More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3319 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3319  glutamine synthetase, catalytic region  100 
 
 		 453 aa  899    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.537812  normal  0.0587304 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2784  glutamine synthetase, catalytic region  73.97 
 
 		 450 aa  632  1e-180  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2754  glutamine synthetase, catalytic region  73.74 
 
 		 450 aa  631  1e-180  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2798  glutamine synthetase, catalytic region  73.74 
 
 		 450 aa  631  1e-180  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.726045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11906  glutamine synthetase glnA3  66.67 
 
 		 450 aa  559  1e-158  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0233  glutamine synthetase, catalytic region  48.63 
 
 		 437 aa  403  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0719706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0243  glutamine synthetase, catalytic region  48.63 
 
 		 437 aa  403  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.680627 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0223  glutamine synthetase, catalytic region  48.4 
 
 		 437 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395034  normal  0.155489 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2920  glutamine synthetase, catalytic region  47.05 
 
 		 442 aa  395  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0328633 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0173  glutamine synthetase catalytic region  48.4 
 
 		 452 aa  352  5.9999999999999994e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6502  glutamine synthetase catalytic region  37.71 
 
 		 496 aa  250  5e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.415769  normal  0.198271 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1967  glutamine synthetase catalytic region  38.55 
 
 		 455 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.333902  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0315  L-glutamine synthetase  34.85 
 
 		 525 aa  203  6e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.432555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5786  glutamine synthetase catalytic region  36.51 
 
 		 442 aa  202  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6309  putative glutamine synthetase  33.33 
 
 		 443 aa  170  5e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542991  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0201  glutamine synthetase catalytic region  29.51 
 
 		 448 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0281454  normal  0.125698 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2916  glutamate-ammonia ligase  31.85 
 
 		 469 aa  168  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.20359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72690  putative glutamine synthetase  32.32 
 
 		 443 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0153069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4491  glutamine synthetase catalytic region  31.13 
 
 		 444 aa  160  4e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0411429  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4681  L-glutamine synthetase  27.97 
 
 		 451 aa  159  7e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.455375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  33.53 
 
 		 445 aa  153  7e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13430  L-glutamine synthetase  33.23 
 
 		 446 aa  152  8e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0720784  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  29.03 
 
 		 445 aa  152  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3286  hypothetical protein  31.36 
 
 		 441 aa  150  5e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0169038 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0909  glutamine synthetase catalytic region  32.93 
 
 		 447 aa  149  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1592  L-glutamine synthetase  31.18 
 
 		 446 aa  147  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0667119  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3584  glutamine synthetase, type I  32.16 
 
 		 451 aa  147  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2389  glutamine synthetase, type I  29.62 
 
 		 448 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000201555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  28.86 
 
 		 443 aa  146  9e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3339  glutamine synthetase, type I  32.16 
 
 		 451 aa  145  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.301848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0150  glutamine synthetase, type I  27.18 
 
 		 448 aa  144  2e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.991128  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1591  glutamine synthetase, type I  31.18 
 
 		 446 aa  143  5e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000014184 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3731  glutamine synthetase, type I  29.82 
 
 		 444 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  29.46 
 
 		 444 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2270  L-glutamine synthetase  28.83 
 
 		 440 aa  142  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.327087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1487  glutamine synthetase, type I  30 
 
 		 444 aa  142  1.9999999999999998e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  29.46 
 
 		 444 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21290  glutamine synthetase, type I  27.3 
 
 		 441 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0204015  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0876  glutamine synthetase FemC  29.17 
 
 		 446 aa  140  3e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3549  glutamine synthetase, type I  29.52 
 
 		 444 aa  141  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3449  glutamine synthetase, type I  29.52 
 
 		 444 aa  141  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3462  glutamate--ammonia ligase (glutamine synthetase, type I)  29.52 
 
 		 444 aa  141  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3833  glutamine synthetase, type I  29.52 
 
 		 444 aa  141  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3754  glutamine synthetase, type I  29.52 
 
 		 444 aa  141  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149768  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1497  glutamine synthetase, type I  32.02 
 
 		 446 aa  141  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.293618  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3713  glutamine synthetase, type I  29.52 
 
 		 444 aa  141  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53476e-18 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2027  glutamine synthetase, type I  28.41 
 
 		 443 aa  139  8.999999999999999e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.123659  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1849  glutamine synthetase, type I  30.03 
 
 		 445 aa  139  8.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1799  glutamine synthetase, type I  27.39 
 
