More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1271 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1271  malate dehydrogenase  100 
 
 
319 aa  655    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.845217  normal  0.680295 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2343  malate dehydrogenase  59.55 
 
 
317 aa  397  1e-109  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0492  malate dehydrogenase  58.54 
 
 
332 aa  391  1e-107  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2444  malate dehydrogenase  57.01 
 
 
317 aa  379  1e-104  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2590  malate dehydrogenase  53.63 
 
 
318 aa  345  7e-94  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.662548  normal  0.725882 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1548  malate dehydrogenase  39.03 
 
 
314 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0244  malate dehydrogenase  37.91 
 
 
314 aa  229  3e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0959  malate dehydrogenase  38.24 
 
 
314 aa  229  5e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.975957  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1669  malate dehydrogenase  37.91 
 
 
314 aa  228  1e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0936564  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0610  malate dehydrogenase  39.02 
 
 
313 aa  222  7e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2007  L-lactate dehydrogenase  37.34 
 
 
314 aa  186  5e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.227909  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1784  L-lactate dehydrogenase  37.34 
 
 
314 aa  186  5e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.521865  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1763  L-lactate dehydrogenase  37.34 
 
 
314 aa  186  5e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00307694  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1741  L-lactate dehydrogenase  37.34 
 
 
314 aa  186  5e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1923  L-lactate dehydrogenase  37.34 
 
 
314 aa  186  5e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0148797  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2028  L-lactate dehydrogenase  37.34 
 
 
314 aa  186  5e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115403  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1959  L-lactate dehydrogenase  37.34 
 
 
314 aa  186  5e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000164106 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0952  L-lactate dehydrogenase  35.13 
 
 
319 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.172568  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2797  L-lactate dehydrogenase  36.86 
 
 
314 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1927  L-lactate dehydrogenase  37.01 
 
 
314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3505  L-lactate dehydrogenase  35.92 
 
 
315 aa  180  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4762  L-lactate dehydrogenase  34.74 
 
 
314 aa  176  4e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105004  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4600  L-lactate dehydrogenase  34.74 
 
 
314 aa  176  4e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4624  L-lactate dehydrogenase  34.74 
 
 
314 aa  176  4e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000281298  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5125  L-lactate dehydrogenase  34.74 
 
 
314 aa  176  4e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.464176  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0236  L-lactate dehydrogenase  34.74 
 
 
314 aa  176  4e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0479489  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4981  L-lactate dehydrogenase  34.74 
 
 
314 aa  176  4e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5002  L-lactate dehydrogenase  34.74 
 
 
314 aa  176  4e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0693832  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1484  L-lactate dehydrogenase  35.39 
 
 
314 aa  176  5e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.874193  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5032  L-lactate dehydrogenase  34.42 
 
 
314 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4713  L-lactate dehydrogenase  35.06 
 
 
314 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0930  L-lactate dehydrogenase  34.81 
 
 
319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000455323  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5012  L-lactate dehydrogenase  34.42 
 
 
314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0813817  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1053  L-lactate dehydrogenase  35.85 
 
 
332 aa  171  1e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.689779 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1918  L-lactate dehydrogenase  35 
 
 
314 aa  171  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000101641  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3415  L-lactate dehydrogenase  36.52 
 
 
314 aa  169  4e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000130483 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0700  L-lactate dehydrogenase  35.24 
 
 
318 aa  169  8e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0489  L-lactate dehydrogenase  34.08 
 
 
319 aa  168  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2485  L-lactate dehydrogenase  35.6 
 
 
316 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0241914  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0421  L-lactate dehydrogenase  34.71 
 
 
314 aa  166  4e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000701213  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1121  malate dehydrogenase  33.22 
 
 
309 aa  166  5e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0624  malate dehydrogenase  31.15 
 
 
332 aa  165  6.9999999999999995e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000517637  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1746  Lactate/malate dehydrogenase  33.87 
 
 
317 aa  165  8e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.591048  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1893  L-lactate dehydrogenase  32.61 
 
 
307 aa  165  8e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1798  L-lactate dehydrogenase  35.11 
 
 
314 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0938319  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0137  L-lactate dehydrogenase  32.57 
 
 
310 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000668633  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0912  malate dehydrogenase, NAD-dependent  35.78 
 
 
312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0881394  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2255  malate dehydrogenase  33.23 
 
 
311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4826  L-lactate dehydrogenase  34.82 
 
 
316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1257  L-lactate dehydrogenase  36.01 
 
