More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1042 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1042  ABC transporter related  100 
 
 
274 aa  538  9.999999999999999e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.198308 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2175  ABC transporter related  54.47 
 
 
254 aa  225  5.0000000000000005e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1487  ATPase  44.73 
 
 
251 aa  199  5e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51658  normal  0.183723 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3726  ABC transporter related  45.42 
 
 
255 aa  194  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3370  ABC transporter-related protein  47.68 
 
 
243 aa  194  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.177964 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3622  ABC transporter related protein  45.42 
 
 
255 aa  194  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10481  ABC transporter ATP-binding protein  41.77 
 
 
265 aa  194  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.194871  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1011  ATPase  44.3 
 
 
255 aa  193  3e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.204422  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0038  ABC transporter ATP-binding protein  41.77 
 
 
265 aa  191  8e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06281  ABC transporter ATP-binding protein  38.89 
 
 
254 aa  191  8e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06581  ABC transporter ATP-binding protein  41.77 
 
 
265 aa  191  9e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.173088  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06581  ABC transporter ATP-binding protein  38.89 
 
 
254 aa  191  1e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.505293  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1277  ABC transporter related protein  48.77 
 
 
247 aa  191  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3167  ABC transporter related  48.57 
 
 
249 aa  189  4e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.473142  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0602  ABC transporter ATP-binding protein  38 
 
 
254 aa  188  5.999999999999999e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06671  ABC transporter ATP-binding protein  38 
 
 
254 aa  188  9e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.12917  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4438  ABC transporter related  47.5 
 
 
246 aa  186  4e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.845686  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5757  ABC transporter related protein  45.85 
 
 
263 aa  186  4e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.329137  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3069  ABC transporter related  46.98 
 
 
262 aa  185  6e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627789  hitchhiker  0.00392606 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1399  ABC transporter related  44.49 
 
 
246 aa  184  9e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.765734  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18701  ABC transporter ATP-binding protein  43.88 
 
 
265 aa  184  9e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.549053 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3636  ABC transporter-related protein  42.15 
 
 
249 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0038  manganese ABC transporter, ATP-binding protein  41.63 
 
 
249 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000473887  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3051  chelated iron transport system membrane protein YfeB  39.92 
 
 
273 aa  181  9.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0128316 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1258  ABC transporter related  44.4 
 
 
289 aa  181  9.000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.822153  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3067  chelated iron transport system membrane protein YfeB  40.34 
 
 
273 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.381864  normal  0.0646347 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3172  chelated iron transport system membrane protein YfeB  40.34 
 
 
273 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.513641  normal  0.970851 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3015  chelated iron transport system membrane protein YfeB  40.34 
 
 
273 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.105627 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1310  iron chelate ABC transporter, ATP-binding protein  40.42 
 
 
280 aa  181  1e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2984  chelated iron transport system membrane protein YfeB  40.34 
 
 
273 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02040  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  39.02 
 
 
254 aa  180  2e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3403  ABC transporter related  41.56 
 
 
292 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2081  ABC transporter related  44 
 
 
265 aa  180  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.872103  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3261  ABC transporter related  38.76 
 
 
257 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000189494  normal  0.195184 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2065  metal ABC transporter, ATP-binding protein  40.52 
 
 
249 aa  179  4e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1723  ABC transporter related  44.3 
 
 
263 aa  178  8e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3283  ABC transporter related protein  37.5 
 
 
249 aa  178  8e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2026  Mn/Zn ABC transporter, ATP-binding protein  42.02 
 
 
261 aa  178  1e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.237224  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13200  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  46.67 
 
 
262 aa  177  2e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330616  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0329  ABC transporter-like protein  41.53 
 
 
256 aa  177  2e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0624  ABC transporter-like protein  42 
 
 
259 aa  176  3e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0130824  normal  0.079579 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1033  hypothetical protein  37.4 
 
 
264 aa  176  4e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0031  ABC transporter related  41.74 
 
 
251 aa  175  7e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2966  ABC transporter ATP-binding protein  40.52 
 
 
249 aa  175  8e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00148861  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3191  ABC transporter ATP-binding protein  40.52 
 
 
249 aa  175  8e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.540176  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0723  AfeB  35.54 
 
 
280 aa  175  8e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0402622  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1225  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  39.33 
 
 
255 aa  174  9.999999999999999e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3699  ABC transporter related  41.67 
 
 
288 aa  174  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0223  ABC transporter related protein  34.31 
 
