cytidylyltransferase  37.19 
 
 		 227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0201  hypothetical protein  35.39 
 
 		 267 aa  117  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0366  acylneuraminate cytidylyltransferase  36.2 
 
 		 453 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.592907  normal  0.873597 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1966  acylneuraminate cytidylyltransferase  36.03 
 
 		 261 aa  116  3e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.333673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1137  polysaccharide biosynthesis protein, CMP-KDO synthetase-like  33.97 
 
 		 242 aa  115  5e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0677  acylneuraminate cytidylyltransferase  39.55 
 
 		 264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.748582  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2230  acylneuraminate cytidylyltransferase  33.48 
 
 		 246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1893  acylneuraminate cytidylyltransferase  36.59 
 
 		 231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0135  acylneuraminate cytidylyltransferase  31.28 
 
 		 252 aa  109  3e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.0000000000000052261 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3727  acylneuraminate cytidylyltransferase  37.17 
 
 		 234 aa  105  7e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01580  spore coat polysaccharide biosynthesis protein F, CMP-KDO synthetase  40.49 
 
 		 246 aa  105  8e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0275127 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0093  hypothetical protein  31.53 
 
 		 244 aa  104  1e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.049709  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0616  acylneuraminate cytidylyltransferase  33.93 
 
 		 611 aa  103  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0678473 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2891  acylneuraminate cytidylyltransferase  35.85 
 
 		 239 aa  103  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.022912 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0454  acylneuraminate cytidylyltransferase  40.57 
 
 		 593 aa  102  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0413  acylneuraminate cytidylyltransferase  31.9 
 
 		 225 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.613322  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0340  acylneuraminate cytidylyltransferase  36.67 
 
 		 288 aa  100  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.170558 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3732  acylneuraminate cytidylyltransferase  31.42 
 
 		 250 aa  99  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1328  acylneuraminate cytidylyltransferase  35.29 
 
 		 245 aa  95.5  7e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0248  acylneuraminate cytidylyltransferase  30.65 
 
 		 224 aa  93.2  4e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0092  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase-like  29.27 
 
 		 682 aa  92.8  4e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2209  acylneuraminate cytidylyltransferase  32.32 
 
 		 228 aa  91.3  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.441808  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1245  aminotransferase  33.93 
 
 		 675 aa  86.3  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16990  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  27.16 
 
 		 266 aa  86.3  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3112  acylneuraminate cytidylyltransferase  32.2 
 
 		 246 aa  86.3  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1201  acylneuraminate cytidylyltransferase  35.14 
 
 		 241 aa  82  0.000000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.603895  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4298  acylneuraminate cytidylyltransferase  37.01 
 
 		 237 aa  81.6  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0063  acylneuraminate cytidylyltransferase  33.18 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0421  spore coat polysaccharide biosynthesis protein FlmC  29.03 
 
 		 611 aa  79.3  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0645  acylneuraminate cytidylyltransferase  33.65 
 
 		 241 aa  78.2  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.509134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0368  radical SAM domain-containing protein  31.03 
 
 		 574 aa  73.6  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14261  hypothetical protein  26.67 
 
 		 240 aa  71.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2366  acylneuraminate cytidylyltransferase  34.12 
 
 		 235 aa  69.3  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0289371  hitchhiker  0.00290087 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1721  spore coat polysaccharide biosynthesis protein SpsF, putative  23.61 
 
 		 324 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.128501  hitchhiker  0.000000384945 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0776  acylneuraminate cytidylyltransferase  31.55 
 
 		 212 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.885113 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3679  spore coat polysaccharide biosynthesis protein FlmC  37.61 
 
 		 282 aa  65.5  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1917  cytidyltransferase-like protein  27.27 
 
 		 876 aa  62.4  0.000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00878839  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3269  cytidyltransferase-like protein  27.12 
 
 		 574 aa  50.4  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0437  spore coat polysaccharide biosynthesis protein F CMP-KDO synthetase-like protein  27.31 
 
 		 234 aa  47.4  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.103618 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1759  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  22.99 
 
 		 245 aa  44.3  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.183972  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0975  acylneuraminate cytidylyltransferase  39.44 
 
 		 235 aa  43.1  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1984  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  26.12 
 
 		 245 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000339206  hitchhiker  0.0000000000873335 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2363  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  26.12 
 
 		 245 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00114498  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2375  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  26.12 
 
 		 245 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000365007  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1639  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  25.19 
 
 		 245 aa  42  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0973125  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1284  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  28.69 
 
 		 262 aa  42  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2478  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  25.37 
 
 		 245 aa  41.6  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000979524  decreased coverage  0.0000842589 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>