More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4722 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_1191  amino acid permease-associated region  67.63 
 
 
499 aa  643    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6322  amino acid permease-associated region  68.23 
 
 
503 aa  640    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393049  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1368  amino acid permease-associated region  85.57 
 
 
490 aa  711    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21440  amino acid transporter  66.13 
 
 
512 aa  640    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.250254 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1332  amino acid permease-associated region  85.57 
 
 
490 aa  711    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.454402  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13282  cationic amino acid transport integral membrane protein  72.86 
 
 
495 aa  664    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.260226 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3641  amino acid permease-associated region  68.29 
 
 
513 aa  636    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1349  amino acid permease-associated region  85.57 
 
 
490 aa  711    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.923637  normal  0.933063 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4722  amino acid permease-associated region  100 
 
 
503 aa  992    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.699782 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1740  amino acid permease-associated region  90.45 
 
 
493 aa  803    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.327226  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4115  amino acid permease-associated region  66.46 
 
 
516 aa  634  1e-180  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4360  amino acid permease-associated region  63.66 
 
 
686 aa  568  1e-161  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0120164  normal  0.0594951 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4164  amino acid permease-associated region  65.45 
 
 
537 aa  565  1e-160  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.696427  normal  0.49431 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2785  amino acid permease-associated region  55.33 
 
 
520 aa  539  9.999999999999999e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0177971 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3085  amino acid permease-associated region  53.82 
 
 
515 aa  535  1e-151  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2714  amino acid permease-associated region  57.54 
 
 
521 aa  526  1e-148  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101766  normal  0.124746 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0130  amino acid permease-associated region  56.52 
 
 
515 aa  522  1e-147  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.389745  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  56.76 
 
 
489 aa  519  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  58.7 
 
 
500 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2011  putative cationic amino acid transporter  56.69 
 
 
500 aa  478  1e-133  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2857  amino acid permease-associated region  56.02 
 
 
504 aa  476  1e-133  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1683  amino acid transporter  52.66 
 
 
508 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000204712  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0241  amino acid permease  53.54 
 
 
543 aa  471  1.0000000000000001e-131  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1758  amino acid permease-associated region  56.56 
 
 
495 aa  465  9.999999999999999e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120604  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2269  amino acid permease-associated region  54.1 
 
 
492 aa  460  9.999999999999999e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.841553  normal  0.0284439 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2013  amino acid permease-associated region  56.73 
 
 
501 aa  455  1e-127  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1815  amino acid permease-associated region  55.1 
 
 
491 aa  457  1e-127  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4179  amino acid permease-associated region  53.28 
 
 
517 aa  452  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.27139 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2114  amino acid permease-associated region  48.55 
 
 
485 aa  418  9.999999999999999e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.590902  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1720  amino acid permease-associated region  47.09 
 
 
471 aa  409  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0831  amino acid permease-associated region  47.73 
 
 
476 aa  404  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  42.6 
 
 
490 aa  396  1e-109  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  44.69 
 
 
476 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  41.95 
 
 
496 aa  388  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  41.95 
 
 
496 aa  388  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  44.42 
 
 
495 aa  385  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  43.47 
 
 
467 aa  382  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  43.27 
 
 
467 aa  383  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  43.67 
 
 
467 aa  384  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  43.47 
 
 
467 aa  383  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  43.27 
 
 
467 aa  383  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  43.27 
 
 
467 aa  383  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  45.05 
 
 
466 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  45.05 
 
 
466 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  44.44 
 
 
476 aa  382  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  43.65 
 
 
467 aa  381  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  43.27 
 
 
467 aa  380  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  44.56 
 
 
468 aa  380  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  44.58 
 
 
476 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  44.96 
 
 
466 aa  380  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  44.35 
 
 
468 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  43.51 
 
 
463 aa  375  1e-103  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  43.51 
 
 
463 aa  376  1e-103  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  44.25 
 
 
468 aa  378  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  43.4 
 
 
494 aa  378  1e-103  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  42.86 
 
 
467 aa  376  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  44.25 
 
 
468 aa  378  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  42.89 
 
 
467 aa  375  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4969  amino acid permease-associated region  42.91 
 
 
496 aa  375  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0923  amino acid permease  43.94 
 
 
495 aa  372  1e-102  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3677  amino acid permease-associated region  44.36 
 
 
482 aa  375  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  42.42 
 
 
471 aa  370  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  42.42 
 
 
471 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  42.42 
 
 
471 aa  370  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  42.63 
 
 
471 aa  370  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  42.63 
 
 
471 aa  371  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  42.42 
 
 
471 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  42.42 
 
 
471 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1000  amino acid permease-associated region  41.65 
 
 
566 aa  370  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0424  amino acid permease  44.67 
 
 
467 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386355  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  41.85 
 
 
469 aa  365  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0242  amino acid permease  44.67 
 
 
467 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557003  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0230  amino acid permease  44.67 
 
 
467 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145417  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  41.82 
 
 
471 aa  365  1e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0096  amino acid permease-associated region  45.14 
 
 
466 aa  365  1e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3289  amino acid permease  44.47 
 
 
467 aa  363  3e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.549076  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2134  amino acid permease  44.47 
 
 
467 aa  363  3e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3392  amino acid permease  44.47 
 
 
467 aa  363  3e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2954  amino acid permease  44.47 
 
 
467 aa  363  3e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  41.82 
 
 
471 aa  362  6e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2749  amino acid permease-associated region  42.89 
 
 
481 aa  363  6e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  normal  0.633141 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  42.53 
 
 
471 aa  361  1e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  43.29 
 
 
471 aa  362  1e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  43.29 
 
 
471 aa  362  1e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0651  amino acid permease-associated region  46.23 
 
 
481 aa  362  1e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0208  amino acid permease  44.27 
 
 
467 aa  361  2e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  42.36 
 
 
465 aa  360  3e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  40.94 
 
 
506 aa  360  4e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  41.76 
 
 
486 aa  359  6e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  42.22 
 
 
465 aa  359  8e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4174  amino acid permease-associated region  43.66 
 
 
478 aa  358  8e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  0.28467 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  43.38 
 
 
471 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  43.38 
 
 
471 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3581  amino acid transport protein  42.57 
 
 
480 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0683236  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1609  amino acid permease-associated region  42.94 
 
 
495 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5170  amino acid permease-associated region  40.31 
 
 
502 aa  356  5e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.892102 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1651  amino acid permease-associated region  42.01 
 
 
501 aa  354  2e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  43.06 
 
 
460 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3597  amino acid permease-associated region  40.12 
 
 
549 aa  353  2.9999999999999997e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.333154 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6715  amino acid permease-associated region  45.51 
 
 
486 aa  352  7e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166608  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>