More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4047 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_2057  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  82.66 
 
 
398 aa  652    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.177628  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2074  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  82.66 
 
 
398 aa  652    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376766  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2120  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  82.66 
 
 
398 aa  652    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0228819 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2305  uroporphyrin-III C-methyltransferase  88.75 
 
 
402 aa  681    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193462  normal  0.130764 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4047  uroporphyrin-III C-methyltransferase  100 
 
 
403 aa  785    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12862  multi-functional enzyme siroheme synthase cysG: uroporphyrin-III C-methyltransferase + precorrin-2 oxidase + ferrochelatase  81.86 
 
 
405 aa  624  1e-178  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000225219  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1703  uroporphyrin-III C-methyltransferase  64.14 
 
 
411 aa  477  1e-133  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2143  uroporphyrin-III C-methyltransferase  63.71 
 
 
413 aa  437  1e-121  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.32611  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5854  uroporphyrin-III C-methyltransferase  62.5 
 
 
405 aa  425  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.148412  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7364  siroheme synthase  56.75 
 
 
410 aa  411  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0139888  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2321  uroporphyrin-III C-methyltransferase  57.68 
 
 
405 aa  402  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22640  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  61.03 
 
 
414 aa  394  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1323  uroporphyrin-III C-methyltransferase  59.02 
 
 
448 aa  375  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153793  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2600  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  55.19 
 
 
407 aa  376  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.177036  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2221  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  55.67 
 
 
426 aa  371  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2561  uroporphyrin-III C-methyltransferase  57.62 
 
 
410 aa  367  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.945162  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4663  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.81 
 
 
394 aa  362  8e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.607311  hitchhiker  0.00373911 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0536  uroporphyrin-III C-methyltransferase  55.7 
 
 
419 aa  361  1e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.865143  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3920  uroporphyrin-III C-methyltransferase  55.34 
 
 
419 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.797973  normal  0.18472 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3431  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.63 
 
 
426 aa  332  5e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.447049  normal  0.196927 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3545  uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.88 
 
 
417 aa  326  5e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1734  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.73 
 
 
406 aa  288  1e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0333412  normal  0.124511 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10020  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  45.36 
 
 
422 aa  270  2e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0127568  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3111  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  46.23 
 
 
418 aa  269  8e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2812  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.73 
 
 
420 aa  266  2.9999999999999995e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00743993 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1616  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  46.28 
 
 
475 aa  266  4e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.512799  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1326  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.72 
 
 
421 aa  258  1e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0751578  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17730  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  54.85 
 
 
329 aa  251  2e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.243259  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32840  siroheme synthase, N-terminal domain protein  39.56 
 
 
490 aa  249  5e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.703694  normal  0.335856 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0796  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  55.83 
 
 
276 aa  243  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5796  uroporphyrin-III C-methyltransferase  55.56 
 
 
271 aa  233  4.0000000000000004e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.991425  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0658  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.81 
 
 
447 aa  233  5e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.244252 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2797  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.27 
 
 
403 aa  232  8.000000000000001e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334066  decreased coverage  0.000494849 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2248  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.74 
 
 
416 aa  232  1e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000210375  normal  0.280858 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0528  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  57.02 
 
 
508 aa  224  2e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.216012 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2517  uroporphyrin-III C-methyltransferase  59.09 
 
 
553 aa  223  4.9999999999999996e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.459561  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1124  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.85 
 
 
491 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.219261  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1125  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase, uroporphyrinogen-III synthase  46.03 
 
 
516 aa  220  3e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.325525 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3353  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.23 
 
 
504 aa  219  7.999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422788  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0162  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40 
 
 
385 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6102  uroporphyrin-III C-methyltransferase  56.17 
 
 
570 aa  217  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.229547  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0687  hypothetical protein  45.96 
 
 
505 aa  217  2.9999999999999998e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.943133  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2162  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.84 
 
 
512 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000123773  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1248  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  49.58 
 
 
520 aa  212  1e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.472521 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2699  uroporphyrin-III C-methyltransferase  59.92 
 
 
550 aa  211  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2804  hitchhiker  0.000140912 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0701  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.57 
 
 
504 aa  211  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3581  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  34.55 
 
 
464 aa  210  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249196  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00850  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.86 
 
 
340 aa  210  3e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.580236 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1744  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.06 
 
 
263 aa  209  5e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4048  siroheme synthase  31.56 
 
 
459 aa  209  1e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2313  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.15 
 
 
502 aa  208  1e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3863  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.3 
 
 
258 aa  208  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.707668  hitchhiker  0.0000644403 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1252  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.96 
 
 
505 aa  207  3e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3201  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.06 
 
 
519 aa  206  4e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1774  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.3 
 
 
426 aa  206  6e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.254822  normal  0.025791 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1349  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.88 
 
 
258 aa  206  9e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.758533  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3062  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.19 
 
 
512 aa  205  1e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00105684  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1346  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.61 
 
 
511 aa  205  1e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.694338  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0652  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  33.33 
 
 
493 aa  205  1e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3871  siroheme synthase  31.32 
 
 
459 aa  205  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1587  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.46 
 
 
258 aa  205  1e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00363233  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03219  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase/uroporphyrinogen methyltransferase  31.08 
 
 
457 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0344  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.08 
 
 
457 aa  204  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1549  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.46 
 
 
258 aa  204  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1335  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.46 
 
 
258 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1308  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.46 
 
 
258 aa  204  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3650  siroheme synthase  31.08 
 
 
457 aa  204  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000355794 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1445  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.46 
 
 
258 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.51628  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0344  siroheme synthase  31.08 
 
 
457 aa  204  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.898093 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1977  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  48.5 
 
 
513 aa  204  2e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0017868  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3838  siroheme synthase  31.08 
 
 
457 aa  204  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1668  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.48 
 
 
271 aa  204  2e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.228653  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1517  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.46 
 
 
258 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.58633e-17 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03171  hypothetical protein  31.08 
 
 
457 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3564  siroheme synthase  31.08 
 
 
457 aa  204  2e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1309  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.46 
 
 
258 aa  203  4e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2200  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.19 
 
 
261 aa  203  4e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0396322  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1481  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.19 
 
 
258 aa  203  5e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3744  siroheme synthase  30.86 
 
 
457 aa  202  6e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4679  siroheme synthase  30.86 
 
 
457 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.839222 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1679  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  33.41 
 
 
481 aa  201  9.999999999999999e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0984  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.07 
 
 
245 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.084748  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0581  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.77 
 
 
264 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1258  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.9 
 
 
508 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.323904  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2173  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  32.44 
 
 
489 aa  200  3e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3344  siroheme synthase  33.78 
 
 
464 aa  200  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00903193  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3719  siroheme synthase  31.24 
 
 
470 aa  200  5e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.411824  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3796  siroheme synthase  32.2 
 
 
457 aa  199  9e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.01671 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3675  siroheme synthase  31.69 
 
 
459 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3959  siroheme synthase  31.03 
 
 
473 aa  198  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0252  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.55 
 
 
511 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0232  siroheme synthase  31.03 
 
 
473 aa  198  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3749  siroheme synthase  31.69 
 
 
457 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.848215 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3784  siroheme synthase  31.46 
 
 
457 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1724  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.22 
 
 
250 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3846  siroheme synthase  31.31 
 
 
457 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.130759  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3675  siroheme synthase  31.69 
 
 
457 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3235  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  46.55 
 
 
513 aa  197  3e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0761379  normal  0.140873 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03694  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.85 
 
 
479 aa  197  3e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1148  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.04 
 
 
258 aa  197  3e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.660594  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>