More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0975 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0975  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 88 aa  177  4e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1553  histone-like DNA-binding protein  50.57 
 
 		 91 aa  87.8  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2154  histone family protein DNA-binding protein  49.43 
 
 		 90 aa  85.5  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000552537  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0942  histone family protein DNA-binding protein  49.43 
 
 		 90 aa  85.9  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2846  DNA-binding protein HU-alpha  48.28 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00368421  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5472  DNA-binding protein HU family  44.83 
 
 		 111 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5027  histone-like DNA-binding protein  44.83 
 
 		 91 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.705107 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5600  nucleoid protein HU alpha subunit  44.83 
 
 		 91 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.375895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0465  histone family protein DNA-binding protein  47.13 
 
 		 90 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1637  DNA-binding protein HU  47.13 
 
 		 90 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00420342  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1420  DNA-binding protein HU  47.13 
 
 		 90 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.190218  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1392  DNA-binding protein HU  47.13 
 
 		 90 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.011833  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1233  histone family protein DNA-binding protein  47.13 
 
 		 90 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0133564  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1392  DNA-binding protein HU  47.13 
 
 		 90 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000512711  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1531  DNA-binding protein HU  47.13 
 
 		 90 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.259543  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1434  histone family protein DNA-binding protein  47.13 
 
 		 90 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.087278  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1566  DNA-binding protein HU  47.13 
 
 		 90 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3779  DNA-binding protein HU  47.13 
 
 		 90 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000354145  normal  0.961445 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1673  DNA-binding protein HU  47.13 
 
 		 90 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000325838  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1604  DNA-binding protein HU  47.13 
 
 		 90 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000159132 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3229  histone family protein DNA-binding protein  47.13 
 
 		 91 aa  80.9  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4159  histone family protein DNA-binding protein  49.43 
 
 		 91 aa  80.9  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0799  histone-like DNA-binding protein  47.13 
 
 		 90 aa  80.9  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0173855 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1715  histone-like DNA-binding protein  51.72 
 
 		 90 aa  80.9  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.236026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2285  histone family protein DNA-binding protein  47.13 
 
 		 90 aa  80.5  0.000000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4401  nucleoid protein HU alpha subunit  43.68 
 
 		 90 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.177499 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2126  histone family protein DNA-binding protein  45.12 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0470  histone family protein DNA-binding protein  43.68 
 
 		 94 aa  80.1  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2846  histone family protein DNA-binding protein  46.59 
 
 		 235 aa  79.7  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1274  histone family protein DNA-binding protein  45.12 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.630033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1474  putative DNA-binding protein HU-beta  41.38 
 
 		 90 aa  79  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000997119  hitchhiker  0.0000985943 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1412  histone-like DNA-binding protein  48.84 
 
 		 91 aa  79  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000277772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1653  histone-like DNA-binding protein  41.38 
 
 		 90 aa  79  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000047794  unclonable  0.0000440637 
 
 
 
NC_012560  Avin_48480  histone-like DNA-binding protein  42.53 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.707299  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70600  HU family DNA-binding protein  42.53 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0532  histone-like protein  42.53 
 
 		 94 aa  78.2  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1772  histone-like DNA-binding protein  47.13 
 
 		 90 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000757515  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0045  histone family protein DNA-binding protein  43.68 
 
 		 90 aa  78.6  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000165888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1362  histone-like DNA-binding protein  45.98 
 
 		 90 aa  78.6  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.102123  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2879  histone family protein DNA-binding protein  47.13 
 
 		 90 aa  78.6  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1626  histone family protein DNA-binding protein  40.23 
 
 		 90 aa  78.6  0.00000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000133039  hitchhiker  0.00000000638901 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0532  DNA-binding protein HU-beta  42.53 
 
 		 90 aa  77.8  0.00000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00043104  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3021  histone family protein DNA-binding protein  45.35 
 
 		 91 aa  77.8  0.00000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10570  histone family protein DNA-binding protein  44.21 
 
 		 137 aa  77.8  0.00000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2203  histone family protein DNA-binding protein  44.83 
 
 		 91 aa  77.4  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0471577  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1909  histone family protein DNA-binding protein  45.98 
 
 		 90 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.715849  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2913  DNA-binding protein HU, form B  47.13 
 
 		 92 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.5361  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2972  DNA-binding protein HU-alpha  47.13 
 
 		 92 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1629  DNA-binding protein HU, form B  47.13 
 
 		 92 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0004  DNA-binding protein HU-alpha  47.13 
 
 		 92 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3397  DNA-binding protein HU, form B  47.13 
 
