128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1749 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1749  hypothetical protein  100 
 
 
288 aa  597  1e-170  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.963768  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2456  protein of unknown function RIO1  57.14 
 
 
259 aa  292  5e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2499  protein of unknown function RIO1  56.97 
 
 
258 aa  282  5.000000000000001e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2792  Non-specific serine/threonine protein kinase  56.22 
 
 
261 aa  276  4e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0132105  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2464  protein of unknown function RIO1  49.41 
 
 
256 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000196699  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0947  protein of unknown function RIO1  51.45 
 
 
264 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1785  hypothetical protein  47.33 
 
 
260 aa  226  3e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2087  RIO-like kinase  44.86 
 
 
291 aa  209  5e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3650  RIO-like kinase  44.84 
 
 
291 aa  207  2e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0170  protein of unknown function RIO1  46.48 
 
 
265 aa  205  7e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2660  protein of unknown function RIO1  40.91 
 
 
334 aa  198  7e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.365628  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1410  non-specific serine/threonine protein kinase  42.42 
 
 
259 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0513  protein of unknown function RIO1  43.62 
 
 
241 aa  192  7e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0701  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.54 
 
 
306 aa  189  4e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.577267  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1476  non-specific serine/threonine protein kinase  42.68 
 
 
273 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.525707  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1626  non-specific serine/threonine protein kinase  41.88 
 
 
273 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0288  non-specific serine/threonine protein kinase  41.88 
 
 
273 aa  172  5e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.414498  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0498  non-specific serine/threonine protein kinase  40.99 
 
 
280 aa  172  6.999999999999999e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.30075  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1002  protein of unknown function RIO1  41.03 
 
 
273 aa  171  1e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.397015  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1605  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.27 
 
 
338 aa  169  4e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0594  non-specific serine/threonine protein kinase  38.72 
 
 
270 aa  160  2e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.881106  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1280  RIO-like kinase  39.57 
 
 
254 aa  160  3e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82126  protein serine kinase  38.86 
 
 
495 aa  159  4e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.103532 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1850  protein of unknown function RIO1  36.51 
 
 
268 aa  152  7e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0857988 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01780  extragenic suppressor of bimD6 mutation, putative  37.45 
 
 
622 aa  150  2e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50135  predicted protein  34.57 
 
 
626 aa  149  4e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06363  Extragenic suppressor of the bimD6 mutationPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O13330]  33.96 
 
 
558 aa  145  1e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.46432  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1180  protein of unknown function RIO1  35.83 
 
 
267 aa  142  7e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0186  RIO-like kinase  38.77 
 
 
254 aa  141  9.999999999999999e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0203142  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_2858  predicted protein  34.2 
 
 
375 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.850153 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0852  non-specific serine/threonine protein kinase  34.44 
 
 
266 aa  136  4e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.738588 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0654  non-specific serine/threonine protein kinase  36.45 
 
 
248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.106036  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0773  protein of unknown function RIO1  32.5 
 
 
266 aa  125  8.000000000000001e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.5402  hitchhiker  0.00560977 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46310  predicted protein  32.16 
 
 
1269 aa  125  1e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.789471  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2603  protein of unknown function RIO1  28.51 
 
 
286 aa  91.3  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1753  protein of unknown function RIO1  31.56 
 
 
417 aa  85.5  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.107958  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2195  protein of unknown function RIO1  31.56 
 
 
412 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0554937  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0811  protein of unknown function RIO1  31.31 
 
 
295 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1682  protein of unknown function RIO1  31.56 
 
 
411 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.179514  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0434  hypothetical protein  29.78 
 
 
286 aa  84.7  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1194  protein of unknown function RIO1  29.95 
 
 
285 aa  84.3  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4056  protein of unknown function RIO1  27.97 
 
 
308 aa  82.4  0.000000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2912  hypothetical protein  30.14 
 
 
297 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.562363 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2841  serine/threonine protein kinase  28.98 
 
 
381 aa  82  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0659409  normal  0.112308 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63200  hypothetical protein  30.66 
 
 
297 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2779  protein of unknown function RIO1  30.14 
 
 
297 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.432077  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2995  protein of unknown function RIO1  30.25 
 
 
282 aa  81.6  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1034  RIO-type serine/threonine protein kinase  28.39 
 
 
282 aa  81.3  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0400289  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0611  hypothetical protein  36.22 
 
 
282 aa  80.5  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.14502 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30019  predicted protein  29.05 
 
