More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_5657 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_5657  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 308 aa  608  1e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5367  LysR family transcriptional regulator  99.03 
 
 		 308 aa  604  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.592331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5278  LysR family transcriptional regulator  99.03 
 
 		 308 aa  604  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.786884  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2332  LysR family transcriptional regulator  72.09 
 
 		 310 aa  449  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.285545 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4315  LysR family transcriptional regulator  72.09 
 
 		 310 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.451981 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01564  predicted DNA-binding transcriptional regulator  31.79 
 
 		 297 aa  112  5e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2048  transcriptional regulator, LysR family  31.79 
 
 		 297 aa  112  5e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01554  hypothetical protein  31.79 
 
 		 297 aa  112  5e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1605  LysR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 297 aa  113  5e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2035  LysR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 297 aa  112  5e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1669  LysR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 297 aa  112  5e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2305  transcriptional regulator, LysR family  31.79 
 
 		 297 aa  112  6e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.112257 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1802  LysR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 297 aa  112  6e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5031  transcriptional regulator, LysR family  32.89 
 
 		 289 aa  112  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1781  transcriptional regulator, LysR family  31.79 
 
 		 297 aa  112  9e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1897  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 304 aa  105  7e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.202001  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2276  regulatory protein LysR  32.56 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0300565  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3962  LysR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 302 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0195836  normal  0.175267 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4425  LysR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 302 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.488055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3831  LysR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 302 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4537  LysR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 302 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.309073  normal  0.1504 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1308  LysR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 302 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.565063 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0256  transcriptional regulator, LysR family  34.15 
 
 		 322 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2043  transcriptional regulator, LysR family  33.17 
 
 		 298 aa  100  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637177  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4123  LysR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 302 aa  100  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.454072 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2344  transcriptional regulator, LysR family  32.68 
 
 		 298 aa  99.8  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1803  LysR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 301 aa  98.6  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2134  transcriptional regulator, LysR family  33.82 
 
 		 304 aa  98.6  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6486  LysR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 301 aa  97.4  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.898531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1442  transcriptional regulator, LysR family  39.29 
 
 		 306 aa  97.4  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.200576 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1918  LysR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 297 aa  96.3  6e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3117  transcriptional regulator, LysR family  30.67 
 
 		 306 aa  95.9  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2442  LysR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 299 aa  95.1  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.383889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0038  LysR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 294 aa  94.7  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5081  transcriptional regulator, LysR family  35.79 
 
 		 275 aa  93.6  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.12212 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1775  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 296 aa  93.2  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.310759  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68920  LysR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 304 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2320  LysR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 305 aa  92.8  6e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00283549  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2212  LysR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 296 aa  92.8  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00538572  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4520  Transcriptional regulator-like protein  32.7 
 
 		 291 aa  92.8  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.629454 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1662  transcriptional regulator, LysR family  37.5 
 
 		 296 aa  92.8  7e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7065  transcriptional regulator, LysR family  35.5 
 
 		 296 aa  92.4  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000862794  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3167  LysR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 307 aa  92  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2500  transcriptional regulator, LysR family  32.65 
 
 		 297 aa  91.7  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0719  LysR family regulatory protein  34.69 
 
 		 322 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0714085  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0532  LysR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 307 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.693788  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0550  LysR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 307 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1451  LysR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 307 aa  92  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.870434  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2879  LysR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 307 aa  92  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4202  LysR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 295 aa  91.7  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.932359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0137  LysR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 307 aa  92  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.750096  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1553  LysR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 305 aa  91.7  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5722  transcriptional regulator, LysR family  35.5 
 
 		 296 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.437697  normal  0.903757 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1982  LysR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 304 aa  91.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5919  transcriptional regulator, LysR family  35.5 
 
 		 296 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4970  transcriptional regulator, LysR family  35.5 
 
 		 296 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5766  putative transcriptional regulator  36.52 
 
 		 301 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1870  LysR family substrate binding transcriptional regulator  31.34 
 
 		 304 aa  91.7  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.102903  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1735  transcriptional regulator, LysR family  36.93 
 
 		 296 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185137  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000392  transcriptional regulator of alpha-acetolactate operon AlsR  31.36 
 
 		 293 aa  91.7  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00388737  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66490  LysR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 301 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1930  LysR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 306 aa  91.3  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0563526  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1376  cat operon transcriptional activator CatR  33.65 
 
 		 295 aa  90.5  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.345874  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0201  transcriptional regulator CatR  33.65 
 
 		 295 aa  90.5  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0985  transcriptional regulator CatR  33.65 
 
 		 295 aa  90.5  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460056  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2709  cat operon transcriptional activator CatR  33.65 
 
 		 295 aa  90.5  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.393204  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2565  cat operon transcriptional activator CatR  33.65 
 
 		 295 aa  90.5  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1573  cat operon transcriptional activator CatR  33.65 
 
 		 295 aa  90.5  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0232  cat operon transcriptional activator CatR  33.65 
 
 		 295 aa  90.5  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.691367  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2173  transcriptional regulator, LysR family  26.89 
 
 		 308 aa  90.9  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1384  LysR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 303 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.510026  normal  0.961764 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  32.18 
 
 		 292 aa  90.1  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6318  LysR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 296 aa  90.1  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1366  LysR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 303 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2391  transcriptional regulator, LysR family  31.13 
 
 		 297 aa  90.5  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0830106  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1852  LysR substrate binding domain-containing protein  30.67 
 
 		 299 aa  89.7  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1685  LysR substrate binding domain protein  30.67 
 
 		 299 aa  89.7  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.533068  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1657  LysR substrate binding domain-containing protein  30.67 
 
 		 299 aa  89.7  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1598  LysR substrate binding domain protein  30.67 
 
 		 299 aa  89.7  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1589  LysR substrate binding domain protein  30.67 
 
 		 299 aa  89.7  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.103905 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6393  LysR family transcriptional regulator  53.41 
 
 		 297 aa  89.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2097  transcriptional regulator, LysR family  29.74 
 
 		 302 aa  89.7  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2025  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 293 aa  89.7  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.639957  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1962  LysR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 315 aa  89.4  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.133874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3354  LysR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 302 aa  88.6  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.910894  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3702  als operon regulatory protein AlsR, putative  32.83 
 
 		 301 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3457  als operon regulatory protein AlsR  32.83 
 
 		 301 aa  88.6  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.943458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3423  LysR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 301 aa  88.6  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.141428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3374  LysR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 301 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.08343  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1778  hydrogen peroxide-inducible genes activator  31.61 
 
 		 296 aa  88.2  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1779  hydrogen peroxide-inducible genes activator  31.61 
 
 		 296 aa  88.6  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1400  LysR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 303 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3685  putative als operon regulatory protein AlsR  32.83 
 
 		 301 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2265  transcriptional regulator, LysR family  30.63 
 
 		 321 aa  88.6  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3729  als operon regulatory protein AlsR  32.83 
 
 		 301 aa  88.6  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4972  transcriptional regulator, LysR family  35 
 
 		 296 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3709  putative als operon regulatory protein AlsR  32.83 
 
 		 301 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.510407  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1538  transcriptional regulator, LysR family  32.83 
 
 		 299 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0429395 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0484  LysR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 186 aa  88.6  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.311838  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6244  transcriptional regulator, LysR family  35 
 
 		 296 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.235646  normal  0.352956 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>