99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0179 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0179  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  504  9.999999999999999e-143  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1669  TPR repeat-containing protein  45.26 
 
 		 659 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.3895  hitchhiker  0.0000000000177402 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1793  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  29.44 
 
 		 486 aa  85.5  7e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0115  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 552 aa  78.6  0.00000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.368367  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4137  signal transduction histidine kinase, LytS  37.3 
 
 		 572 aa  75.9  0.0000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3938  signal transduction histidine kinase, LytS  37.3 
 
 		 572 aa  75.9  0.0000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1965  histidine kinase internal region  28.42 
 
 		 576 aa  75.5  0.0000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00985  hypothetical protein  28.12 
 
 		 556 aa  72.4  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2468  stage II sporulation E family protein  28.04 
 
 		 455 aa  72.4  0.000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0899  signal transduction histidine kinase, LytS  29.23 
 
 		 572 aa  72  0.000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144133  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0225  hypothetical protein  30.87 
 
 		 558 aa  72  0.000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0146  signal transduction histidine kinase, LytS  37.07 
 
 		 565 aa  69.3  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.889074  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4117  sensor histidine kinase  37.07 
 
 		 565 aa  69.7  0.00000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.645201 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10410  signal transduction histidine kinase, LytS  27.74 
 
 		 578 aa  69.3  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014237  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4007  sensor histidine kinase  36.21 
 
 		 565 aa  68.9  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2170  signal transduction histidine kinase, LytS  31.71 
 
 		 581 aa  68.6  0.00000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.041747  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004413  autolysin sensor kinase  27.08 
 
 		 556 aa  68.6  0.00000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2919  signal transduction histidine kinase, LytS  30.72 
 
 		 565 aa  68.2  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.125544 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1878  signal transduction histidine kinase, LytS  32.52 
 
 		 581 aa  68.2  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.770711  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2444  signal transduction histidine kinase, LytS  32.8 
 
 		 566 aa  67.4  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.221441  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1084  histidine kinase internal region  30.87 
 
 		 575 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0370265  normal  0.975996 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2094  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase internal region:5TM Receptors of the LytS-YhcK type, transmembrane region  33.51 
 
 		 577 aa  66.6  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2358  signal transduction histidine kinase, LytS  31.11 
 
 		 566 aa  65.5  0.0000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551334  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0377  Signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  34.15 
 
 		 576 aa  65.5  0.0000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2355  signal transduction histidine kinase, LytS  36.59 
 
 		 580 aa  65.5  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.461368  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0059  signal transduction histidine kinase, LytS  30.92 
 
 		 557 aa  65.1  0.0000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.996795  hitchhiker  0.000632462 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  30.92 
 
 		 557 aa  65.1  0.0000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0058  signal transduction histidine kinase, LytS  30.92 
 
 		 557 aa  65.1  0.0000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  32.77 
 
 		 557 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0736236  hitchhiker  0.000664675 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4300  signal transduction histidine kinase, LytS  30.26 
 
 		 557 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0131803  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0056  signal transduction histidine kinase, LytS  32.77 
 
 		 557 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0698199  decreased coverage  0.000000126428 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3404  signal transduction histidine kinase, LytS  33.88 
 
 		 563 aa  63.9  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.823402  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02251  hypothetical protein  33.33 
 
 		 565 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2792  signal transduction histidine kinase, LytS  32.89 
 
 		 564 aa  64.7  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000275265  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1549  signal transduction histidine kinase, LytS  31.28 
 
 		 560 aa  64.3  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02290  predicted sensory kinase in two-component system with YpdB  33.33 
 
 		 565 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1277  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 565 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1282  signal transduction histidine kinase, LytS  31.75 
 
 		 569 aa  64.3  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0211527 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1659  signal transduction histidine kinase, LytS  30.33 
 
 		 565 aa  63.5  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000213246  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1674  signal transduction histidine kinase, LytS  29.86 
 
 		 565 aa  63.2  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0178726  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2698  histidine kinase internal region  34.64 
 
 		 576 aa  63.2  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3612  sensor histidine kinase  39.18 
 
 		 559 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.857731 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2749  sensor histidine kinase  39.18 
 
 		 559 aa  63.2  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2532  sensor histidine kinase  39.18 
 
 		 559 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2517  sensor histidine kinase  39.18 
 
 		 559 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1289  signal transduction histidine kinase, LytS  39.18 
 
 		 559 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2670  sensor histidine kinase  39.18 
 
 		 559 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2684  signal transduction histidine kinase, LytS  29.86 
 
 		 565 aa  62.8  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.287497  hitchhiker  0.00116896 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1696  signal transduction histidine kinase, LytS  29.86 
 
