More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1911 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1911  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  100 
 
 
294 aa  585  1e-166  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.195634 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4822  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  77.13 
 
 
294 aa  435  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.429733  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2631  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  58.42 
 
 
298 aa  293  2e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2586  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding protein  58.42 
 
 
298 aa  293  2e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5793  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  45.14 
 
 
307 aa  243  3e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.056485  normal  0.139483 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2971  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  49.31 
 
 
301 aa  235  6e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0972  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  43.66 
 
 
303 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.312001  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2130  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  40.96 
 
 
302 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.424924  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1431  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  38.28 
 
 
297 aa  182  4.0000000000000006e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1214  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  38.83 
 
 
303 aa  179  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.765092  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4289  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  42.5 
 
 
286 aa  179  4e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.318133 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7141  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  40.28 
 
 
303 aa  178  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1631  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  42.76 
 
 
300 aa  173  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.586989 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0495  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  35.96 
 
 
295 aa  159  4e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2161  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  32.29 
 
 
299 aa  154  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00387864 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4931  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  34.36 
 
 
293 aa  150  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.684033  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3250  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  41.9 
 
 
301 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18140  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  36.43 
 
 
298 aa  145  6e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3409  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  39.53 
 
 
303 aa  145  8.000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1173  tartronate semialdehyde reductase  32.3 
 
 
296 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5958  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  33.33 
 
 
293 aa  144  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.564119  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1575  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  35.96 
 
 
298 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.880265  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22120  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  34.38 
 
 
296 aa  143  3e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.218091 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0632  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  34.34 
 
 
319 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1985  putative hydroxyacid dehydrogenase/reductase  35.17 
 
 
298 aa  138  8.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.300196  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2525  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  34.15 
 
 
295 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927103  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4985  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  32.52 
 
 
289 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.888648  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5012  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  33.33 
 
 
290 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.210845  normal  0.196211 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2614  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  35.8 
 
 
300 aa  135  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5795  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  34.56 
 
 
295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305339  normal  0.101691 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1453  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  37.76 
 
 
296 aa  134  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0261  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  31.08 
 
 
305 aa  132  5e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0646517 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1923  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  31.72 
 
 
296 aa  132  5e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000238794  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01512  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  32.53 
 
 
291 aa  132  6e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4826  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  36.33 
 
 
294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.263062 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0223  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  34.14 
 
 
296 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.681241  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2007  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase family protein  30.99 
 
 
287 aa  129  5.0000000000000004e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9609  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  30.42 
 
 
288 aa  129  5.0000000000000004e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0297  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  30.98 
 
 
309 aa  129  5.0000000000000004e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3485  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  30.1 
 
 
293 aa  129  7.000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.575249 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2369  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  33.9 
 
 
292 aa  129  8.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3005  putative 2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  32.08 
 
 
296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.328852 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2156  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  31.23 
 
 
299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.501348 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0974  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  32.76 
 
 
296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.362107  normal  0.788832 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0422  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  32.77 
 
 
313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2567  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  36.14 
 
 
287 aa  127  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92537  normal  0.159753 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0514  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  32.75 
 
 
304 aa  127  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.810346  normal  0.372685 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5629  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  32.64 
 
 
290 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.865293  normal  0.0329981 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1447  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  33.56 
 
 
288 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.343772  normal  0.123255 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2846  putative 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  33.56 
 
 
296 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48395  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1062  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  32.99 
 
 
290 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3900  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  33.22 
 
 
289 aa  126  4.0000000000000003e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1078  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  32.99 
 
 
290 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0733755 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3089  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  33.22 
 
 
297 aa  125  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01903  putative oxidoreductase  32.29 
 
 
291 aa  125  9e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5648  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  32.3 
 
 
290 aa  125  9e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.390544 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02990  tartronate semialdehyde reductase  30.38 
 
 
296 aa  125  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0580  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  30.38 
 
 
296 aa  125  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02941  hypothetical protein  30.38 
 
 
296 aa  125  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0127  hypothetical protein  30.24 
 
 
298 aa  125  1e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2189  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  34.24 
 
 
314 aa  124  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.276186 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0575  tartronate semialdehyde reductase  30.38 
 
 
296 aa  125  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4656  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  32.3 
 
 
290 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.990326  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3712  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  32.3 
 
 
290 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0647  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  32.99 
 
 
296 aa  124  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.020642  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1089  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  32.29 
 
 
290 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0903415  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2771  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  30.66 
 
 
291 aa  124  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3603  tartronate semialdehyde reductase  30.45 
 
 
294 aa  124  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3343  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  30.48 
 
 
303 aa  124  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2319  putative 2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  31.67 
 
 
296 aa  124  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5498  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  34.64 
 
 
291 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0926622  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1764  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  30.45 
 
 
291 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.113165  normal  0.438738 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3233  tartronate semialdehyde reductase  30.45 
 
 
294 aa  124  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4459  NADP oxidoreductase  31.85 
 
 
291 aa  124  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00439637  normal  0.0523521 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1721  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  30.45 
 
 
291 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00783731  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4437  tartronate semialdehyde reductase  30.45 
 
 
294 aa  124  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.211957 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3314  tartronate semialdehyde reductase  30.45 
 
 
294 aa  124  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3420  tartronate semialdehyde reductase  30.45 
 
 
294 aa  124  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1065  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  32.63 
 
 
303 aa  124  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.319992 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2775  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  32.39 
 
 
288 aa  123  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0544737  normal  0.212315 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0142  hypothetical protein  29.9 
 
 
298 aa  123  4e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0704  putative 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  32.62 
 
 
305 aa  123  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.205033  normal  0.229354 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1308  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  32.06 
 
 
294 aa  123  4e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.258741  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3438  tartronate semialdehyde reductase  29.69 
 
 
296 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0274  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  32.16 
 
 
300 aa  122  5e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3441  tartronate semialdehyde reductase  29.69 
 
 
296 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3607  tartronate semialdehyde reductase  29.69 
 
 
296 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal  0.959534 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1917  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  29.25 
 
 
298 aa  123  5e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.036098  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3510  tartronate semialdehyde reductase  29.69 
 
 
296 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.900889  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3546  tartronate semialdehyde reductase  29.69 
 
 
296 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.370176  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5846  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  32.75 
 
 
290 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.704339  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0245  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  34.15 
 
 
298 aa  122  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3450  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  35.91 
 
 
307 aa  122  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1353  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  32.75 
 
 
290 aa  122  6e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.478456  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0958  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  30.95 
 
 
299 aa  122  6e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1101  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  35.25 
 
 
290 aa  122  7e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2197  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  33.86 
 
 
290 aa  122  7e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000206144  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2568  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  30.1 
 
 
291 aa  122  8e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.138617  hitchhiker  0.00176659 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1360  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  32.29 
 
 
290 aa  122  9e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.117709  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4815  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  32.38 
 
 
302 aa  122  9e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>