 
299 aa  80.5  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0257867  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3036  protein of unknown function RIO1  30.62 
 
 
314 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2037  protein of unknown function RIO1  29.77 
 
 
283 aa  79  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40859  predicted protein  29.46 
 
 
320 aa  78.2  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0450714 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2871  protein of unknown function RIO1  29.67 
 
 
297 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6050  hypothetical protein  29.65 
 
 
300 aa  78.2  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5502  hypothetical protein  31.78 
 
 
297 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0163  protein of unknown function RIO1  29.25 
 
 
284 aa  77  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2321  protein of unknown function RIO1  30.9 
 
 
302 aa  77  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.243501 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6141  protein of unknown function RIO1  30.85 
 
 
296 aa  76.6  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.487286  normal  0.0422512 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1442  protein of unknown function RIO1  29 
 
 
283 aa  76.3  0.0000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.296233  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1606  protein of unknown function RIO1  31.39 
 
 
275 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000519001  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3148  protein of unknown function RIO1  30.19 
 
 
285 aa  76.6  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0482  protein of unknown function RIO1  28.64 
 
 
285 aa  75.5  0.0000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3105  protein of unknown function RIO1  31.25 
 
 
450 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.052568  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0748  RIO1/ZK632.3/MJ0444 family protein  30.95 
 
 
298 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0650  hypothetical protein  30.95 
 
 
298 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1558  putative RIO1/ZK632.3/MJ0444 family protein  30.05 
 
 
286 aa  72.4  0.000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0385053  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3233  protein of unknown function RIO1  26.32 
 
 
240 aa  72.4  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0658  hypothetical protein  30 
 
 
298 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.390403  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33379  predicted protein  25.23 
 
 
422 aa  71.2  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00101834 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2105  protein of unknown function RIO1  28.04 
 
 
302 aa  70.9  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2401  serine/threonine protein kinase  29.22 
 
 
302 aa  70.9  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.225173  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2197  protein of unknown function RIO1  28.71 
 
 
279 aa  70.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0148625  hitchhiker  0.00120245 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02913  RIO1//family protein  27.2 
 
 
286 aa  71.2  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3677  protein of unknown function RIO1  29.44 
 
 
286 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000162658  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0676  protein of unknown function RIO1  29.44 
 
 
286 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.295058  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0707  protein of unknown function RIO1  29.44 
 
 
286 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.938334  normal  0.753401 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0697  protein of unknown function RIO1  29.44 
 
 
286 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0664  protein of unknown function RIO1  28.37 
 
 
285 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0129863  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3358  protein of unknown function RIO1  28.37 
 
 
285 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.119571  normal  0.025527 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0663  protein of unknown function RIO1  28.5 
 
 
285 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.24041  normal  0.125481 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1049  protein of unknown function RIO1  26.79 
 
 
316 aa  69.7  0.00000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.290796  decreased coverage  0.00000000362034 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3183  protein of unknown function RIO1  27.36 
 
 
286 aa  69.3  0.00000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0739  protein of unknown function RIO1  30.59 
 
 
301 aa  69.7  0.00000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000129617  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1654  protein of unknown function RIO1  29.03 
 
 
299 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000363916  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1977  protein of unknown function RIO1  29.08 
 
 
306 aa  68.9  0.00000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1866  hypothetical protein  27.57 
 
 
278 aa  68.9  0.00000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.012692  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5852  protein of unknown function RIO1  30 
 
 
387 aa  68.9  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.445195  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3868  protein of unknown function RIO1  29.03 
 
 
286 aa  68.2  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0326481  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2335  protein of unknown function RIO1  28.5 
 
 
306 aa  68.6  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.861409  normal  0.0151879 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3392  protein of unknown function RIO1  28.5 
 
 
285 aa  67.8  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0706  protein of unknown function RIO1  26.05 
 
 
285 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0659  protein of unknown function RIO1  27.43 
 
 
286 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4795  hypothetical protein  29.49 
 
 
285 aa  67.4  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.367167  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2078  hypothetical protein  28.5 
 
 
285 aa  67  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2984  Serine/threonine protein kinase involved in cell cycle control-like protein  30.35 
 
 
291 aa  67.4  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.513296  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5882  protein of unknown function RIO1  27.57 
 
 
285 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0689  protein of unknown function RIO1  25.5 
 
 
306 aa  66.6  0.0000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.126334 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0196  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 
301 aa  66.2  0.0000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.797756  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1386  protein of unknown function RIO1  29.3 
 
 
282 aa  66.2  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>