 		 565 aa  62.8  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0311025  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2822  sensor histidine kinase  29.86 
 
 		 560 aa  61.6  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2593  signal transduction histidine kinase, LytS  29.86 
 
 		 560 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0091271  hitchhiker  0.0052142 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3543  signal transduction histidine kinase, LytS  30.66 
 
 		 403 aa  60.8  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00838652  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0160  ATP-binding region, ATPase-like  34.56 
 
 		 567 aa  60.5  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2328  signal transduction histidine kinase, LytS  31.43 
 
 		 565 aa  60.1  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0659282  normal  0.34431 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1931  protein serine/threonine phosphatase  27.37 
 
 		 451 aa  59.3  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.307044 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3061  signal transduction histidine kinase, LytS  35.43 
 
 		 560 aa  58.9  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3169  signal transduction histidine kinase, LytS  35.43 
 
 		 560 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1480  signal transduction histidine kinase, LytS  33.61 
 
 		 557 aa  57.4  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.336148  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2882  signal transduction histidine kinase, LytS  28.57 
 
 		 558 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0010106  unclonable  0.0000000000662994 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1766  signal transduction histidine kinase, LytS  29.11 
 
 		 558 aa  56.6  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.420125  hitchhiker  0.00747728 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0182  sensor histidine kinase, putative  25.47 
 
 		 581 aa  54.7  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1017  sensor histidine kinase, putative  32.17 
 
 		 579 aa  54.7  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2398  signal transduction histidine kinase, LytS  36 
 
 		 568 aa  54.3  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2433  signal transduction histidine kinase, LytS  30.43 
 
 		 558 aa  53.9  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.618184  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0958  signal transduction histidine kinase, LytS  35.26 
 
 		 563 aa  52.8  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0956  signal transduction histidine kinase, LytS  37.9 
 
 		 563 aa  50.1  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.324121  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0222  signal transduction histidine kinase, LytS  27.84 
 
 		 561 aa  49.7  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2724  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 562 aa  48.1  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2349  sensor histidine kinase  32.69 
 
 		 561 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.896071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4588  signal transduction histidine kinase, LytS  33.96 
 
 		 561 aa  47  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2305  sensor histidine kinase  32.69 
 
 		 561 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2398  sensor histidine kinase  32.69 
 
 		 561 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2394  sensor histidine kinase  32.69 
 
 		 561 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.764867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2506  sensor histidine kinase  32.69 
 
 		 561 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.454206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3113  sensor histidine kinase  29.38 
 
 		 561 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.212432 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1532  signal transduction histidine kinase, LytS  29.38 
 
 		 561 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.363202  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02013  hypothetical protein  29.38 
 
 		 561 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02055  predicted sensory kinase in two-component system with YehT  29.38 
 
 		 561 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2414  sensor histidine kinase  29.38 
 
 		 561 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1521  signal transduction histidine kinase, LytS  29.38 
 
 		 561 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0918  sensor histidine kinase  29.38 
 
 		 561 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.817517 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2260  sensor histidine kinase  29.38 
 
 		 561 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0866  sensor histidine kinase  29.38 
 
 		 561 aa  46.2  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0251  5TM Receptors of the LytS-YhcK type transmembrane region  28.19 
 
 		 584 aa  45.4  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0245  signal transduction histidine kinase, LytS  28.19 
 
 		 584 aa  45.4  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0903  signal transduction histidine kinase, LytS  28.68 
 
 		 587 aa  45.4  0.0009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2431  signal transduction histidine kinase, LytS  30.33 
 
 		 560 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000324417  normal  0.0100076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2501  signal transduction histidine kinase, LytS  30.33 
 
 		 560 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.443565  normal  0.0546493 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0884  membrane signal transduction histidine kinase  28.15 
 
 		 579 aa  45.1  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1319  membrane receptor, histidine kinase  26.26 
 
 		 560 aa  45.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3342  signal transduction histidine kinase, LytS  33.05 
 
 		 556 aa  43.1  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.891854 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1606  hypothetical protein  29.66 
 
 		 192 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000535134  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1391  hypothetical protein  29.66 
 
 		 192 aa  42.4  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000115789  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1502  hypothetical protein  29.66 
 
 		 192 aa  42.4  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000267879  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3808  hypothetical protein  29.66 
 
 		 192 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183657  hitchhiker  1.43383e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1537  hypothetical protein  29.66 
 
 		 192 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000148535  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1364  hypothetical protein  29.66 
 
 		 192 aa  42  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.70731e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1363  hypothetical protein  29.66 
 
 		 192 aa  42  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000746858  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1643  hypothetical protein  29.66 
 
 		 192 aa  42  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000917387  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>