 		 439 aa  139  1e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.743478  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15270  L-glutamine synthetase  29.52 
 
 		 444 aa  139  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1368  glutamine synthetase, type I  28.57 
 
 		 446 aa  138  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0431284  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1394  glutamine synthetase, type I  28.57 
 
 		 446 aa  138  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.180794  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2909  glutamine synthetase, type I  32.93 
 
 		 446 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.113408  normal  0.593319 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2562  L-glutamine synthetase  27.33 
 
 		 452 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.803813 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3469  glutamine synthetase, type I  29.52 
 
 		 444 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00616587  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1125  L-glutamine synthetase  28.22 
 
 		 443 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0811977  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04819  Protein fluG [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P38094]  28.98 
 
 		 865 aa  137  4e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385753  normal  0.68223 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2381  glutamine synthetase, type I  28.57 
 
 		 444 aa  137  4e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2057  glutamine synthetase, catalytic region  29.7 
 
 		 443 aa  137  5e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12210  L-glutamine synthetase  30.63 
 
 		 446 aa  137  5e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000380356  normal  0.117276 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2046  L-glutamine synthetase  29.08 
 
 		 455 aa  136  6.0000000000000005e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.480104  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1502  glutamine synthetase, type I  28.92 
 
 		 444 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0398754 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3803  glutamine synthetase, type I  28.92 
 
 		 444 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3598  glutamine synthetase, type I  32.02 
 
 		 446 aa  136  7.000000000000001e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998418 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0666  L-glutamine synthetase  26.61 
 
 		 447 aa  136  9e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.57633 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  28.12 
 
 		 444 aa  135  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12251  glutamine synthetase glnA2  31.33 
 
 		 446 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  28.57 
 
 		 443 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0634  glutamine synthetase, type I  28.75 
 
 		 444 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.144254  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07430  L-glutamine synthetase  30.51 
 
 		 447 aa  135  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0104  L-glutamine synthetase  27.36 
 
 		 449 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3089  glutamine synthetase catalytic region  30.84 
 
 		 450 aa  135  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.110281  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3339  L-glutamine synthetase  32.02 
 
 		 446 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0399179  normal  0.158604 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3328  L-glutamine synthetase  32.02 
 
 		 446 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.954484  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2119  glutamine synthetase, type I  29.25 
 
 		 445 aa  134  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3390  L-glutamine synthetase  32.02 
 
 		 446 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.155742 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1204  glutamine synthetase, type I  30.12 
 
 		 452 aa  134  5e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00014918  normal  0.349834 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3760  glutamine synthetase, type I  27.56 
 
 		 443 aa  133  6e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000185172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0919  L-glutamine synthetase  29.74 
 
 		 453 aa  133  6e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1047  glutamine synthetase, type I  32.94 
 
 		 444 aa  133  6.999999999999999e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3106  glutamine synthetase, type I  29.97 
 
 		 453 aa  133  7.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000021484  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1837  glutamine synthetase, type I  26.61 
 
 		 439 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2047  glutamine synthetase, type I  29.25 
 
 		 445 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.945821  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4242  glutamine synthetase, type I  27.27 
 
 		 446 aa  132  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.348488  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3296  glutamine synthetase, type I  29.85 
 
 		 447 aa  132  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.405518  normal  0.0478634 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  28.02 
 
 		 444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0770  glutamine synthetase, type I  26.81 
 
 		 450 aa  132  1.0000000000000001e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127283 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2273  glutamine synthetase, type I  26.55 
 
 		 443 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2819  glutamine synthetase, type I  29.18 
 
 		 448 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19880  L-glutamine synthetase  30.24 
 
 		 444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2099  glutamine synthetase, type I  27.74 
 
 		 447 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2490  glutamine synthetase, type I  30.72 
 
 		 446 aa  131  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.137457 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_941  glutamine synthetase, type I  28.53 
 
 		 443 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1764  L-glutamine synthetase  28.69 
 
 		 442 aa  132  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0384  L-glutamine synthetase  27.3 
 
 		 446 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.882152  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0952  L-glutamine synthetase  26.8 
 
 		 447 aa  131  2.0000000000000002e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.434592  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1466  glutamine synthetase, type I  26.77 
 
 		 446 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2806  glutamine synthetase, type I  28.09 
 
 		 449 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3479  glutamine synthetase, type I  32.74 
 
 		 444 aa  132  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0194091  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1766  glutamine synthetase catalytic region  30.18 
 
 		 452 aa  131  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.725397  decreased coverage  0.000162709 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>