 
236 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1112  ABC transporter related  41.23 
 
 
274 aa  174  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0689  ABC transporter related protein  42.86 
 
 
258 aa  173  2.9999999999999996e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.010451  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2148  ABC transporter related  39.18 
 
 
263 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3279  ABC transporter related  40.91 
 
 
267 aa  172  5e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3554  ABC transporter related  43.57 
 
 
259 aa  172  5.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0438538  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2915  ABC transporter related  42.48 
 
 
311 aa  172  6.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1206  ABC transporter related  41.67 
 
 
299 aa  171  7.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.508539  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1658  metal transport system ATP-binding protein  40.5 
 
 
298 aa  171  1e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150041 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3171  iron/manganese transport system inner membrane protein SitB  39.38 
 
 
275 aa  171  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.775494 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1590  ABC transporter related  42.5 
 
 
262 aa  170  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2132  ABC transporter-related protein  38.25 
 
 
296 aa  170  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.350282 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2142  ABC transporter related protein  43.67 
 
 
248 aa  170  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0099  ABC transporter related  43.88 
 
 
268 aa  169  3e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0083  iron/manganese transport system membrane protein SitB  39.82 
 
 
275 aa  169  4e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.921207  hitchhiker  0.000000822462 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2894  ABC transporter component  41.53 
 
 
300 aa  169  4e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.630242  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1918  ABC transporter related  39.09 
 
 
296 aa  169  4e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0148813  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0951  ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component  37.55 
 
 
247 aa  168  7e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0327  iron ABC transporter, ATP-binding protein  38.86 
 
 
252 aa  168  9e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000461185  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4029  ABC transporter related  41.7 
 
 
248 aa  168  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.218483  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31320  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  43.7 
 
 
248 aa  168  1e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1611  iron/manganese transport system inner membrane protein SitB  39.38 
 
 
275 aa  167  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00104171  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2065  ABC transporter related  44.67 
 
 
258 aa  167  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2803  ABC transporter related  39.22 
 
 
266 aa  167  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1440  manganese ABC transporter ATP-binding protein  35.71 
 
 
237 aa  167  2.9999999999999998e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1662  ABC-type Mn/Zn transport systems ATPase component  40.55 
 
 
243 aa  166  5e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.184218  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0702  ABC transporter related  35.56 
 
 
236 aa  165  5.9999999999999996e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000834751  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0339  ABC transporter, ATP-binding protein  37.66 
 
 
259 aa  165  8e-40  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0116961  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2210  ABC transporter related protein  38.75 
 
 
296 aa  165  9e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0132469  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2601  ABC transporter related  39.26 
 
 
298 aa  165  9e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2999  ABC transporter related  40.41 
 
 
251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000922039  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1257  ABC transporter related  42.31 
 
 
271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0480594  hitchhiker  0.000898687 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0248  ABC transporter related  43.36 
 
 
296 aa  163  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2631  ATP-binding transport protein  37.19 
 
 
296 aa  163  3e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0977377  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1814  ABC transporter related  37.19 
 
 
296 aa  163  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0381501  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1704  chelated iron ABC transporter, ATP-binding protein YfeB  37.19 
 
 
296 aa  163  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2852  ABC transporter related  40.56 
 
 
271 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3045  ABC transporter related  39.76 
 
 
286 aa  162  5.0000000000000005e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0155685  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1142  ABC transporter related  43.88 
 
 
260 aa  161  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1389  ABC transporter related  43.5 
 
 
251 aa  160  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0369589  normal  0.478115 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0533  ABC transporter related  40.96 
 
 
255 aa  160  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.622469  normal  0.988853 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0794  ABC transporter related  37.55 
 
 
248 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2564  ABC transporter related  41.77 
 
 
297 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.400357  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0905  ABC Mn+2/Fe+2 transporter, ATPase subunit SitB  41.77 
 
 
297 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5387  ABC transporter related  40.62 
 
 
297 aa  159  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950871  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3314  ABC transporter related  38.49 
 
 
262 aa  159  4e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4770  ABC transporter related  44.29 
 
 
250 aa  159  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.285332  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3219  ABC transporter related  38.24 
 
 
249 aa  159  5e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.281144  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03380  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  42.26 
 
 
258 aa  156  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.379323  normal  0.939533 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0371  ABC transporter-like protein  44.53 
 
 
256 aa  156  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3453  ABC transporter related  40.79 
 
 
300 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.859541 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1994  ABC transporter related protein  41.1 
 
 
262 aa  154  2e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>