47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0571 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0571  hypothetical protein  100 
 
 
299 aa  613  9.999999999999999e-175  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0897117  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0920  hypothetical protein  56.95 
 
 
295 aa  340  1e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0220945  hitchhiker  0.000000000622111 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0581  protein of unknown function DUF201  58.64 
 
 
295 aa  340  2e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0946746  normal  0.163854 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1384  hypothetical protein  56.51 
 
 
295 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0268  ornithine carbamoyltransferase  52.15 
 
 
301 aa  302  6.000000000000001e-81  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.313188 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3436  hypothetical protein  36.11 
 
 
319 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0385752 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1315  hypothetical protein  35.11 
 
 
307 aa  171  1e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1641  hypothetical protein  33.88 
 
 
299 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0448  hypothetical protein  34.69 
 
 
311 aa  127  3e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00145655  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1043  hypothetical protein  29.24 
 
 
302 aa  99.8  5e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1583  hypothetical protein  29.23 
 
 
302 aa  92.8  7e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0329  hypothetical protein  28.87 
 
 
302 aa  90.1  4e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3069  protein of unknown function DUF201  29.69 
 
 
330 aa  89  9e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1440  hypothetical protein  28.17 
 
 
302 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.357308  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3138  hypothetical protein  28.47 
 
 
343 aa  80.1  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1278  hypothetical protein  26.89 
 
 
357 aa  77.4  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.422818  normal  0.140099 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5936  hypothetical protein  25.09 
 
 
350 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.400754  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2621  hypothetical protein  28.8 
 
 
319 aa  72.4  0.000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.24085  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2798  hypothetical protein  26.46 
 
 
366 aa  71.6  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.105487 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0457  hypothetical protein  25.89 
 
 
357 aa  70.5  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.764291  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2868  hypothetical protein  25.79 
 
 
330 aa  68.6  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.430946  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2459  hypothetical protein  25.09 
 
 
351 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.243354 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1790  hypothetical protein  28.89 
 
 
318 aa  59.3  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.269411  normal  0.659808 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0257  hypothetical protein  27.73 
 
 
346 aa  58.2  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6502  hypothetical protein  25.08 
 
 
357 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.868447  normal  0.0200511 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2010  protein of unknown function DUF201  30.56 
 
 
360 aa  55.5  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal  0.206685 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1666  hypothetical protein  29.26 
 
 
355 aa  53.5  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2122  argininosuccinate lyase  23.29 
 
 
894 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3192  argininosuccinate lyase  23.11 
 
 
924 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655648  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1032  hypothetical protein  28.22 
 
 
353 aa  50.4  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1620  argininosuccinate lyase  23.08 
 
 
896 aa  50.4  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1396  argininosuccinate lyase  22.91 
 
 
926 aa  50.1  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1523  hypothetical protein  26.77 
 
 
357 aa  49.7  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1650  hypothetical protein  25.31 
 
 
299 aa  48.9  0.00009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00343352  normal  0.111404 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2560  argininosuccinate lyase  22.51 
 
 
904 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2646  argininosuccinate lyase  22.94 
 
 
904 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2507  argininosuccinate lyase  22.75 
 
 
912 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2386  protein of unknown function DUF201  30.67 
 
 
381 aa  48.1  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1687  S6 modification enzyme RimK  26.94 
 
 
310 aa  47  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1971  argininosuccinate lyase  21.33 
 
 
891 aa  46.6  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1032  hypothetical protein  22.81 
 
 
349 aa  46.2  0.0006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.945584  normal  0.0182247 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0283  protein of unknown function DUF201  24.89 
 
 
360 aa  43.5  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2002  argininosuccinate lyase  23.48 
 
 
900 aa  42.7  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.848902  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1105  S6 modification enzyme RimK  22.96 
 
 
262 aa  42.7  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.352091  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2158  argininosuccinate lyase  23.48 
 
 
914 aa  42.7  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2526  glutathione synthase/ribosomal protein S6 modification glutaminyl transferase  23.76 
 
 
528 aa  42.7  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000161005  normal  0.270973 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2022  argininosuccinate lyase  23.48 
 
 
900 aa  42.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10658  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>