52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0609 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0609  chemotaxis protein  100 
 
 
229 aa  461  1e-129  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.147414 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0387  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  47.2 
 
 
196 aa  145  5e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2224  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  46.58 
 
 
197 aa  141  6e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.659574  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0488  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  46.58 
 
 
159 aa  138  6e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405335  normal  0.531435 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0418  chemotaxis protein  45.51 
 
 
178 aa  137  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.499236  normal  0.280148 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0451  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  45.51 
 
 
178 aa  137  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.149721  normal  0.211219 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0884  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  48.47 
 
 
177 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156124  hitchhiker  0.002075 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2571  hypothetical protein  37.06 
 
 
259 aa  97.4  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.352522  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1674  hypothetical protein  37.72 
 
 
237 aa  95.9  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3193  hypothetical protein  35.88 
 
 
260 aa  95.5  7e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4723  hypothetical protein  35.5 
 
 
259 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1840  hypothetical protein  35.5 
 
 
260 aa  92.8  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0085031 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4123  hypothetical protein  36.09 
 
 
257 aa  92.8  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.40781 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3212  hypothetical protein  36.36 
 
 
256 aa  90.9  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2836  hypothetical protein  35.91 
 
 
259 aa  88.6  8e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1335  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  35.29 
 
 
263 aa  88.6  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0211  hypothetical protein  34.46 
 
 
253 aa  87.4  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.730473  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0191  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  38.1 
 
 
236 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0876048  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3649  hypothetical protein  37.43 
 
 
236 aa  85.1  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0137828 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0365  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  41.36 
 
 
183 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0207321  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3105  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  32.81 
 
 
241 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.163127  normal  0.170192 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2879  hypothetical protein  32.81 
 
 
241 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364633  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2377  hypothetical protein  33.14 
 
 
174 aa  77.4  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.388128 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3002  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  32.81 
 
 
241 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1735  hypothetical protein  30.52 
 
 
254 aa  74.7  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.9552  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0815  hypothetical protein  39.34 
 
 
435 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.872238  normal  0.105867 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1950  hypothetical protein  40.17 
 
 
440 aa  72  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.309179 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0889  hypothetical protein  37.82 
 
 
399 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.135602 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0849  hypothetical protein  37.82 
 
 
399 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00517849 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4931  hypothetical protein  35.65 
 
 
288 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154084  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4959  hypothetical protein  37.39 
 
 
294 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.096287  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5406  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  29.57 
 
 
238 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2148  chemotaxis protein CheZ, putative  28.21 
 
 
242 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.992761  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0481  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  28.28 
 
 
242 aa  50.8  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1621  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  30.21 
 
 
248 aa  45.4  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3732  hypothetical protein  38.24 
 
 
121 aa  45.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0749  chemotaxis phosphatase, CheZ  24.83 
 
 
217 aa  43.1  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1546  chemotaxis regulator CheZ  26.55 
 
 
214 aa  42.4  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2075  chemotaxis regulator CheZ  27.84 
 
 
214 aa  42.4  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000441375 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2130  chemotaxis regulator CheZ  27.84 
 
 
214 aa  42.4  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000301905 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2070  chemotaxis regulator CheZ  27.84 
 
 
214 aa  42.4  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492059 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1207  chemotaxis regulator CheZ  27.84 
 
 
214 aa  42.4  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1330  chemotaxis regulator CheZ  27.84 
 
 
214 aa  42.4  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000240713 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1521  chemotaxis protein CheZ  23.17 
 
 
243 aa  42  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1977  chemotaxis regulator CheZ  27.55 
 
 
214 aa  42  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01852  chemotaxis regulator, protein phosphatase for CheY  27.55 
 
 
214 aa  42  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.850509  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01841  hypothetical protein  27.55 
 
 
214 aa  42  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.64287  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1759  chemotaxis phosphatase, CheZ  27.55 
 
 
214 aa  42  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.414683  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1303  chemotaxis regulator CheZ  27.55 
 
 
214 aa  42  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238575 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2619  chemotaxis regulator CheZ  27.55 
 
 
214 aa  42  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000452679 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2114  chemotaxis regulator CheZ  27.55 
 
 
214 aa  42  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.636511  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1751  chemotaxis regulator CheZ  27.55 
 
 
214 aa  42  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>