 
320 aa  163  3e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0102  L-lactate dehydrogenase  33.88 
 
 
317 aa  162  7e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.02476  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1826  malate dehydrogenase (NAD)  37.32 
 
 
317 aa  161  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.490371  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0338  malate dehydrogenase  34.64 
 
 
304 aa  162  1e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4869  L-lactate dehydrogenase  34.19 
 
 
316 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4708  L-lactate dehydrogenase  34.19 
 
 
401 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5142  L-lactate dehydrogenase  34.19 
 
 
316 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000108181  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4723  L-lactate dehydrogenase  34.19 
 
 
316 aa  161  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5240  L-lactate dehydrogenase  34.19 
 
 
316 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0216  L-lactate dehydrogenase  35.78 
 
 
311 aa  160  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5106  L-lactate dehydrogenase  34.19 
 
 
316 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0100  L-lactate dehydrogenase  33.87 
 
 
316 aa  160  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0267583  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3591  L-lactate dehydrogenase  33.87 
 
 
316 aa  160  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.729354  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0165  L-lactate dehydrogenase  33.87 
 
 
320 aa  160  3e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5140  L-lactate dehydrogenase  33.87 
 
 
316 aa  160  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000543313  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5135  L-lactate dehydrogenase  34.19 
 
 
316 aa  159  5e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.28654  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1361  L-lactate dehydrogenase  33.76 
 
 
317 aa  159  5e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0098  L-lactate dehydrogenase  33.22 
 
 
317 aa  159  6e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409551  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4206  malate dehydrogenase  34.29 
 
 
314 aa  158  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0347  malate dehydrogenase  31.29 
 
 
313 aa  157  2e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.536254  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0584  L-lactate dehydrogenase  34.19 
 
 
320 aa  157  2e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.543838 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1053  L-lactate dehydrogenase  33.88 
 
 
317 aa  157  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.189313  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1582  L-lactate dehydrogenase  35.97 
 
 
309 aa  157  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4103  malate dehydrogenase  32.59 
 
 
310 aa  157  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0985  L-lactate dehydrogenase  34.96 
 
 
309 aa  157  3e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1919  L-lactate dehydrogenase  35.76 
 
 
313 aa  156  4e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0345  malate dehydrogenase (NAD)  33.12 
 
 
318 aa  156  4e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.569498  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0231  L-lactate dehydrogenase  33.77 
 
 
317 aa  156  6e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4459  malate dehydrogenase, NAD-dependent  34.75 
 
 
309 aa  156  6e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.688925 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1299  lactate/malate dehydrogenase  30.97 
 
 
309 aa  155  6e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0225  L-lactate dehydrogenase  33.77 
 
 
317 aa  156  6e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1748  malate dehydrogenase  30.55 
 
 
307 aa  154  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.747056 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1510  malate dehydrogenase  32.39 
 
 
310 aa  154  1e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0354026  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0463  L-lactate dehydrogenase  34.73 
 
 
335 aa  155  1e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.23443  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1065  L-lactate dehydrogenase  30.52 
 
 
311 aa  155  1e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000229856  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1867  malate dehydrogenase  33.88 
 
 
308 aa  154  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00765461  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1121  malate dehydrogenase  29.07 
 
 
316 aa  154  2e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0398  malate dehydrogenase  30.67 
 
 
313 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3778  L-lactate dehydrogenase  33.02 
 
 
331 aa  153  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95012 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0605  malate dehydrogenase  32.38 
 
 
332 aa  153  4e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1088  malate dehydrogenase, NAD-dependent  32.11 
 
 
316 aa  153  5e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00100592  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23050  malate dehydrogenase (NAD)  40.38 
 
 
331 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.697126  normal  0.046368 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16140  L-lactate dehydrogenase  34.27 
 
 
322 aa  152  7e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0169576  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05842  hypothetical protein similar to L-lactate dehydrogenase (Eurofung)  30.87 
 
 
318 aa  152  8.999999999999999e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.189736  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1257  L-lactate dehydrogenase  32.45 
 
 
328 aa  152  8.999999999999999e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000840632  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2628  malate dehydrogenase  30.34 
 
 
320 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0087  L-lactate dehydrogenase  32.9 
 
 
316 aa  151  1e-35  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.839635  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0080  malate dehydrogenase  30.52 
 
 
320 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5004  malate dehydrogenase  31.17 
 
 
320 aa  150  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0968  malate dehydrogenase  30.34 
 
 
338 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2677  malate dehydrogenase  30.48 
 
 
312 aa  151  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>