 		 92 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.218557  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0004  DNA-binding protein HU-alpha  47.13 
 
 		 92 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00213  DNA-binding protein  44.83 
 
 		 101 aa  77  0.00000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4504  DNA-binding protein HU-alpha  47.13 
 
 		 92 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.806931 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3933  histone family protein DNA-binding protein  47.13 
 
 		 92 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0390  histone family protein DNA-binding protein  43.68 
 
 		 90 aa  76.6  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000165854  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3493  DNA-binding protein HU  44.83 
 
 		 90 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.175993  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0004  DNA-binding protein HU-alpha  47.13 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6125  putative DNA-binding protein  41.38 
 
 		 90 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23600  histone-like DNA-binding protein  44.83 
 
 		 90 aa  76.6  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41210  DNA-binding protein HU  44.83 
 
 		 90 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0758892  normal  0.416187 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2053  nucleoid protein HU beta subunit  44.83 
 
 		 90 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000457213  normal  0.0670315 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0065  histone family protein DNA-binding protein  45.98 
 
 		 92 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2215  histone family protein DNA-binding protein  43.18 
 
 		 95 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000076232  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1714  DNA-binding protein HU-beta  45.98 
 
 		 90 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.606946  normal  0.0324854 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8047  histone family protein DNA-binding protein  44.32 
 
 		 232 aa  75.9  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.278826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0066  histone family protein DNA-binding protein  45.98 
 
 		 92 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3247  histone-like DNA-binding protein  45.98 
 
 		 92 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0222  transcriptional regulator HU subunit alpha  45.98 
 
 		 90 aa  75.5  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390191  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0226  transcriptional regulator HU subunit alpha  45.98 
 
 		 90 aa  75.5  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0975648  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2292  nucleoid protein Hbs  44.83 
 
 		 90 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.337722  normal  0.315371 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0005  histone-like DNA-binding protein  45.98 
 
 		 92 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.129264  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0084  histone family protein DNA-binding protein  45.98 
 
 		 92 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1250  histone family protein DNA-binding protein  42.53 
 
 		 91 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2650  DNA-binding protein HU  44.83 
 
 		 90 aa  75.5  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0055  histone family protein DNA-binding protein  45.98 
 
 		 92 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0065  histone family protein DNA-binding protein  45.98 
 
 		 92 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004041  DNA-binding protein HU-beta  43.68 
 
 		 90 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000015142  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1014  histone family protein DNA-binding protein  44.83 
 
 		 90 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.385833  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1041  DNA-binding protein HU  44.83 
 
 		 90 aa  75.5  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436255  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1560  histone family protein DNA-binding protein  44.83 
 
 		 90 aa  75.5  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.768925  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3723  DNA-binding protein HU-beta  43.68 
 
 		 90 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.612497  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1750  histone-like DNA-binding protein  43.68 
 
 		 90 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.519537  normal  0.0235988 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3694  nucleoid protein HU beta subunit  43.68 
 
 		 90 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.566059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0290  transcriptional regulator HU subunit alpha  45.98 
 
 		 90 aa  75.1  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0031706  hitchhiker  0.00995537 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4266  histone family protein DNA-binding protein  47.13 
 
 		 93 aa  75.1  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2043  histone-like DNA-binding protein  43.68 
 
 		 90 aa  74.7  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1530  histone family protein DNA-binding protein  44.83 
 
 		 90 aa  75.5  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002182  DNA-binding protein HU-alpha  43.68 
 
 		 90 aa  75.5  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.131368  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3067  histone family protein DNA-binding protein  45.98 
 
 		 92 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0353619 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1666  histone family protein DNA-binding protein  44.83 
 
 		 90 aa  74.7  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1611  nucleoid protein HU beta subunit  44.83 
 
 		 90 aa  74.3  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000132089  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3994  histone family protein DNA-binding protein  45.98 
 
 		 90 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4025  transcriptional regulator HU subunit alpha  45.98 
 
 		 90 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0158227 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0115  histone family protein DNA-binding protein  44.83 
 
 		 95 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552761  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5469  transcriptional regulator HU subunit alpha  45.98 
 
 		 90 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.129609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4234  transcriptional regulator HU subunit alpha  45.98 
 
 		 90 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4543  transcriptional regulator HU subunit alpha  45.98 
 
 		 90 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.440082  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2014  histone family protein DNA-binding protein  40.23 
 
 		 90 aa  74.3  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000105311  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4448  transcriptional regulator HU subunit alpha  45.98 
 
 		 90 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.302586  hitchhiker  0.00101008 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>