More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0118 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0118  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
334 aa  640    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.169242 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.97 
 
 
353 aa  369  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.762753  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1970  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.81 
 
 
339 aa  280  3e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.373061  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04000  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  44.65 
 
 
325 aa  222  9e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.125723  normal  0.103124 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0309  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  40.92 
 
 
329 aa  186  6e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3038  oligopeptide ABC transporter, permease  39.58 
 
 
340 aa  182  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.471376  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2554  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  30.28 
 
 
321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2257  oligopeptide ABC transporter, permease component  30.28 
 
 
321 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0196  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.38 
 
 
328 aa  172  5e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1001  oligopeptide ABC transporter, permease protein  28.16 
 
 
316 aa  171  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0808  oligopeptide ABC transporter, permease  27.85 
 
 
316 aa  171  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.282065  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4385  oligopeptide ABC transporter, permease protein  27.85 
 
 
316 aa  171  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.02052e-22 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.56 
 
 
322 aa  169  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0997  oligopeptide ABC transporter, permease protein  28.62 
 
 
316 aa  169  8e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.28482e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0946  oligopeptide ABC transporter, permease protein  27.53 
 
 
316 aa  169  8e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170303  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0804  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.85 
 
 
316 aa  168  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00583871  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0859  oligopeptide ABC transporter permease  27.85 
 
 
316 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0823  oligopeptide ABC transporter, permease  27.53 
 
 
316 aa  167  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.164685  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0909  oligopeptide ABC transporter permease protein  27.85 
 
 
316 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0836804  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2266  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.88 
 
 
320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2317  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.88 
 
 
320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.766968 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.94 
 
 
321 aa  163  4.0000000000000004e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.42 
 
 
319 aa  163  5.0000000000000005e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2014  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.37 
 
 
325 aa  158  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0408  peptide ABC transporter, permease protein  28.12 
 
 
319 aa  157  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.599742  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.37 
 
 
313 aa  157  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00112579 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.29 
 
 
325 aa  156  4e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1434  peptide ABC transporter, permease protein  31.68 
 
 
326 aa  155  8e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.393954  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0351  peptide ABC transporter, permease protein  28.12 
 
 
319 aa  155  8e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0394  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  27.7 
 
 
320 aa  155  1e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3067  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.67 
 
 
370 aa  154  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.998653  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2944  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.11 
 
 
329 aa  155  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1444  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.42 
 
 
323 aa  154  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1272  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.94 
 
 
332 aa  154  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.486831  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2202  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.2 
 
 
327 aa  154  2e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.238052  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.69 
 
 
314 aa  153  4e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.44 
 
 
321 aa  152  5.9999999999999996e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1197  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.19 
 
 
313 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1591  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.89 
 
 
326 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.75386 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0004  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  27.41 
 
 
320 aa  152  8e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.101832  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.5 
 
 
324 aa  151  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4795  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.17 
 
 
319 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.540957  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4683  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.51 
 
 
305 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2259  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.66 
 
 
320 aa  150  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000183272  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.53 
 
 
317 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189193  normal  0.0388452 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0942  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.6 
 
 
320 aa  150  4e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3168  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.65 
 
 
317 aa  149  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1411  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.03 
 
 
319 aa  150  4e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.03 
 
 
326 aa  149  4e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2946  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.69 
 
 
319 aa  149  5e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.981811  normal  0.0447006 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1235  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.69 
 
 
333 aa  149  5e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391976  normal  0.26803 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1012  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.78 
 
 
320 aa  149  5e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0445446  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0993  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.78 
 
 
320 aa  149  5e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4598  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.98 
 
 
319 aa  149  6e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.930375  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5082  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.56 
 
 
314 aa  149  7e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0845824 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5079  oligopeptide ABC transporter, permease protein  28.62 
 
 
318 aa  149  8e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823719  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0267  oligopeptide ABC transporter, permease protein  28.3 
 
 
318 aa  149  8e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4253  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.1 
 
 
336 aa  148  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.144815  normal  0.108193 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.67 
 
 
321 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0692911 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0246  oligopeptide ABC transporter, permease protein  28.62 
 
 
307 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0542782  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0384  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.67 
 
 
319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.512992 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.96 
 
 
334 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1126  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.96 
 
 
322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0398727  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3693  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.25 
 
 
333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1869  ABC-type transport system protein  30.41 
 
 
324 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3548  nickel ABC transporter permease  31.96 
 
 
322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00865819  normal  0.0646606 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0984  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.29 
 
 
313 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.422815  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1072  nickel ABC transporter, permease protein  31.96 
 
 
322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.494547  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16520  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  32.1 
 
 
321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.488375  normal  0.713064 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0776  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  30.06 
 
 
320 aa  148  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000429836  hitchhiker  0.000000000000473305 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6443  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.89 
 
 
317 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.738154  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6058  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.21 
 
 
317 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.11732  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6678  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.89 
 
 
317 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367401  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3257  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  29.39 
 
 
306 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4614  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.88 
 
 
311 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0206  oligopeptide ABC transporter, permease  27.97 
 
 
318 aa  146  5e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6176  ABC transporter, permease  33.33 
 
 
316 aa  146  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.619073 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3989  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.39 
 
 
306 aa  146  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0210  oligopeptide ABC transporter, permease  28.06 
 
 
318 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0232  oligopeptide ABC transporter permease protein  28.06 
 
 
318 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0202  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.67 
 
 
313 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.650812  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1251  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.76 
 
 
313 aa  145  7.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0714175 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0113  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.61 
 
 
320 aa  145  8.000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0617346  normal  0.17443 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0249  oligopeptide ABC transporter, permease protein  28.06 
 
 
318 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0219  oligopeptide ABC transporter permease  28.06 
 
 
307 aa  145  9e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1752  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.62 
 
 
306 aa  145  9e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0655426  normal  0.0792402 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0242  oligopeptide ABC transporter, permease protein  28.06 
 
 
307 aa  145  9e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0188  oligopeptide ABC transporter, permease protein  29.55 
 
 
325 aa  145  1e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3168  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.36 
 
 
315 aa  145  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.869489  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0059  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.96 
 
 
318 aa  145  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6355  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.21 
 
 
317 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0752  ABC transporter, permease  35.1 
 
 
320 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.40221  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2856  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.33 
 
 
322 aa  144  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.205475 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1617  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  31.25 
 
 
319 aa  144  2e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.109124  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.39 
 
 
306 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.819891  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6590  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.77 
 
 
318 aa  143  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.418553 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5663  ABC transporter membrane spanning protein  30.28 
 
 
318 aa  143  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.53 
 
 
319 aa  143  4e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.47 
 
 
336 aa  143  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290985  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5005  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.35 
 
 
316 aa  142  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.33692 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>