47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3180 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3180  cadmium resistance transporter  100 
 
 		 197 aa  376  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00474254  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0350  cadmium resistance transporter  80.71 
 
 		 199 aa  299  2e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2868  cadmium resistance transporter  84.42 
 
 		 201 aa  296  1e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3642  cadmium resistance transporter  85.5 
 
 		 202 aa  294  6e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3241  cadmium resistance transporter  86.8 
 
 		 199 aa  293  1e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5745  cadmium resistance transporter  84.26 
 
 		 199 aa  289  2e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25690  predicted permease, cadmium resistance protein  79.29 
 
 		 200 aa  269  2e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0610  cadmium resistance transporter  99.28 
 
 		 139 aa  268  5e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20660  predicted permease, cadmium resistance protein  78.79 
 
 		 200 aa  267  5.9999999999999995e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25750  predicted permease, cadmium resistance protein  73.33 
 
 		 198 aa  258  4e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2205  cadmium resistance transporter  72.45 
 
 		 198 aa  238  2.9999999999999997e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2659  cadmium resistance transporter  70.41 
 
 		 196 aa  231  5e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4661  quaternary amine transporter  55.33 
 
 		 198 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0897553 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5227  cadmium resistance transporter  47.47 
 
 		 218 aa  131  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.580258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4479  cadmium resistance transporter  39.55 
 
 		 199 aa  121  5e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4310  cadmium resistance transporter  39.55 
 
 		 199 aa  121  5e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0103075  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4210  cadmium resistance transporter  39.55 
 
 		 199 aa  121  5e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3211  permease cadmium resistance protein-like protein  45.1 
 
 		 255 aa  119  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0284266  normal  0.131465 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2848  cadmium resistance transporter  39.9 
 
 		 212 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.551645 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0853  cadmium resistance transporter  40 
 
 		 199 aa  109  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0607  hypothetical protein  100 
 
 		 79 aa  101  7e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2457  cadmium resistance transporter  32.35 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000531137  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2696  putative transport protein  31.86 
 
 		 208 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000223261 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0347  cadmium resistance transporter  35.75 
 
 		 211 aa  96.3  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2849  cadmium resistance transporter  34.5 
 
 		 238 aa  95.5  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2866  cadmium resistance transporter  36.46 
 
 		 249 aa  89.4  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000609266  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0184  cadmium resistance transporter, putative  37.76 
 
 		 189 aa  89.4  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5023  cadmium resistance transporter  31.86 
 
 		 250 aa  85.1  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257452  normal  0.407908 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1438  cadmium resistance transporter CadD  29.29 
 
 		 204 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799585  normal  0.500244 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4400  cadmium resistance transporter  30.39 
 
 		 214 aa  83.2  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0699  cadmium resistance transporter, CadD family  33.68 
 
 		 201 aa  82.8  0.000000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000313403  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4404  cadmium resistance transporter  34.18 
 
 		 232 aa  81.3  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1370  cadmium resistance family protein  30.85 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.128389  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1265  cadmium resistance transporter, putative  30.73 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00419797  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2497  quaternary ammonium compound-resistance protein, C-terminal  34.25 
 
 		 151 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000463679  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2796  cadmium resistance transporter CadD  32.65 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2753  cadmium resistance transporter CadD  32.65 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0956067  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5025  cadmium resistance transporter  30.73 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0241386  normal  0.862178 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4467  cadmium resistance transporter  34.04 
 
 		 232 aa  79  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000272706  normal  0.331556 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2221  cadmium resistance family protein  29.08 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.242988  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4473  cadmium resistance transporter  29.11 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.879748 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4410  cadmium resistance transporter  29.11 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4463  cadmium resistance transporter  29.83 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00350576  normal  0.203926 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4997  cadmium resistance transporter  28.1 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000622218  normal  0.209664 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4909  cadmium resistance transporter  36.14 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4076  cadmium transporter  27.01 
 
 		 198 aa  48.9  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.999785  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4068  cadmium transporter  28.95 
 
 		 202 aa  45.1  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0446991  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>